- Region 'REG00001200'
Cis-regulatory Region
Name
Cirobu.REG.KH2012.C6:649049-652750|RXFP3
Short name
RXFP3 3,7kb upstream
Region ID
REG00001200
Status
Curated
Origin
natural region from C. robusta formely Ciona int. type A
Type of Activity
regulatory_region
(extended_promoter)
Author
Philip Barron Abitua (2017-05-05)
Annotator
Marion Gueroult-Bellone (2017-05-05)
Curator
Delphine Dauga (2017-08-29)
649,049652,750
| Motif Name | Binding Factor(s) | Sequence | Position in Region | Comment |
|---|
Aniseed Coordinates: [649,049 / 652,750] on scaffold KhC6
The RXFP3 enhancer was amplified from Ciona intestinalis genomic DNA using the following primers (KH.C6.184; 59-CCGTGATTGTAATACGTATGAC-39 and 59-GCACAGTATTGTGTTATATACC-39); it drives expression in PPE ( proto-placodal ectoderm)- derived neurons.
Show sequence
Length: 3,702
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