Aniseed - Construct

Construct

ID

CONS00001132

Name

pSP.Cirobu.REG.KH2012.C5:4201966-4206944.Deleted_4204077-4203951:prCirobu.bpForkhead>Kaede

Min Promoter

pfkh

Reporter

pSP-Kaede

Comment

This reporter construct contains the 5kpb region located upstream the start codon of cdc25 (KHC5.12)missing the cis-regulatory modules CRM1 and CRM2 (as defined by Ogura and Sasakura 2016), cloned upstream the basal promoter of Forkhead and the reporter gene pSP Kaede.

This construct is testing Regulatory Region

REG00001158: Cirobu.REG.KH2012.C5:4201966-4206944.Deleted_4204077-4203951

Sequence

Show sequence

Length: 4,853

CAAGTGTGCACGAATTCTCCACAAGACTGTGTTCTGAAGGGTCTGATATACGACCCATTT
CCACTGTTCCCACAAACCTGTTTGAACCCAAAAAACAACATAGGCGCCTAAAAGACTGTT
GAAAGACGGCACTAATGTGGCAAAAACTGTTAGGATCTAATTTGTGTTTGTTGTTGTCTC
AGTCCTATTTAAGATTAATGTAACAAAATCGCTGTTCGTAAAAACGGGAAAATTTCGTGT
AAATGGCGAGTTTTTTGGCGAACGTTAATATGTATATGTGTGAGTTAGACCCAAAAAGTT
GGCTGCTTTTGTATTTGAAAATCACTTTTAAAGATGTCGTTCTTTTAGATCATTTGACCA
GCTGTCGTTCTCAATAGTGCTGGTGTAACTCTAAATTCCACGAACGTCTCGCACCTTAAA
ACCGATCTCGTTCCAAAAAAATTAACAATACCCGAACCAGTTCCATCCAACTTTTAATCA
TCGCCTTGCACCGGGTCAATTAAGTTAGCAGACCGCAGGCGGACTTGTACTTCGTCGGGA
CGCTTCTAATTTACCCAGATGTTATGAACATTTGATTGAACAACCACGGATCGCCTTTGT
CGTTATCGGCCGCACAACGCTAATAAGTCGTAATCGCTGTTTTGTTTCGTTAATGAAGCT
CGTCTATTGTTCGCCGTAGTTTCGTTGGAACAACAGCCCAGATAACGAACATACACCCAC
AGATTATCTGTATAGTTCGGCCCTGTTTACGTAAGATATTGCGAAGAATCAGAAAAGATT
CTACCGCCCATTCGCAGAACGTTATCCATAGTAATACTTTTCTAAAACTACGGTAACTGA
ACAGCAGTGTTGCACATGTTTGAAACGCTGTTTGTATTTTTAGACATATATTCTATTCTA
TATGAATGAGAATGTTATTTTTTGTCAATTCGAATTTTTTTTAGATTTCCATAATACTAG
AATATATGCATGTATTTCACCAATCACGAATTTAAGAAACGCTCAAAAACTAACTTGAGG
TATTTTTGATGCCTCGTCTATGTAAAAATGTCTTTCCGCGTGTCGTCGCTATAGAGCACG
TTGGGTCCGCCATAATTTAAAACCACGTCATCCTTCTTAATGATATTATCCACTCGTGAG
CATGACCAATTGGTACTACCGGCTTTACAAAAGTTGGTATAATGACTATAATCCAGCCGG
TTGGCGGATATTGGAGTTAGCAATGTGTTATTGGTATTTTTGTATTATGTTTCAAAATGC
TCAAATTCTCGTAACGACTTTTCTCGGGTTCGACACTCGCGTTATTTGATTTTTTTCGCA
AAGTTCGTAAAAAAGCAAAATCCTTTTGCCTTAGATTCAATTTCTTTTCAACAGATTGGC
CCGATCTTTTACTATTATGGCACGGGAATCGCGTATTATTGTCAAATAGGCCACGAACTT
AATCCCAACACCGAACGTTAAAAACTCACGATCCCAATGACAGCAGGCGAAGTTAAAACA
CATACATGATCATCGAGCTGGGTTCGTAATCCCGAGCGCGTTCACTTAATCGCTGGTTTA
CAGCCACGCAGTGCGATCCAGGAGACAATGTGGCCGTCGCAAATTACACCGCCTCCCCAA
AACCCTTTGGTTGAACTATCCGCTCATCTTCGCGATTATCCGTCGCCCTAGACTCCCAGT
CGTCCATTGTCCAGCGCCAGCTATTCACTTAGATGCGGCTTTGTTCTTTCTGATCTCCTT
TGCGGCTCCTCATCGCGACACCTTAGGATTACCATCGTCGGCGTTCCATGAACACGACGC
CCGCCCCCATAAGATTCCTAAAATTCCCAGAAACACTAATTATAGCAATCTATACTCCCA
TGGTATTTTAACCCGTCCGCGAAGCGAAACAATTTTCAATTTTCCGGTAAGTTGTCGTTC
ACTTGCGAAAAGCGTCGGTCCTATAAATCGTGGCAGGTTCTCACACAAAACACAAATTAC
CATGACCCGAATCGATTACCGCACTATCCGTTCAATGCATTCCCTATAATTCAACCAACA
ACCGCGGTCCAAAAACCGCTCAAATTTTATCACTTGACCGGTAGCCTGATATACGCATTC
AAATAAACACTCCAAGCCCAAACATCGCGCAACCTTGCTAGTAAACCAATAAACACCTGT
GTATTTGCATTCCGACAACACGTTGGCCCACAAGAGGCAAACAGGTCGCACATTCGGAGG
AAATAGTTATCGGTTTTCGTCGCTTTCCGTCACGTTTGCAATTCTATGTTTACAGAGACC
TAAACATTGCGAGTTTCCTACCTATAGCTGTTAAAACTCGTACTTTTCGTTGCCGAGTTG
CAAAGTGTGCTATTCTAAATCCGTGCCAACTTTTAGCAACACCTTCACTTACAAATTGAA
AGTGTCAAGTTTTGTTTGATTTTAAAAGCATGCTAATATTTTATATTGATAATTATATAG
TCGTGTATAATATATAGCGGAAAACAACGACCCGCTTGGACATCATAATTGGTTTATAGG
CCTATATACGATTTATCGGTACTACGATTTTGTAAAGCTACGTCGAGTTTGTTTCTTTGG
TTATTTGAAACGCATGGTTTAAATATTTTCCATGAGATATACGCAAGTATATTTTTATGC
GAGTTGGCTATATTTGAAATATCTTATAGCCACGCGTATAGATTCCGACGTGCTGTAACG
GTCTTACCGCCCTTTGGTTAGCGCTGATGTTAAGTAGGTGGCGTTGGCAGTTGGGCGACA
TATGTTTTACTGCAGTGAGAGTCTTAAAAAAATATCAAGTTTTCTTTAAGTGGCAGAAAT
CTGTCGCCGTGGTTCTGCTCTTGTATTTTACTGTTCAGCATATACAATGACGCTAGAATA
GTGCGTGCCTCGGGGCCCGAACCGCGACGCTTCGGCCTTCGCTACTTATCAGTGGACGAC
CAAAACACACTGAACCTGTAGTAAAGCGAGAAAAAGGCGACTGCACCAGCACTCTTAAAA
TAGCAGCTGCGGTTCGATGCAGGGCACCATTCATTCAACTGCACATGCAGCGCACAACCA
GCTGAGTTCAATTTGTTAGTAGATCGATTCGGTATACATGCATTATTAGCAATATTCCAT
GTAATTGGAGAATATGCAACAGTGCAGGATAGTGACCGATTCGTTAATTAAAACTAATCT
AGTATTCACTCATGTTCTGCCTGCATAGTTAAAGGAAGACTAGTTGTGTGTTTTTCGTGC
AACGTTAGTAGGACAGTAGTAGTAAGCAAAAATACGTCGTCAATATATATGTGGTGCTTC
TCGTAAATATCTCCGCGGAGCAAACTTTTCTATAAAAATTAGAACCGACTCGCTGCCTAA
TCCGTAACTAGTTCCCAACTTCGGATATATTAAGCAAGAATCCCACCCGTTAATCCACTT
GCGTGCATCCATAGTGCCCGCATAGCGTACAAACAGCCAACCGAGACATCCTGACTGCAT
CCAGCCGGGCCAAGGTGCGCTAGTATTGTTGGTCGTAGGATTTACTTGCCAGCAGCAAAC
TCGCTACCGAGCGAGAGCCCAGCGGTATGTTTCCTTTTCGACTCACCGCCAAAGGAAAAA
GGTTAATCTCTCGCTTGGTAATCGCGTCACAGGTAAAGGTAGTCACTCGCACGCTGTGTC
CCAGCTTGGCCGGATTGTAAGATGCTTCGTAAACCAGTTTACATGAGCTGCCTTCAGAAT
ATCAATTAGCGTCCAAACCGGACAATGCAAGGGAATTAGCTCATAGCTCTTGGGCCTTTT
TTCTCAACTTCCTAATCGTAGACATCTTGCCTGGGATTTCAGTTTGAGCGCGTATTAAGC
AGCGAGACAGACTTCGGCTCTTATATATTACTAGACAGAAGCATAAGAGTCAAACAGTAT
TCACCTATTCAGCTACCTCTAGGTAGTTACTGGTCTACGTAAAACTTTATCATTACTGTA
CAACAATGTAGTACCGTTCCAGTATACCCAGAGCAGCGCATTGCAGACCACATACTACGC
ATTGTTATTGTTTACTTTGTGCCGATAAGCCGTATCCAATGTATATAGGACAAGTGGCCA
GTATCGACAGGCGGATGTATTCACATCTAAAGCACATAACTGTAGCGTGAGGCTACCACG
TTATATAGCGACTATAGCGTATTGGTAACTGAAAGAAATTGCGTATGTATAGTAGTTTGT
AGTGCGTTAAAACTAAAGTGGAATGCTCCTCGAGCACTGAGAGAAAGAGACTATGCTATT
ACATGGTTGTTTAACTGACGATACTAGACGGTTCATTGCACAATAACTAGAATCTAAGAG
TCGTATACTAGTTAGCTGGCTATAGTATTATTGGGGTTTTGGATATGTCATTTTATTGTG
TTGATTAAGAGAGTACCATGCAGCATACATACATACGTTGTATTGTGTATTATATTGAGT
GAGTAGTATTAGAATGTCGGGTATATACTCAAAAGGCCTCCTATACCTCGAGCGTAACAT
ATGGTGTGGCCATTGGAGCTTATTGCAACAGTTGTTCTGCGACGCAAGCGTTATAAAGTT
GGATTATGACTTAGTAAAGACCGCAATAACATAGTGGTCGTATTGCCGATGGAATTGGGT
CATATCGGCGATGTAACTTATGGGCGTTTGTCATAAGCCGATATCTCGTGGATTAGCAGA
GTATCTTCGCCGATCGAGTAAGCAAACTGTTTTCTTTTGCAGAATTTCAGGTTATTTGAC
ATCCGAAGTAGCTAATTGCGTTTTAGACATACGGTATCTTGAGAGCTTACTCTGTTGTAA
GCTAGCGGGTGTTATACACTTGTGGTCAATCTTCAGCACCTGTCTTTAATATG

Reference(s)

Ogura et al. (2016). Developmental Control of Cell-Cycle Compensation Provides a Switch for Patterned Mitosis at the Onset of Chordate Neurulation. Dev. Cell 37(2):148-61

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