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CONSTRUCT

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  1. Construct 'CONS00000286'
  2. Construct 'CONS00001685'

Construct

ID

CONS00001685

Name

p.REG.Cirobu.KH.S1404:3000-6298>LacZ

Min Promoter

Endogenous Promoter

Reporter

LacZ

Comment

The 3.3kb element located upstream of Ci-Bra TSS drives robust and faithful LacZ expression in the notochord, with only occasional misexpression in the mesenchyme lineage.

This construct is testing Regulatory Region

REG00001597: REG.Cirobu.KH.S1404:3000-6298|Bra

Sequence

Show sequence

Length: 3,298

AGCTTCTGAACAAGCCATGTGCCGGAGGCTAAATGAGGTAAGAGATTTTGCTTATAAGTT
GTTCGGTGGAGATTTAATATGAGATTAATGTTTAGGTTGGAGTGGCTGGGGACGAAATAA
TTGGTGGTGCATCGGTGAGTTGAAGCGCCCACGTGCGGTTCATGGGATTTAAGTTTTTTT
TGTTTTAGACTCACAGTTTATTCGAGAAATTGTCGAAAACTGAAGAGCGCGTGCGCAGTC
TGGAGAGGGAACTTGCGCAGTACCGTAGTGCGCATGCACGTGAAAGATGCGCACGAGAAC
GCCTTGAAGCAGAAAGAGAGAAAATGCAAAATATTCTTGGTCGTATTGAAACGTCTACGT
CATTCAATGATGACGTCATTGTTAGCAAACAAGTATGTATTGAAGTCATATGGTTATCGA
TTTGATGGCGCCTCTTTTTAAACTTTATTTTTTCAGACCGAAAAAAGTGAAACACACATG
ACGTCAGCAGTTGCTGACGTCAAACCATACGTCACACACCACGTGAATAAAACATCAATG
TCTCTCAAGCGAATAAATTCACCTCTGGATTTATCGGGTACGTAATGATGACGTAAATAA
ACGACATCGATGATGTAATATTGGTAACGATGACGTAACAATCTTTACAGTTGAGGCTAC
GTCATCGAAAAACCGGAAATCATCTTTCGACCAATCACGAGATACCACGTGGTCGGAAGA
TTTTTTAACAAATCGACGTCATAGCAACGTGACGTCACCACCAACGTTTCGAGTGATTCC
TATGACGTCACAAGAGGAAAAGCCGTCATCGCGATCTTCATGCTCCAGTGATTCAACCAC
CTCACGTGATTCCTATCGAGGTCGCTCTTTATCGCCGCCCCAGCGCTCATCTCATCTTGC
TTCTCATAGAAATACAATACAAGTTACGTGACTATCGTCGCCCAATGACAAACCGTAGTT
TCTTTTCCCGCCAAATTCAAAGATTTGTTCCAAACCAATCACACAACGCTACGTCATCGT
TTTTCTAATTTTCAAATAAAAACTTTTTTGCGATTTTAACAAAGACGTCTTCTTTGTTAC
AATGAGTCTTATTGTTACAAGTACCATCGAGTAACGACGATTGTTCCGTCATAACGAGCA
TAGTCAGCCGTTCAATATGAATGTAGCATCCTGTTGTGATGTTTATTGTACAAGTTGTAG
GATCTGGTATCTCAGTTTCCTGAGACCTGGTGATTCTGTTCCATTCAAGAAACCGAAACT
AATTCTACCGCTGGGTGTCGCTAAGATATTAATTGGTAATTAATGTTATTTATAATTAAT
TGGATCGTAATGAAAATGTTCGCAGCTACTGTGGTAATAATACTCGATTGTCTTGCATTG
TTTTGTCAAACAATGGGCATGACGTCGCCGCCGCCATCTTTCCTGGGAAGCCCGGGATTT
CCCCTCTGGATATCTTTGCTGGTAATCCCCCATTTAAGCGACGTTCCCGGTTTAACTTTC
TTTTTATTCCAGTTTATTTTCTCGGGTTGCTGCAACGTTGTGGCTTTTAAACGAAATTCG
AGATTCACGGTAAGTCCATGGTTTGTAAAAATTGTAACTATGACGTAACAAGCGAACTGT
TGCTAGACCGCCATCGCGTTCGGATCTTCTTGTCTTTCAACAATCGTGATTGTCGTTCTT
CTCTGTGTCGTCACAATGGCAGTAGCGGAAGAAGTAATTGTGTTAATGTTGTTATATTAT
GTCGTAACAAAGATATATTGTAGTTATCATTCTATCAATTGTCACATAAAGGCGTTGGTG
TCGTCATCTCTTCGATAATATGTTTGCTGGTACTTTCCCTTCTTGCTGTGACGTCATCAT
CATCGCTTCTTTGTTACGTAGCTCTGACGTCACACGACGATCGTTGGTTTACCGACAGGG
TAAGCCCCTTTTGTAGTTACGCTTAATCTAACATCGGTTCATGCAGGGAACACAATGCGA
CTCCACAGCGCCGTCTACCGGTGGCCACGAATGTGCCAGCCTAACTATTCCATCCAACAA
ACCAGCCTTCGTTTTCTACGCTCCTTCAGATGAAGCGGCGAAATATACGTCAGCGTTTCG
TGACGTCATTAGGGGACTGGAAACCAAAGGTTTGTGGTTTGAATATTATTCTTGTTTGGT
TAATATTCTTGTTTTTAGACAAACTCGACCGAGAGTTTGATGACGTCAAGACACCGGGTA
GGTTGATATTATGACGTCATTAATGCGTGGCGCCACAAAATTAGATATCTTTCTAGATTC
GAGCGAAGACGGGGTAGCAGTTATTGAAGTAGACGGACAACCCCTGCCGGGGAATTACCT
GCATAGTACTTAAGCTCTTATGACGTAATAATGGACCTTACAAAAGAACAAACAATTAAT
ATATAAGAATTCGGCTTATGACGAAATAATGTAAACGTCAAATTATTGTGACATTTATTA
TTGCGTCATTGAGGTTTTGTCGCCCACTCGCGAAACGTCAGGCAATTAGTTTCCTTGTTT
ACGGAACAAACGACTGCGGGGGTGCGAATTGTGACGTCATCAATCAAACTAAAAAGGGGA
GTTGTGACGCAATAATAAAGTAATTTTCAAATGCGATTGTTATGTAATAAAAAAGGAAAA
AATAATGAACATAATTATTCGTTTCTTCGACTGCGACAGCGAAGATAAAATTAATTAAAA
CAACAAAGAGAACGAAATTTGCAACAAGACGACAGTCGATAAAACACGATGAGTAGAAAC
TACTTGAGTAAAAGTGTCAAATAAAACAAAAAATGAAAAAAACACACCCAACGTACAATA
AAACTTACGGCAAATTGTAGTTAAAATTCATAATTACAAAACAATAAAGATCATATAAAC
AAAATATTAAAGATCATATTAACAATATAATATAGATCATATTAATAGCGACAAACCTTA
TCTGGTGTTACGTCACAATACAAACAAAATATTTCGACATGTCAATCAAAATCGGAAACC
AAGTTTCAACTTCCCACGCAAGACAATGGGAAAGTAACACGTCACAATACACTTGGTGAC
GTCATATCACTAAAACAAACACAAGGTGTTCGATCCAGCTGTGAAAGTAAACATAGAGCG
CCACCACACGAGCAACCCTCACAGCTGGATGCCACCACCTACGGCGCACTTTCAACAAAC
ATAAAATTTCAAAAAGAAGAAGTTATGACGTCACAATCCTGTATAAACTTGCACCCGAGT
GTGATTTGGAGGCAGAATGTTTTCGAAGCTCAGTGCGAGTTACAAACCTATAATGACG

Reference(s)