Aniseed - Transcript Card

Transcript Model

Transcript Id

Phfumi.CG.MTP2014.S66.g00788.01.t

Possible name(s)

SLC10A2; SLC10A3; SLC10A5

Gene model

Phfumi.CG.MTP2014.S66.g00788

Location

S66 [71,414 / 72,761]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 449

>Phfumi.CG.MTP2014.S66.g00788.01.p
CFLVTIFLSWQVKCEKSTNNQKENFNTSYSLKSKWLIEAYEDEITQFTYNCSAPEETHNL
SSLYVLLETHDLAIGGIWIENNSIPRTQLNCKNGTVEMFVKAGHLGITSISISQASNEVG
LTVLNTGELSLHVLRKVTLFDELAVFVLGPLILFNKCAFGAKIEVDMLKRIVTKPVELLL
CLLTQFIFLPLTAVGLGTLFQLDQVLSLALLVSAVCPGGGGGYVFSFLVDGDITVAITAS
LVSTLVAMVAMPSVIGIYMHFAHIPNNIVIPYIKILLMLLAIATPITLGMIVRRKKPNLA
KKLITVIKPLSLFLIFAGLVVVVVTSKYVMYGPKVGYILSIMLPFSGLFIATVLCKLVCI
SWPLTKAVALESGLKNTVLGVAVIELSFPQPQADLASILIVMITVGQVVVAMSWYVMHML
KKCFALKSSKKDIEEDPLETELFLQHSNS

Nucleotide sequence

Length: 1,347

>Phfumi.CG.MTP2014.S66.g00788.01.t
TGTTTCTTAGTCACCATATTTTTGTCATGGCAAGTCAAATGTGAGAAAAGCACAAACAAC
CAAAAAGAAAATTTTAACACAAGTTACTCACTCAAAAGCAAGTGGCTAATTGAAGCATAT
GAAGATGAAATCACTCAATTCACATATAATTGTTCGGCACCAGAAGAAACACACAATCTG
TCAAGTCTTTATGTGTTACTTGAAACTCATGATTTAGCCATTGGAGGAATTTGGATAGAA
AACAATTCTATACCAAGAACTCAACTGAACTGCAAAAATGGTACTGTTGAAATGTTTGTC
AAAGCAGGGCATTTGGGAATAACTTCGATCAGCATCTCACAAGCAAGCAATGAAGTTGGC
CTTACAGTTCTAAATACTGGTGAATTATCACTGCATGTTCTGAGAAAAGTTACATTGTTT
GATGAACTGGCTGTTTTTGTCCTTGGACCTTTGATATTATTTAACAAATGTGCCTTTGGT
GCAAAAATAGAGGTTGACATGCTAAAAAGGATTGTTACCAAGCCAGTTGAACTTTTACTT
TGTTTGTTAACACAGTTTATTTTTTTACCTTTGACTGCAGTAGGTTTGGGAACCTTATTC
CAACTTGATCAAGTCCTTTCTTTGGCATTACTTGTGTCTGCAGTTTGCCCAGGTGGTGGT
GGTGGGTATGTTTTTAGTTTTTTAGTGGATGGTGATATAACTGTTGCAATAACAGCTAGT
CTTGTGTCCACACTTGTTGCAATGGTAGCAATGCCGTCTGTAATCGGCATTTACATGCAC
TTCGCCCACATACCAAACAACATTGTGATACCCTACATAAAAATACTGTTGATGCTTCTA
GCAATTGCAACCCCAATAACGTTGGGAATGATTGTCAGAAGAAAAAAACCAAACCTTGCA
AAGAAATTAATCACTGTGATAAAACCACTAAGTCTTTTTTTAATATTTGCTGGACTTGTA
GTTGTGGTTGTTACATCTAAGTATGTGATGTATGGCCCAAAAGTTGGGTATATATTATCT
ATTATGCTACCTTTCAGTGGCTTGTTTATCGCTACAGTGTTGTGTAAATTGGTATGTATA
AGCTGGCCCCTAACCAAAGCTGTAGCACTCGAAAGTGGCCTTAAAAACACTGTTCTTGGT
GTTGCTGTCATTGAACTGTCGTTTCCCCAACCCCAGGCTGACCTGGCATCAATTCTGATT
GTGATGATTACTGTTGGCCAAGTTGTAGTTGCAATGAGTTGGTATGTCATGCATATGCTC
AAAAAATGTTTTGCACTAAAAAGCTCAAAGAAAGATATTGAAGAAGATCCACTTGAAACT
GAATTGTTTTTGCAACACTCCAACAGT

InterProScan

PANTHER	Bilac:Na_transpt (IPR004710) - T[134-428] 2.1E-62
Pfam	BilAc:Na_symport/Acr3 (IPR002657) - T[151-329] 2.4E-25

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value
NTCP2_HUMAN	25.503 %	108	2.77E-26
P3_HUMAN	35.772 %	146	5.91E-39
NTCP5_HUMAN	35.51 %	147	1.93E-39