- Transcript 'Mooccu.CG.ELv1_2.S12...'
Transcript Model
Transcript Id
Mooccu.CG.ELv1_2.S126563.g03846.02.t
Possible name(s)
RBMS1; RBMS2; RBMS3
Gene model
Location
S126563 [15,160 / 29,307]
Amino acid sequence
Length: 447
>Mooccu.CG.ELv1_2.S126563.g03846.02.p
MSQPEWSSGSTLLQPKNTYPILCATQAVPFPMLHDSTPTVIPPWPYQSNISSNRNMPPTS
PSTGSSSSQPSNHTGSPGSTSSSSPQNQIVTQNGTMHGSLSSGSNQNNSSSNSSQSGEQL
SKTNLYIRGLSPDTNDEDLVNMCKQYGNIVSTKAIIDPATSLCKGYGFVDYDRQESAGLA
VQQLKQKGVQAQMAKQQEQDPTNLYLSNLPAHINEHELEKILRPFGSVISTRVLRDNAGL
SKGVGFARMESKEKCELIINEFNGKYLPNCEAPILCKFADGGPKKNKQHQKFLNNRWRDG
EMSFQFENGIGQSGVTQGRFMMQPYLTTPNYPMPTQPAWAPPPYLMQPHVTSNGTVISQM
DPNMHIHPGVMPQLGQLASQMTQLQISPNHSVPVSYQNGVGQTYISPYHGSNGHVQQHIP
VSEDGMIASDQQRHINVAEMNGHSVK*
Nucleotide sequence
Length: 2,956
>Mooccu.CG.ELv1_2.S126563.g03846.02.t
CCGCGGTATGTGAACCCCTGCTTTACATTGAATATTGTTAGTTGATTGGACCCACTCAAG
CAGTTTGCATTCTTTAATTTATAACTTCCAGCTCAGCAAACTTTTATTGTTACTTAATAA
AAATATTGTTTAAACGCGAATTTACCAAAGATATGGAGTATATTAAGGCGTTTTGAAACG
CACATGTCTCATATCTGAGTACAATCACTCATCCTTGAAATTCTATTTTCGGACGTCGAC
GATGAACTACTTTATAACACAGACAACTATGCCCTAACGCAATTGTTGAGTGTTTGTTGA
CCTTAATGGCGATGTTTACCAAAAAACTGATCTTTTTTTTAATGCTGATTTCAGTGTATA
TTTTTTTACTGCATTAAAATGTCACAACCAGAATGGTCATCGGGATCAACCTTGCTACAA
CCAAAAAATACGTATCCAATCTTATGTGCAACACAAGCAGTTCCATTTCCGATGCTTCAT
GACTCCACACCAACAGTCATCCCACCATGGCCATACCAGTCGAACATATCTTCCAACCGA
AACATGCCTCCAACATCGCCATCCACCGGCAGTTCCTCATCGCAACCTTCCAATCACACA
GGGAGCCCCGGAAGTACTTCTAGCTCAAGCCCTCAAAATCAAATCGTAACACAAAACGGT
ACCATGCACGGAAGCCTTTCAAGCGGCAGCAATCAAAATAACAGCAGCAGTAATTCATCG
CAGTCTGGTGAGCAGCTGAGCAAAACTAATCTTTACATTCGTGGTTTGTCCCCCGACACA
AACGACGAAGATCTCGTCAACATGTGCAAGCAATATGGCAATATTGTTTCCACAAAAGCT
ATAATTGACCCAGCTACATCTCTGTGCAAAGGTTATGGATTCGTCGATTATGACCGGCAG
GAATCAGCTGGTCTGGCCGTTCAGCAACTTAAGCAGAAAGGTGTTCAAGCTCAGATGGCA
AAACAACAAGAGCAAGACCCAACAAATCTTTATTTGTCAAATTTACCGGCACATATCAAT
GAACATGAATTGGAAAAAATTCTTCGGCCATTTGGTTCGGTTATTTCCACTCGAGTTCTT
CGGGACAATGCAGGGCTCAGTAAAGGGGTTGGCTTTGCAAGAATGGAGTCAAAGGAGAAA
TGCGAACTTATTATCAATGAGTTCAATGGCAAATATTTACCAAACTGTGAAGCTCCCATT
CTTTGCAAGTTTGCGGACGGTGGGCCAAAGAAGAACAAACAACATCAGAAGTTTCTCAAT
AATCGTTGGAGGGATGGTGAAATGTCGTTTCAATTTGAAAATGGAATCGGTCAATCTGGT
GTCACTCAGGGCAGATTTATGATGCAACCATATTTAACCACTCCTAATTACCCAATGCCC
ACACAACCAGCTTGGGCGCCTCCTCCTTACTTAATGCAACCCCATGTTACTTCAAATGGC
ACTGTGATTTCACAAATGGACCCAAATATGCACATTCATCCGGGTGTTATGCCCCAACTT
GGACAGCTTGCTTCACAGATGACTCAACTCCAAATTTCACCCAATCACTCTGTTCCAGTT
TCGTATCAAAATGGTGTTGGACAAACGTACATTTCTCCCTACCACGGAAGCAATGGTCAC
GTTCAGCAACATATTCCAGTTAGTGAGGATGGGATGATTGCAAGCGATCAACAACGGCAT
ATTAATGTTGCTGAAATGAACGGGCATTCTGTCAAATAAAAAAGAAACTATGATTCCTCA
ACTCTCACAGATCAAGTGATATTTTAGTTTTGACAACTAAAACTGATGAACGTTTTTAAA
TTTATGTATATACTTTGACTTTTTCTACTTTCACACAGTAAATTAAAAAGAGTTTTAATG
AAAGTTTTTTTGATCGTACACCATTTTATCAAATCAAATATGAATTTTATGTTGTTTTTT
TTAATTAGCAAATTGCTAAATCAAATATAGTTTAATATCAACTGCATGATCTCGTTGTGC
AAATATTATTTGTAAAGAAAATTTTATTGCTGGTTACAGCGCTTGTATTATGAAGCAATT
GTACCTAAAATGTGCTTATTGCATTGGTGCAGATGTTGCCCTTGCATGAAATTGAGACGT
ATCAAAGAGTATAATAATGCTTTTACAGTTTCACTCCGTGTTGTGTACATAAATTTAATG
TGTAATGTGCATAGTTGAATACAAGCTCATTTTGGTGCTTGTAAAAATGCAAGAATTGTT
TAAATGAACCACAGAGCTAAATTGTCAACCTTATGTGTATATGCTTACTTGCCAAATTTA
CCAACAAAGTCTTCAAAACCAACTCAAACGCTTTGTGGATCATAATGATAAACAACACTT
GCCGTTTTCATTCAAAGTGATTTGTACTTTTCTATGAACATTCATCCACTTCATTTTGTA
TCATCCTTTATCTTGGCACTGATATTTTTGGACCAAGTTTTGATTCCAACTGCCCAAGGC
ATAGATAAAACCCCTATTACATACAGTTCTATGACAAACCTGTTTTATGCAGTTTTATAT
TTTTTAGCCTTTGTTTTATTCCTTTGTGGGCTTCCTTATTTGTTGTCTACCAAAGCTGTG
CATATTTGAAATTCCGCCCTTTGGCTCTGTGCTTTATAGGTCGATCCAAATTTAATTAAG
GGTATTTTACTGTGATGATTACTCTTAACTGCAAATTGGAAATAAGGAACCTAGAATTGT
GATTTTTAATGTTGTAATGTGCATAGTAGAGGGTTTATTTTTATGCACGGAGATATTTTT
TTAAGATATTTAATTTCCTGAATTCTATGTGGCTTTTTCATTCTCTGCTAATGCGTGGTA
TTTTTACAGTTTTGCGAATAAAATGCCATCGGTTTCAATGACTGTACTGTAAATAATTCA
AAGTGAAATAAAATACCAAAGGAGTAAATCAGCAAATTTTATGTACAGGTTAATAACTGT
TAAGGAGGATTCCCAC
| SUPERFAMILY |
RBD_domain_sf (IPR035979) - T[195-313] 5.51E-20 - T[321-419] 1.3E-18 |
| Gene3D |
Nucleotide-bd_a/b_plait_sf (IPR012677) - T[212-318] 7.0E-20 - T[319-415] 3.5E-20 |
| ProSiteProfiles |
RRM_dom (IPR000504) - T[249-322] 13.686 - T[328-407] 14.078 |
| PRINTS |
Hud_Sxl_RNA (IPR002343) - T[249-264] 5.0E-6 - T[333-348] 5.0E-6 - T[348-360] 5.0E-6 - T[388-405] 5.0E-6 |
| SMART |
RRM_dom (IPR000504) - T[250-318] 4.1E-13 - T[329-403] 1.8E-14 |
| Pfam |
RRM_dom (IPR000504) - T[251-313] 5.2E-13 - T[330-397] 1.1E-12 |
| Protein Name | Identity | Bit Score | e-value |
|---|---|---|---|
| RBMS2_HUMAN | 50.327 % | 263 | 3.44E-84 |
| RBMS1_HUMAN | 45.961 % | 258 | 7.25E-82 |
| RBMS3_HUMAN | 50.166 % | 265 | 1.58E-84 |