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  1. Transcript 'Mooccu.CG.ELv1_2.S53...'

Transcript Model

Transcript Id

Mooccu.CG.ELv1_2.S535314.g30750.01.t

Possible name(s)

CIRBP; TRA2A; TRA2B

Location

S535314 [2,527 / 6,491]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 314

>Mooccu.CG.ELv1_2.S535314.g30750.01.p
MSDSDLEPGEYKQQAARKNRSLTPPGVDHAARSKSRSRSKESVHSRRSGSPRRRSYSRSR
SRSRGSGRSRSRSYGKRSRSKDNYRSPKRSSYSRRSRSYDKKRRSYSRSRSRSRGSRSPL
SGRKRHIGDRMNPPSSKCLGVFGLSLYTTENDLRDVFSRYGYIDKCNIVIDQKTGRSRGF
GFVYFEETNDAVEAKDRANGMDLDGRKIRVDFSITKRAHTPTPGMYVGRPAPHHSNGPPR
RYDDRGGGGGGDRYDRYDRYDNRDRRGYDKRGGGGGGRYDDRDRYNSRRSPSPYYSGHRR
SPSPYGNGRDRRY*

Nucleotide sequence

Length: 2,731

>Mooccu.CG.ELv1_2.S535314.g30750.01.t
TTTTGATAATGACGTCATAATTAAACAGACAAAAGCTGATCTACAAGCCGCCTTTTTCCT
CAAGCGGCAAGTCTCTCAGTCAGTCTCACTCTCACCATCGTAAACATGCTGCATGTCTGT
CAGTGTACGATTTGAAGTTTGTACAGTGTATATACTGTATAATCCCTGTTTGTATAATGC
AGAATGTTCATTTATTCATGATTAAAGTGCAAAAAAAGGAATACAAAACCATTGTCTATG
GACAAAATAGACTGTGGGGGTATAGTTTAGCCCGCGTGTCTCAGTAGGCTACCGGACCGG
TACCTATACCCCTAAGTGCAGCTTGGTGACTACTGACTATTCAGTAGTTGGTAGTAGTAG
GCCTACGTATTGTCAGATTGTAAGATTGACTTTGTACCCTACCAGTACCAGTTTATCGGC
TTTAGACAGTTGTTGGTACTACATTCGTACATTGTATTTGTATGTTAGTTTAGCTGCTTA
TTACCTGCATGCAGATGTCCGCGATGAGTGCAGAGTGACTCACATATCTGCCTCTGACGT
TATCAGTCATATGAGTCAGTCAGTATACAGTTAATACTTTACAGTACTAACTAACTGACT
AAAAAGGTCAGCTAATCAGAATGTTAGATGGCCTTTTTGTCATTTATTTTTTTGAGAGTT
ACAATTTATTATACAGTCGAGACCAACCGCTGGATACTACACGATTTTCGAACCTTAAAA
AAACAGCGAACCTTATGACGGCCTACTATCATACAAAAACGGTATTAAATGTTTAAAGAG
AGGACATCATTTTGTGCTCACAAATATATATTTATAAAGTAGAGACTTCCAAGAATCCAA
AAAATGTTTAGACTTTTTGAAAAACAAACATATTTTGAAAATCGCATACCATCTACAGAT
CTACTTTCAAATAAACATATATATACGGTATAAAACAGGAAATTATCCTCACAGGGCAAT
CTCTTTAAACTATAAACTGAATAATATTTCAAATTATATGCGTTTTCAATAAAACTGTCC
TGTAATAACCATAGACCAATGCTGCTGTGTTTTAGCATAAAAACTTTCGTAACTTTTGAT
TGACGCGATAAAATTTTCTGGCTTGCGGTGAAAAACTGTATTTTTTGTCTTTTATCACAA
TTTAGCGTCCGATTTTGATTATGTTTATTTGCCGTTGTTTTGGGTTAAAAAAAAACTGCT
ATGTTGTAGCGTACTACGGGTTGAGCACGTAAAATACTAGGTCGGTACGTGACCCGTACC
GTACGGTAATATTCTACGGCACATAGTATTCAGCGGCTGGTATCAACTGTATAGTGTATA
GTCCAGTCAATACAATATGATAGACCTCTAACATTCTACAACCTAGGCCTACAATAGCCT
ACCGTACTATCATTTTGCATAAATGAATTGAATTATTTTTCACCGCCAAAGCTATAGAGC
TCTACATGCAAAACTCACAAAGCTCCTTAAACATGTTAAACATCCACAAAAATCTGCGGT
TGTCCAATAGAAGAGAGTGTTAATAGCGTGTTGTTAAATCATATCTTTTCTTGAATCATT
AATTGTATCGTATCGTGGTATTTAGTTGGATTGTATTTCAGTATTTGTATCTATTATAAA
AATTAAATTTTCATATAAAAAATAATGAGTGATTCGGATCTTGAACCGGGTGAATATAAG
CAACAAGCTGCTCGAAAAAATCGAAGTTTAACCCCACCTGGTGTTGATCATGCAGCTCGT
TCGAAATCCCGTTCTAGATCAAAGGAATCTGTACATTCAAGAAGATCTGGTTCACCGCGC
AGAAGATCATACAGCCGATCAAGATCACGTTCAAGAGGTTCTGGCCGCTCACGCTCTCGT
TCGTATGGCAAGCGATCTCGATCAAAGGACAATTACAGAAGCCCAAAGCGATCAAGTTAC
AGTCGTCGTTCTAGAAGTTATGATAAGAAAAGGCGGTCATATTCTCGCAGCCGTTCAAGG
TCCCGTGGAAGTCGATCGCCTCTGTCGGGCAGAAAACGTCATATCGGAGACAGGATGAAT
CCACCGAGTAGTAAATGTTTGGGGGTATTTGGTTTAAGTCTTTACACAACTGAAAATGAC
TTACGAGATGTATTTTCAAGATATGGCTATATTGATAAATGCAACATTGTTATTGACCAA
AAGACTGGCCGATCTCGTGGTTTTGGTTTTGTATATTTTGAGGAAACAAATGATGCTGTC
GAAGCCAAAGATAGAGCAAATGGAATGGATTTGGATGGCCGAAAAATTCGAGTTGACTTT
TCTATTACAAAACGAGCACACACACCAACCCCTGGGATGTATGTTGGAAGACCAGCTCCA
CATCACAGTAACGGTCCACCCCGTCGATATGATGACCGTGGTGGTGGTGGAGGTGGAGAT
CGCTATGACCGCTACGATCGTTATGACAACAGGGATCGTCGTGGGTATGATAAAAGAGGA
GGCGGAGGAGGGGGTCGCTATGATGACCGGGATAGATACAACAGCCGACGCTCGCCATCA
CCTTATTACAGTGGTCACCGACGTAGCCCAAGTCCATATGGAAATGGAAGAGACCGTCGA
TACTGAGGACATGAAGACACTGAATGAAGATGGACTTTTAACATATGTAAAGTAGATGAT
AGTGCTTCTTTTATTTTATGGACATTCTAGTTTGTAACTTGTCCATTTTATTGCCTGTAT
ACTACCAATAAAATCTTACGAATTTCAATGT

InterProScan

Gene3D
Nucleotide-bd_a/b_plait_sf (IPR012677) - T[616-769] 3.8E-29
SUPERFAMILY
RBD_domain_sf (IPR035979) - T[674-777] 3.8E-27
ProSiteProfiles
RRM_dom (IPR000504) - T[685-763] 17.95
SMART
RRM_dom (IPR000504) - T[686-759] 2.3E-21
Pfam
RRM_dom (IPR000504) - T[689-757] 1.1E-17

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
TRA2B_HUMAN 58.011 % 177 4.04E-54
TRA2A_HUMAN 59.615 % 174 1.08E-52
CIRBP_HUMAN 53.425 % 77 5.57E-17