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Transcript Model
Transcript Id
Mooccu.CG.ELv1_2.S665104.g40963.01.t
Possible name(s)
CWC22; NOM1
Gene model
Location
S665104 [2,401 / 9,714]
Amino acid sequence
Length: 724
>Mooccu.CG.ELv1_2.S665104.g40963.01.p
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IEEVKKGEIKKMKNVTEKLDVVEKKNQVDKSEKEKSKKNFMKTEDAKEETLQDEMEKYKK
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SIFYAIMTAEDYVNAFEKILALGLKDKQVQEIPHVIVECCQQGKTYNAFYCHLLTKFCTF
DRQYVLGVQCSFWDRFKLLHELKKQHIFNLAKLVGELVLNNSIPMSVLKNIEFTHLDNAM
VRFL
Nucleotide sequence
Length: 5,978
>Mooccu.CG.ELv1_2.S665104.g40963.01.t
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TCTTTACCCTGAGTAATGGATCTTAGTGGTCGCACTCTCACTTGGCTTCATCAATTCATG
GCACCAGCTGTCGAAACTGGACGTAGGACGTTTGTATCATTTGCCTTTTTGACTTCAATT
GGATTTATTTGGACATTTGTTTTGCGCGGATTTATCAGTGAACTTTTAAATGAAACATTC
GTAAATGTTGCTTTCTCTTTGTACACACCTGCATTGGTGATTGTGTTTTGTGCTGGCTGC
TTTCAACTTTACAAATGGGTGCTTTGCTGTTTGTCTAATAACCAAGGTTTGGTCGCTTCT
TCTAGCTCACAATCTTCTCTTGATCTACGTGAACAATGGAATAAACCATCTGCTGCACTC
ATGGCAGAACCGGAATTTGACAATGGAAATTTACGCCAAAGAAGAGTTGAATTATTAGAC
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ACAAAGTTAAATGACAGCAAAACAGCGAAAAAGATGTTACAAGGTGAATTTTATCGCAAG
GTCGATTATGACGGTCTGGTTGAGTTTATCCGCTGCACAGATTTGAATTATCCTCTGTTC
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ATTTGGGAATTAATTTCAAAGCTTATAGAAACTCATGGTTCCACACTGACACCTGCCAGA
TTATTGAATGCTGCCAAGGACTATGAAAAACAAATTTATTATGACAATTTTTATGAAGCA
TTTAAAAAAAATTTGAAACCCGTGGCCTGTCAATCAAGATCAAACTAGTTTCGTACCAAT
TTACCAAATGTTAATCTTTGCTATGCCTCGTCATTTATCTCGATTAATATAGATACTAGG
CATGACCAAAAGACAAGACAAGACAATTTATTTTCTGGTTTAAATTGTTTTGACCTAGTC
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ATTTTATTCAGCAAGTCTATCTAGTCTACAAGTATTCAATCCCTATCTGCCAATAATATG
TTCCACTGTCAAGTGTATTAGACTATTAGTTGTCATTCTTAACTAACCTATCAATGTATT
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TATGCAATAAGTGTAGTGTATCATGTTTCACTTTCACATTTATCAAAATCATGTTGTTAA
CCGTTAAACATCAAATCTTGAATCCCACCTAAACTTTTTGTCAAAACCCACTACATTTTC
GATGTTAGCTGGTTGAGAAATTTGTATGCGGCATAATTTGTACAATAACTTATTGATTGC
ATTGCCTTTGATCTGTAGACCCGTATTTCATAATATCTTGTCTTCCAATCAAAGTTCTTT
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AATACACACTCGTTCCGGTCGCCACAAAAGTTGAGTTGAAAACAGCATTTGATGAACATA
AGGAACAGTATCAGCATGTGGTCATGCTCAATTGTGGTGGGAATATTGATGTCCTGGAGT
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AGATGCACGCCATTCCCGAGTATGATGCTCTCTATCATGAAGAAGATGCAAGCGATATTT
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CATTAAGAAAGAAGAAGAAAAGACGAGAATGGGAAGAAAAACGTAAAGAAATTTTGTTTG
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GGAAAATGTCGAAGGATAATAATGATTTGTTATGGTGGGCGATTATCGGAGTTACCGATC
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AAACTTATTCATTCATGGAATCGTCAGTCCGGGAAAAACTTTCTTCATTGATGGAAGAAT
CTGCTGATAAATTTGGACTTGATAATATCAAGTTTCAATCATTTACTGCTCAATGTGGGT
TTAATCATAAACTTTGTGCAAGTGATGTTGTTTATGCTGTCGGTTCTTTACTGGAGGATC
ACGACACCAATGAAGATTCGTCACCAAACACAAATTTTGTAAAAGCTCTTGACAGTCTCG
CAAAAATATCAACTAAACAGTTACAAGACGGAATCTCACTGGCAAAAGTACAATTGACTT
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TTCTTTATACTTTCATCAAAGAAGGAATGCGAGATTACAAGAATTTTGGAGGTGCAATTT
TCTTGAACTTTTTCACCCATCATCTTCTTCATTGCTACTTGCGATCTCTTGGAAAAAGCA
AGCGCGAACGAGCGAAGAATCTTCCTTTAGTTGTCTGCGCTTCACACGATACTAACAACG
GTGTGTGCATAGTAACGGGAGTTCCACCGTTAGCGGACGATTCTCGGAAGAATTTATTTG
GTCGAGCGTTTGCACACGCAGCCGAACGAACAAACTCTGTAGTAGTCGATGAATTCTTCG
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GTCACCCCATACCAAAACATGACATAATAAATAACAAATTTATTTGATTCCATACTTTGC
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TTAGTATACTACAATCATACAGACTACTTATTTCACATCCTTATGCTCAATCATACAGTT
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TTGTAATTTGATATAATAATTATTTATGCCTTGAAGTTTATTAATTAATCTGTTGAGTTT
ATTATTTTGTagtcgaattttcaATGCTTTGACGATAACATTTTGTTTTTTGTTTAGATT
TTAAAAATAAAATAATTAATTAAAATGAGACGAAAAGTTGACAAGCGGAAGAAGAGCGGA
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TTCACATTTGTTGATGGTCCGAGTCGGAAGCAAAGAAGAAAAGAGATGAGGATGAATAAG
AAGAAGAGAAAAGCTGGAATCAAAATAGAAGAAGTCAAGAAGGGTGAAATTAAGAAAATG
AAAAATGTCACGGAAAAATTAGATGTTGTTGAGAAGAAAAATCAAGTTGATAAAAGTGAA
AAGGAGAAATCTAAGAAGAATTTTATGAAGACTGAAGATGCCAAAGAAGAAACGCTTCAA
GATGAAATGGAAAAATATAAAAAATCAGCTGAAAAAGTTCGTAGAAAACGTCTCGCGGAG
GACAATAGCCTGGAAGATAAAACGATAAGTCAACTTGAAAAAAAATTGCATTTGAATAAG
AAAAAATCCAAAGGTCTTCCGGCTTCGTTCAAAGCTGATGGATTTGATTACATCTTGAAT
TTAATTGATGAAAATGAAGATAAAGTCAAAAAAGACGATTTCTTTCAAACTAAAAAGAAG
AAGAAAATATCAGAAAAGAAGAAAGAGCTTGAAAGTGATGATGAAATGGAAGAGGATGAT
TTCTTTAAAGATGATGAATTGATTTCTGGATCCGAAAATGAGGATGAAAATGAATCTGAA
GTTGAAAATGACAATGAATCTGATGACCAATTTGAATCTGGGGGTGAAAATAATGAAGAC
GAATTTTTTGATGATGGGAAAATTGAAGATGATCTTGAAGAAGATGATTCTGAGCATAAA
ATTATCACAGAGGATAAACCCGAAATCCCAGTTACAAAATACATTCCTCCTGCTTTAAGA
AATATTAATGAAAAAGATTTCCTTAAACTTCAACGGCAGTTGAAAGGGTTAATGAATCGA
GTCAGCGACTCAAATTTAAACAAAATTGCAAACGATATTGAGAATATGTATCGAGAGAAC
AGTCGTGCAATAATGAATAAAGTATTTTCCGGTTTGATTATGTCATCAATGTTCCAACCT
GACCCTCTTCCAGATAAACTCAATATGGAGATAGCTATGCTTATCTGCGTTATATCAAAA
CGTATTGCTATCGAAGTGTTGGCTTACGTATTGGAGGATATGGTTTGTAAGTTTTATGAA
TTTTACACATCGAAAAAACATGAAAATGACAAATCTGTGAACAATGCTATAGCTTTGATG
TCAAATTTATATCGTTTAAAAGTCACTCATGCAAATTTACCGATCGATTTCATCAAATTA
TTTTCTGAATCTTTCACGGAGAAAAATGTTGAGCTTATTCTGCAGTTGCTTCAGATGGTA
GGATTTCAACTGCGACAAGACGATCCATCGTCGTTCAAAGATATCGTACAAAAGATCATA
TCAAAATCATCTGAGGTGGAACAGTCCGAAGGCTCACGAATGGCATTTATGTTGGATACT
TTGACTGCAATTAAGAACAACAATGCTCGCAAATTAACGCAGTATTATGACCCGGAAATG
GTAAAACAATGTCGGAAAAAAGTGCAAGTTGCTGTTGGAAATGCGAGTTCTTCTCTCGAA
AAACTTCCCGCTGTTGCTATGGATGATTTTTTGCATGGCGACACGAACGGCCGATGGTGG
GTGGTCGGAAGCGCGTGGGCCGGTGCTCCGATGTTAAAACAACAAGCAGACAAACAAGCA
ACAAACGAACAATCAAATGATAAAATCTCGTCACGGTTGGTCGAAGCTGCGCGGAAACAA
AGAATGAACACGGACTTGCGAAGAAGTATTTTCTATGCGATAATGACCGCTGAAGATTAT
GTTAATGCATTTGAAAAAATTCTTGCTCTTGGATTGAAAGATAAGCAAGTTCAAGAAATT
CCTCACGTAATCGTGGAATGTTGCCAGCAAGGAAAAACATACAATGCTTTTTACTGCCAT
CTACTGACTAAATTTTGTACATTTGATAGACAATATGTACTGGGAGTTCAATGCTCATTT
TGGGACAGATTTAAATTGTTACATGAATTGAAAAAGCAGCATATATTTAACCTTGCTAAG
TTAGTTGGCGAATTGGTGTTAAACAACTCTATCCCAATGTCTGTTTTAAAGAATATTGAA
TTCACTCATCTGGACAATGCAATGGTGAGGTTTTTAAG
| Gene3D |
MIF4-like_sf (IPR016021) - T[1540-1805] 3.1E-46 |
| SUPERFAMILY |
ARM-type_fold (IPR016024) - T[1567-1769] 2.59E-24 |
| SMART |
MIF4G-like_typ-3 (IPR003890) - T[1571-1768] 9.8E-17 |
| ProSiteProfiles |
Initiation_fac_eIF4g_MI (IPR003891) - T[1865-1981] 18.578 |
| SMART |
Initiation_fac_eIF4g_MI (IPR003891) - T[1866-1972] 1.2E-19 |
| Pfam |
Initiation_fac_eIF4g_MI (IPR003891) - T[1866-1971] 1.7E-20 |
| Protein Name | Identity | Bit Score | e-value |
|---|---|---|---|
| CWC22_HUMAN | 23.305 % | 95.9 | 2.74E-20 |
| NOM1_HUMAN | 40.598 % | 354 | 1.6E-110 |