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  1. Transcript 'KH2012:KH.C5.353.v1....'
  2. Transcript 'KH2012:KH.L126.13.v1...'
  3. Transcript 'Moocul.CG.ELv1_2.S10...'

Transcript Model

Transcript Id

Moocul.CG.ELv1_2.S102482.g09375.01.t

Possible name(s)

RBMS1; RBMS2; RBMS3

Location

S102482 [3,961 / 10,607]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 462

>Moocul.CG.ELv1_2.S102482.g09375.01.p
MYILANPVPVWPYQSNISSNRNMPPTSPSTGSSSSQPSNHTGSPGSTSSSSPQNQIVTQN
GTMHGSLSSGSNQNNSSSSNSSQSGEQLSKTNLYIRGLSPDTNDEDLVNMCKQYGNIVST
KAIIDPATSLCKGYGFVDYDRQESAVLAVQQLKQKGVQAQMAKQQEQDPTNLYLSNLPAH
INEHELEKILRPFGSVISTRVLRDNAGLSKGVGFARMESKEKCELIINEFNGKYLPNCEA
PILCKFADGGPKKNKQHQKFLNNRWRDGEMSFQFENGLGQSGVTQGRFMMQPYLTTPNYP
MPTQPAWAPPPYLMQPHVTSNGTVISPMDPNMHIHPSVMPQLGQLTSQMTQLQISPNHSV
PVSVKALETLLLFQSPARSHHQPNAEQNQSMETQHQLSLPSPQPSTPSTGRYQNGVGQTY
ISPYHGSNGHVQQHIPVSEDGMIAGDQQRHINVAEMNGHSVK

Nucleotide sequence

Length: 2,915

>Moocul.CG.ELv1_2.S102482.g09375.01.t
TATTATTTATATATATACATATATATTCTATAGCCCCTGTATAGCCTTAATATATAACCG
CATATAAACCAAATTAACCGTGTGAATATCATCCATATATCCCCTGTACTAAGTTTGCTT
ATAAACCGTAGCGTTGGGTGCTCCTATACTTCGATCAAACACGCCAATCCGCTATTTACT
TTGAATAATTCGACAACGCCCTTTTGCTCGACACCCACAACTACATCGCCACTCGTTCGC
TTTGCAACTTTTGAAAAATACAAGAAATGTACATCTTAGCAAATCCTGTTCCAGTTTGGC
CATACCAGTCGAACATATCATCCAACCGAAACATGCCTCCAACTTCGCCATCCACCGGCA
GTTCCTCATCGCAACCTTCCAACCACACAGGGAGCCCCGGAAGTACTTCTAGCTCAAGCC
CTCAAAATCAAATCGTAACACAAAACGGTACCATGCACGGAAGCCTTTCAAGCGGCAGCA
ATCAAAATAACAGCAGCAGCAGCAATTCATCGCAGTCTGGTGAGCAGCTGAGCAAAACTA
ATCTTTACATTCGTGGTTTGTCCCCCGACACGAACGACGAAGATCTCGTCAACATGTGCA
AGCAATATGGCAATATTGTTTCCACAAAAGCTATAATTGACCCGGCTACATCTCTGTGCA
AAGGTTATGGATTCGTCGATTATGACCGGCAGGAATCAGCTGTTCTCGCCGTACAGCAAC
TTAAGCAGAAAGGTGTTCAAGCACAGATGGCAAAACAACAAGAGCAAGACCCAACAAACC
TCTATTTGTCAAATTTACCGGCACATATCAATGAACATGAATTAGAAAAAATTCTTCGAC
CATTTGGTTCGGTTATTTCCACACGAGTTCTTCGGGACAATGCAGGATTGAGCAAAGGGG
TTGGCTTCGCCAGGATGGAGTCAAAAGAGAAATGTGAGCTAATAATCAACGAGTTCAATG
GCAAATATTTACCAAACTGTGAAGCTCCCATTCTTTGCAAGTTTGCGGACGGTGGGCCAA
AGAAGAACAAACAACATCAGAAGTTTCTCAATAATCGCTGGCGCGATGGTGAAATGTCGT
TTCAATTTGAAAATGGACTTGGTCAATCAGGTGTCACTCAGGGCAGATTTATGATGCAAC
CATATTTAACCACTCCTAATTACCCAATGCCCACACAACCAGCTTGGGCGCCCCCTCCTT
ACTTAATGCAACCCCATGTTACTTCAAATGGCACTGTGATTTCACCAATGGACCCAAATA
TGCACATTCATCCAAGTGTTATGCCCCAACTTGGACAGCTGACTTCACAGATGACTCAAC
TCCAAATCTCACCAAATCACTCTGTTCCAGTTTCGGTAAAGGCTCTTGAAACTCTTCTCC
TCTTCCAAAGTCCAGCGAGATCTCACCATCAGCCAAATGCAGAACAGAATCAGTCTATGG
AAACACAACATCAGCTCTCTTTACCCTCCCCCCAACCTTCCACCCCCTCCACTGGGAGAT
ACCAAAATGGTGTTGGGCAAACGTACATTTCTCCCTACCATGGCAGCAATGGTCACGTTC
AACAACATATTCCAGTTAGCGAAGATGGAATGATTGCAGGTGATCAACAACGACACATCA
ATGTTGCTGAAATGAACGGGCATTCGGTCAAATAAACAAAAAAACTATGATTCCTCAACT
CTCATAGATCAAGTGATATTTTAGTTGTAACAACTAAAACTGATGAACGTTTTGAATTTA
TGTATATATCTTGACTTTTTCTACTTTCACACAGTAAATTAAAAAGAGTTTTAATGAAGG
TTTTTTGATCGTACACCATTTTATCAAATCAAATATGAATTTTATTTTGTTTTTAATTAG
CAAATTGCTAAGTTAAATAGTTTAATATCATTTGCATGATCTCGGTGTGCAAATATTATT
TGTATGGAAAATTTTATTGCTGGTTACAGCGCTTGTATTATGAAGCAATTGTACCTAAAA
TGTGCTTAATGCATTGGTGCAGATGCTGCCCTTGCATGAAATTGTGACGTTTTATCAAAG
AGTAATGCTTGTACCGTTTCCCTCCATGTTGTGTACATAAATTTAATGTGTAATGTGCAT
AGTTGAATACAAGCTCAGTTTGGTGCTTGTAAAAATGCAAGGATTGTTTAAATGAACCAC
AGAGCTAATTTGTCAACCTTATGTGTATATGCTTACTTGCCAAATTTTACCAACAAAGTC
TTCAAAACAAACCCCAACTCTTTGTGGATCCTAATGATAAACAACACTTGCCGTTTTCAT
TCAAAGTGATTTGTACTTTTCTATGAACATTCATCCACTTCATTTTGTATCATCCTTTTT
CTTGGCACTGATATTTTTTGGACCAAGTTCTGATTCTAACTGCCCAAGGCATAGATAAAA
CCCCTATTACATACAGTTCTATGACAAACCTGTTTTATGCAGTTTTATATTTTTTAGCCT
TTGTTTTATTCCTTTGTGGGCTTCCTTATTTTGTTGTCTACCAAAGCTGTGCATATTTGA
AATTCCGCCCTTTGGCCCTGTGCTTTATTGGTCGATCCAAATTTAATTAAGGGTATTTTA
CTGTGATGATTACTCTTAACTGCAAATTGGAAATAAGGAACCTAGAATTGTGATTTTTAA
TGTTTGTTGTAATGTGCATAGTAGAGGGTTTATTTTTATGCACTGAGATATTTTTTTAAG
ATATTTAATTTCCTGAATTCTATGTGGCTTTTTTCATTCTCTGCTAATGCGTGGTATTTT
TACAGTTTTGCGAATAAAATGCCATCGGTTTCAATATGACTGTACTGTAAATAATACAAA
GTGAAATAAATTACCAAAGGAGTACATCAGGCAATTTTAATGTACAGTTTTAATTTCTCT
TCTGCCATGCTTCAGCTTTTATTTAGTTACATCTG

InterProScan

SUPERFAMILY
RBD_domain_sf (IPR035979) - T[33-155] 5.1E-21 - T[162-261] 3.76E-19
Gene3D
Nucleotide-bd_a/b_plait_sf (IPR012677) - T[53-158] 1.6E-20 - T[159-257] 1.2E-20
ProSiteProfiles
RRM_dom (IPR000504) - T[91-164] 13.72 - T[170-249] 14.078
PRINTS
Hud_Sxl_RNA (IPR002343) - T[91-106] 3.2E-7 - T[175-190] 3.2E-7 - T[190-202] 3.2E-7 - T[230-247] 3.2E-7
SMART
RRM_dom (IPR000504) - T[92-160] 6.2E-14 - T[171-245] 1.8E-14
Pfam
RRM_dom (IPR000504) - T[93-155] 2.4E-13 - T[172-239] 4.0E-13

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
RBMS2_HUMAN 50.98 % 270 2.11E-86
RBMS1_HUMAN 44.633 % 262 1.96E-83
RBMS3_HUMAN 50.831 % 271 1.52E-86