- Transcript 'Moocul.CG.ELv1_2.S11...'
Transcript Model
Transcript Id
Moocul.CG.ELv1_2.S113842.g13158.01.t
Possible name(s)
ZFP36; ZFP36L1; ZFP36L2
Gene model
Location
S113842 [79,347 / 82,752]
Amino acid sequence
Length: 424
>Moocul.CG.ELv1_2.S113842.g13158.01.p
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RPALPRSTSMQPRTTSGLNATTPAARSRLNLSRTTSVCSVPTVIPESSIIPATSTTATSE
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FAHGKHELRNLVRHPKYKTELCRTFHTSGFCRYGPRCHFIHNTEDANTTRATNAPNSFAQ
QSFGQSSNAMPVPEPQNNVSNHYQNSRPAQLELIGKQFSVDSGIGTYAQSSYSPNSTSPL
NGSPISDILGSHTVLSPLSPPVSGSRFSFNNNMLSGNNEGFQRSTNMSSNYGYCGIDTSS
CTPPNSTFDLLKQQINSTGYEITDDTVFEPLTPPDSDRESMTGSPSSRSSQQRLPIFRCL
SHSD
Nucleotide sequence
Length: 3,019
>Moocul.CG.ELv1_2.S113842.g13158.01.t
TCTCCAGTCGAATTCGATCAGCATTTAGACTTACCGTTGAAACAAGTTGTATTAGCACAG
AGCTGCTTTTTCTGTTACGGTACATGCAAATACATTAATTTTGCTGTTCTATTCAGATCC
GAACAGAATATCATACATATTATACTTACTTAAACCTTATAAGTAAGTTTCATTACTCAA
AAACCAAGGATTAATACAAATAAAATTGAAAATGGCATCAATGATGACTGCAAGTTTTTC
CGATTACAGACTTGACAGAGATCGAGATATCAAGCCAAGTGCATATCTTGCAAACTTGCC
TTCGGGATTTTCCGCATTTTCGACCGGGGCATCTGCTTTGAGGACGCCGGAAAAGGCCGT
CTCTATTCCCGTCGCCGCACCCTCTGCATACCGGCCGGCGCTGCCGAGATCTACCAGCAT
GCAACCTCGTACAACGTCGGGATTAAATGCAACTACACCTGCTGCCAGAAGTCGATTAAA
TTTGTCAAGAACGACCTCCGTTTGTTCTGTACCCACTGTTATTCCTGAAAGTTCAATAAT
CCCAGCGACTTCTACCACAGCCACAAGCGAACCTATTAACGTATTTAAGGATGTTGGATT
TCGTAACCGAGCGTTTAGCGAAGGCGCTAATGGCCAAAGTCAGTTGCAACAGCAATTACA
GCAACAACAAGTACAATCAAGCCGCTATAAAACCGAACTGTGCCGACCTTTCGAAGAGAA
CGGAAAATGCAAATACAGCGATAAATGTCAATTCGCTCATGGCAAACACGAATTAAGAAA
TCTTGTCCGACATCCAAAATACAAGACCGAATTGTGTCGCACTTTTCACACAAGTGGATT
CTGCAGATACGGACCGCGCTGCCACTTTATTCATAACACTGAAGACGCCAACACTACTCG
AGCTACCAACGCGCCAAATAGTTTTGCCCAACAATCTTTTGGACAAAGCAGCAATGCGAT
GCCAGTTCCAGAACCGCAAAATAACGTTTCAAATCATTACCAAAACTCAAGACCTGCTCA
ATTGGAGTTGATTGGAAAGCAATTCAGCGTTGACAGTGGTATTGGAACATACGCACAATC
GTCTTATTCACCTAACAGCACAAGTCCACTGAATGGCTCTCCAATTTCGGACATCCTTGG
AAGCCACACTGTTTTGTCGCCACTTTCCCCGCCAGTTTCAGGCAGCAGATTTTCGTTCAA
CAACAACATGTTATCAGGGAATAATGAAGGCTTTCAGCGATCGACCAACATGTCTTCAAA
TTACGGGTATTGCGGCATTGATACATCGTCATGCACACCGCCCAATTCTACCTTCGATCT
GTTGAAGCAACAAATTAACTCAACTGGATATGAGATTACCGACGATACAGTTTTTGAGCC
TTTGACACCACCCGATTCTGACAGAGAATCTATGACTGGTTCTCCATCAAGCCGTTCATC
TCAACAACGTTTGCCCATCTTCCGCTGTCTATCGCACTCGGATTAAGATGGAACACATCC
ATTGACGTTGGTTAAAGCTGACGAGAATGTTATTATTTGTCGAGCTTTGTGTGGCGAGAT
GTAAATTAACGCACATAACAGAACCTTACCTTGCAAAAATACTAAATAAGCTCAAGGAAT
CTTTACTAGTGCATGTAAGTGCCTATAATTTTATTTCGTTCAATGCTCTTAAACCATTAA
CTTTGTTAAAATGTATATTTTTATCGAAATTTACATTATTTACGGCAGGGAAATTATTTA
AATCTTTTAGAACAATATCACTTGTTCCCGTAGGCTGTATGATGTAAAAACAGGCTGTGC
TTTTTAGACTTTATGTCATTATTTATGTTTTCCATGGTTTTATCTTATGGTAAATGCAAC
ACGAACTATTATTGTTTTATTTTTTCTCGCGACAGATATTCGCATTTTAATCATACCGTT
ACCATAGTTAAATACCATGTTTATTTATTAATAATGCTGCTTCATTTATCACTATCTTGT
TGGTTTTTGCTATACGTTTTTTTTTTATTTCTATCTAATCTTTTCTACAAAAATGCAGTT
AAAAACAATAAAAAAATATTTCTCTTCACACGACGAATTAAAATAATTCCAAGCAGTTTT
GGTTAATGACTTTGCACAGAATGTCGGACGTGTTGAGACGATTTGTACGTCAAGTTTGCA
ATGTAATGCCTTAACACCAACGCCTATGTTAACAACGATTAAGTCCATACAAAAAACATC
TTTGGCGTATATTTTTATGCAAGTCTGCTAAGTTAAATTCTGTGCGTTGTATCCCTGTAA
GGTGCTTCTATTTATTTATTCTTGTGTAATTTTATTTTGCCAAATATGTTATTGCCAATA
TTACTTATCATGTTTCCTTAGTACATTATGCTTGGTTTAACGTTAACTTCGGCAACCTGG
TTTGATTCCTTGTAACCCAACACTTCTGTCACGTGGTCTTTCTTTGAGGCGTGCAGCAGA
AGTGTACTTAGTTAATAATAAACCATGGCACGATGTATGAATTGTGCGGCGAATGCGTTT
CCCGCGCTCCCTTCACACATGTTGGTTTGATTATTGTAAAAGGCTGCCGCATTGCAATTT
CGTTATTTTTCACATTTCGTTGTGTTTTGGGACATTTCGTTTGTTTTTTCATACTACGTT
TCATCTACTGATATATTTATTATTATTATACCTTTGTCAACGAATGCTTTTTTACCACTG
TACCTGTCTACTGCTTAAAAAGCTTTGTTACTCACAATTGAAAGATAATGCAGGTACAAG
GGATGCATTTGTGATGTAACAATTATCACTATGATGATGATAATAATCATTGTTTTCATA
TTTTGTTTTCCATTATTATATTATTTAATTATTTGCGTTGGTTTTTGTTTAAGCAGCATT
TGCTATTACCCCTGTTGGGTCGAGTGTCTTTGTTTTTATTTTATTACGTTTTTTCATCTA
TTATTATTCTATTATAATTATATTATTATATTGAAATATTTCTTCTGCGTGTTGTTTACG
GATGATATGCTTCTTAAGA
| ProSiteProfiles |
Znf_CCCH (IPR000571) - T[158-186] 15.892 - T[196-224] 15.76 |
| SMART |
Znf_CCCH (IPR000571) - T[158-185] 3.7E-8 - T[196-223] 3.1E-8 |
| SUPERFAMILY |
Znf_CCCH_sf (IPR036855) - T[158-189] 1.83E-9 - T[192-224] 7.06E-10 |
| Pfam |
Znf_CCCH (IPR000571) - T[159-185] 7.5E-10 - T[197-222] 4.5E-10 |
| Protein Name | Identity | Bit Score | e-value |
|---|---|---|---|
| TISB_HUMAN | 73 % | 165 | 1.8E-47 |
| TISD_HUMAN | 63.208 % | 143 | 4.24E-38 |
| TTP_HUMAN | 68.116 % | 108 | 2.46E-26 |