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  1. Transcript 'Boschl.CG.Botznik201...'
  2. Transcript 'Moocul.CG.ELv1_2.S11...'

Transcript Model

Transcript Id

Moocul.CG.ELv1_2.S113996.g13287.01.t

Possible name(s)

CDH2; CDH4; CDH6

Location

S113996 [3,486 / 8,930]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 177

>Moocul.CG.ELv1_2.S113996.g13287.01.p
MVLTTSSSSVIILAIVVYKRKQAADDAKGGLLYEDEDDVRENLQVYHDEGGGEEDQDAFD
ITALQQPLEEPRGPRVIDMKPVESAEPQPRLPRNIPGDDIEKYIDDAKAQADKDPTAPPF
DSLLVFDYEGTGSDAGSLSSLNSGTTDGSQDYQYLRDWGPRFENLADMYGQGSDTDE

Nucleotide sequence

Length: 3,487

>Moocul.CG.ELv1_2.S113996.g13287.01.t
TTTAATTTGAATGTATCAGAAATGTAAGCCACACCATCTGGCGTCTGTTATTATTAAATT
TATATTATTAATTAATATTACAGGTACGAATTCTCAGCCAGCTAACAGCCAAAAGGCGTG
GAGTTTTTATAAAATTTAACAATTTTAAACCATTTTGGTGTAAACATGACCTTATTTAAT
TTTAGCTGGTGATTTTTTCATCGGAATTCAAACCCTGTATTGTATTTATTAATATTTTTC
CAACAGCTGACCTTCACAATTATCTGTATGAATTTATTTTTATATTTTTTACAAGATGCG
AGAGGGGAAATAATGAAACTATATGCATGGCTGCTCATGCGTTAGCTGGGGCCATCACTT
GGAGTCCATTGATTATATTGTTTCTAATAATTCTCATATTACTCCTTATATGTGAGTGTG
TGCAAGCGTGTGTGCTACCATTGTTTCATGTTGCCATGGTTGCACGAATGCACATTACAT
GTTCAAAATCAAGGCATAGAAATAAAAAGAAATAATATTTTGTAAAAACAATCAGAAATG
TGCCGTAGAGAAATATTTCTATATCACATGAGATGAAATTATGCTATTCATATAATTTGT
AAATTGCAAGTACTTTTAAAAAACACATTTGCCCTGCGCTGCTAAAATATTTTTATCAAT
TAGTTTGCCAATTTATTTCTGTGCCTGTTTTATGTGATTGTTTGATGTTTGTGACATCAC
TGTGGAGTTGCCAGGAGGCAGATGTTTATTTTTAATGATTTTTCAGCTGTGGGGGCGAAA
ACGACCCTCAGAATTGCAAATTGCCGATCGCTGCCGGCGGCTTCCTTATACCAATAATAA
TCGCCATTATTATTATCATTATTCTCGTTGGTATGTCATCATTTGGGGGCCGTGTTAAAT
GCATGTGTGGATAACATTAGCTTTTATGGTGGTTTTTCAGCGAAAATTTATCATTTTTTA
TTTTCGTTTTCGCTTTTTCTTCAGATGCAAAATCAACGAAAGCGGCGTTACTTTTGACTG
CCCGCTACCTCCAAAACCATTCGTGGCTCTCATACCGATTATAATTGCAATAATAGTCCT
TATTCTTATTTTGGGTAAAAAAAACGCTAAATTTAACACATGGGGTCTACCGCAACGTAG
CTTCTGGCTGACTTATTGCAATGTTTTAATTGTTAGGTGTAACTCAGATGGAACACCTGA
ATGTCTTGCCACGCAAGGTGCTAACTTCCCGTTATACATCGGGATAATTGCCGCGGTTAT
TCTCTTGTTAAGTAAGATAGAAAACTGAATGAATTAACGAATGAAAATTTATCACAAATC
TCACAGTAGTAACTTTATCCTCAACTCAACCTTCACTCACTTACTGGAATGAATTCTATA
TCTTCTTTACCAACCAACTTTCGGTGCAACTTTTTAACTGACTTTCTTGTCGAGAGCTTT
CATTGATTCCGATTGCAGTCTGAGTGATGTGGCTCAGAAAATTAACAGCTAAAAAACATC
TTAAACATGACCAGGGCTGCTGCGTATTTTGCAGATATAAATGAAAAAACTTTGCAGTTT
ACTAATATTTCGTGTTTATTATTTTGGTGTTAATAATATTTTAACATGAATGTTGTCACT
AACCATGCATTCATTTTTTTAAGTTGTACTGGTGATAATCCGGTGTGTGCTGGCGTTCTA
CGAGAAGCTGGCTTCCCGATATTCATTATTATAATCATAATAGCCATCTTGATATGCCTG
AGTAAGTGCATGTATGTGCATGTAATAACTGTTTGTGTGTGCATGTGTATTTTTTCAAAG
TTGCGATTTGTCATGCCAAGTAATATTTTTTCATATCGTAAATCTCTGTATAAACACCAC
TGAGCGTTGATTTAAGGCGTGGTTTTTATTTTTTACGTTTAATGACTATTTGCCAAAGCT
TAATTGAAAGGATTTCATGGTTGAGCGAACATGTAAACACCACAGCCACCTCTCACGACT
GTGTAATTCACAACCTGTTGTTGATTAAACATTTCGTTTTGTTTAAACCTTTCAATGCTC
AACAGAAATTCAATCTTATTCAACGACTGTTCGTTGTTATCCAATCCACTTTTTGAATCA
ATCAATTGGACGAGTTAACATTTGAATTATTACGCAATACTCTTGGCATGACGTCACCAA
CTTTATATCTTCACTTTGCATGATTTTTTATGTAAAATATTTTGCCAAAATTTCTTATTT
TTTTTCACCACTTTAGTATTCACTTCTTTTAAATTCACTTTTAGTTTTTAACTCTTTTAT
CCCTTCACTGAAATAAATATTTACACGTTTAAATTTTGGCAAATTATTAACTACTTTCAC
GTCAAAACATGGTTTTAACGACATCTTCTTCATCAGTAATCATCCTTGCAATCGTCGTTT
ACAAGAGGAAGCAAGCAGCAGATGATGCTAAAGGAGGACTTCTATATGAAGATGAGGATG
ATGTTCGAGAGAATCTTCAAGTTTATCATGATGAAGGAGGTGGAGAGGAGGACCAGGATG
CCTTCGATATCACAGCATTACAACAACCACTAGAGGAGCCACGTGGTCCGCGTGTCATTG
ACATGAAACCTGTAGAAAGCGCTGAACCGCAACCACGACTTCCACGGAACATCCCCGGGG
ACGATATCGAGAAATATATCGACGATGCAAAAGCTCAGGCAGACAAAGACCCAACTGCCC
CGCCATTTGATTCATTGTTGGTGTTTGACTACGAGGGTACCGGGTCGGATGCCGGGTCAC
TTTCCTCTTTGAACTCTGGCACAACGGACGGTTCCCAGGACTACCAGTACTTGAGAGATT
GGGGACCAAGGTTCGAAAATCTTGCCGATATGTACGGGCAGGGATCGGACACGGATGAAT
AAGCAGAAACAACGGCAGTGAAATAAATGGACAATTTGACAAACTTCTGCCACGCGTCAA
TCAAATTCCAACTGAAACAAAACGCTTTTATAACTTTTTCTAACGAATGAACTGAGCAAA
GGTCATTCCATATTGTTACATCACTGTTACCTTTCCAATATTCATATTTTTTACAAACGG
CCAAATTTTAACCCCAACTTTTTAGTTTTAAAATTTTAATAATCTTAGGGCAATTGACTG
ACATTCATATCATTTATTGACATATAATAATTATTATTTAATTGTACTTGTGAAGTTTTC
TGGCAAAACTTTTAACTCGGAGGTACGCGACTTGACATGGCTTATATGGTACAAAGATTG
CGAAATTTGTGATCGTTCAAAACAGAATGCAATTATTTCATCACACAGTTTCATTGTTAG
ACATTTCTGTACATAATCGTTTATTATTAATTGACAATCCTTATTGTGATGGAAAGTACT
TTTTGTATTTTTCTCTGTTCTTATTTGCAATGTGTTCTGTATCTTTTGGTAGTGACGGGC
TAAACTTGTGTTAAACCACATTTAAACCTGAAGAACTTTTATTAATAAACGCTGGTAATA
TTTCTAA

InterProScan

Pfam
Cadherin_cytoplasmic-dom (IPR000233) - T[29-171] 2.0E-49
Gene3D
Catenin_binding_dom_sf (IPR027397) - T[78-175] 1.1E-35

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
CADH4_HUMAN 48.276 % 136 1.38E-37
CAD11_HUMAN 53.147 % 134 1.14E-36
CAD18_HUMAN 46.341 % 135 1.84E-37