Aniseed - Transcript Card

Transcript Model

Transcript Id

Moocul.CG.ELv1_2.S120638.g14164.01.t

Possible name(s)

SLC10A2; SLC10A3; SLC10A5

Gene model

Moocul.CG.ELv1_2.S120638.g14164

Location

S120638 [73,225 / 74,668]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 480

>Moocul.CG.ELv1_2.S120638.g14164.01.p
MPLKQRLICYCFVFVCIWTEIEGFEFAGFSFPFLKNERDVEQKEDGKIEAFEHTEFNYTL
NCSYINKLISQQRNSSADNFGPIKFNLRTQHPGIATLKSQAEDHNDFICKNDDLYFVHIK
SGHLGISFININLKVIINGEEFIIEDFPLTEVRIKRKISLFEELGVVILAPLVLINKCAF
GAKIELSVLKHIIRQPVALCLCFFMQFIFMPTLSIFFSTILRLSETMSLALFVVASCPGG
GGGYVFSYLIKGDVTLAICGSLLSTLLAIGVMPAILGMYEHFAHVPTDIAIPYFKIIIIL
FAIAVPISTGMIVKQKFPKFAEKFVLIIQPLSLLLILCGIIYLAVSSKYIVYGPTIGWFL
CPMLPFTMFITAVGLSRLFGQSWSFAKAVSLESGMKNTVLGIAVIELSFPQPEADLASVM
ILMITIGHTLLPLFWYFAFLIKTRFRNNNKKEFIKISTVDPDSDSDCEESTLFITTTIRN

Nucleotide sequence

Length: 1,443

>Moocul.CG.ELv1_2.S120638.g14164.01.t
ATGCCGTTGAAACAAAGGCTCATTTGTTATTGCTTTGTATTTGTCTGCATATGGACTGAA
ATTGAAGGATTTGAATTTGCTGGATTTTCATTTCCCTTTTTAAAAAACGAACGTGATGTT
GAACAGAAGGAAGATGGAAAAATTGAAGCATTTGAACATACGGAGTTTAATTATACTCTC
AATTGTAGTTATATAAATAAACTCATATCACAACAAAGAAATTCATCTGCAGACAATTTC
GGTCCAATCAAGTTCAATCTAAGGACGCAGCATCCAGGAATTGCCACATTAAAATCACAA
GCAGAAGATCATAATGATTTTATATGCAAAAACGATGATTTATATTTTGTTCACATCAAA
TCAGGTCATCTGGGAATAAGTTTCATCAACATTAATTTAAAGGTTATAATAAATGGCGAA
GAGTTTATTATTGAAGACTTTCCTCTTACGGAAGTACGAATAAAACGGAAAATATCGTTG
TTTGAGGAATTGGGAGTTGTTATTTTAGCTCCTCTCGTGTTGATCAACAAATGCGCTTTC
GGGGCAAAAATTGAACTGTCTGTTCTAAAGCATATTATCAGACAACCTGTTGCTTTGTGT
CTGTGCTTTTTTATGCAATTTATTTTTATGCCTACACTTTCTATATTTTTCTCGACAATC
CTCAGACTGTCTGAAACAATGTCTCTTGCATTATTTGTTGTTGCTTCCTGTCCGGGTGGT
GGAGGTGGATATGTGTTTAGTTACTTGATAAAAGGCGATGTTACTTTAGCAATATGTGGA
AGTTTGCTTTCCACTTTGTTGGCCATCGGAGTAATGCCTGCTATTCTAGGAATGTATGAA
CACTTTGCACATGTTCCGACAGACATTGCAATACCATATTTCAAAATCATTATTATTTTA
TTTGCAATCGCAGTTCCCATATCTACTGGAATGATTGTAAAGCAAAAATTTCCCAAATTT
GCAGAAAAATTTGTATTAATTATTCAACCTTTAAGTTTGCTATTGATTTTGTGTGGGATT
ATATACCTTGCTGTTTCATCAAAGTATATAGTATATGGTCCAACCATCGGGTGGTTTTTA
TGTCCCATGCTGCCTTTCACAATGTTTATTACCGCTGTTGGTCTGTCACGTTTGTTTGGT
CAAAGCTGGTCATTTGCAAAAGCTGTATCGCTGGAGTCCGGAATGAAAAATACCGTGTTA
GGAATCGCAGTTATCGAATTATCGTTTCCACAACCGGAAGCTGATCTTGCATCTGTCATG
ATATTAATGATCACAATCGGTCATACACTTTTACCATTATTCTGGTATTTTGCGTTTTTA
ATCAAAACGCGGTTTCGGAATAACAACAAGAAGGAATTCATTAAAATCTCAACAGTTGAT
CCGGATTCCGACAGCGATTGCGAGGAATCAACTCTGTTCATTACAACAACGATAAGAAAT
TGA

InterProScan

PANTHER	Bilac:Na_transpt (IPR004710) - T[166-451] 1.4E-62
Pfam	BilAc:Na_symport/Acr3 (IPR002657) - T[171-349] 9.6E-27

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value
NTCP2_HUMAN	26.871 %	111	3.86E-27
P3_HUMAN	29.526 %	135	5.78E-35
NTCP5_HUMAN	31.494 %	139	1.56E-36