- Transcript 'Moocul.CG.ELv1_2.S27...'
Transcript Model
Transcript Id
Moocul.CG.ELv1_2.S27411.g01248.03.t
Possible name(s)
SLC6A1; SLC6A2; SLC6A5
Gene model
Location
S27411 [14,494 / 21,037]
Amino acid sequence
Length: 348
>Moocul.CG.ELv1_2.S27411.g01248.03.p
MSVTFFFVRFLIFLIFQFGMIEAVIKGLFDEFAFLRSHRVKFLAGMCTLQFLLALPMVTE
SGMYWVTLIDWYCAGFSLMFVALLEMVCISWIYGVDRFLYDISCMIGKYPPLSAVWRILW
LGVTPTCIFALIIASIIYSSPATYNDRVFPGWAIGVGWLSCIFSIIMIPLLAVYQLLTHP
RAKGTFWERVTALIQCDDDWGPRDPNVPYRYRSKNASVKRSSKRDMICEEEVQHLNSDTT
KSTGSTSSSGNPPSYQDIKSCKARKKDMLELSTHVYVNVETFHMCLYVDVGTFFMCLYLD
VETFQVCLCYDFVDVEIFHMCLYVDVEAFYICLCGCGNFPHVFMWALK
Nucleotide sequence
Length: 3,697
>Moocul.CG.ELv1_2.S27411.g01248.03.t
TATGTAATATAATTCAGATCAAAATAATTATTATCAAACTCACGTATCAGTTAAGTTTAA
GTATTATTGCAAGATGGGTAAACCCGAAAAAGTAGCGCTCAATGATTGCCAAGAATCTGT
GGAACCGAAGCGAGAGATGTGGGACAGCAAATTGGACTTCATGCTCTCGTGCATCGGATA
TGCTGTTGGTCTGGGAAACATTTGGAGATTTCCCTACTTGTGTTACAAGAATGGAGGAGG
TGCTTTTTTGATTCCATATTTCACTTTCTTCTTACTGTGTGGGGTTCCGCTTTTCTTCCT
CGAACTTTCATTTGGGCAATTTGGCGCGCTTGGACCTATCGCCATCTGGAAGATATCGCC
ACTTTTCAAAGGTATCGGATATGCTATGTTAGGGATCTCATTTATTGTATGTGTGTATTA
CAACGTCATCATCGCATACACACTTCACTTCATCTTCAACTCGTTGACGTCAGTACTTCC
GTGGAGTACATGCAACAACTATTGGAACAAAGATACGTGCAGGGACAAGAACACCAATAT
CAGTCAGCAAATTCCGCCTGATGGGACGAATATATCATGTGAGACAGGCATGGGTTGGTT
CGACAATAAAGGACACACTTTCGTGAACTATACGACTCACGGAGAATACGTAAACGGTTC
CTGTTATAAATACACAACACCATCGCAGGAGTACTTCTCTAACAAAGTGCTTCGACTAAC
AGACAACATCGACCAACCTGGCGGTATCCAATGGGAACTGGTTGGTTGTTTGGCGCTTGC
CTGGGTCATGGTTTTTGTTTGTCTTTTTAAAGGCGTGAAATGGTCGGGGAAGGTGGTTTA
TGTCACAGCGACATTCCCTTACTTCGTCCTAATCACCTTGTTGATTCGCGGGGCGATGGA
AGAAGGTGCTGGAATAGGAATTTACTATTATCTTTATCCTGATGTATCTAAACTGAGCAA
TGTAAAGGTGTGGGCTGAGGCCGCGGTCCAAATATTTTACTCGTTGGGTGCTGCATGGGG
AGTAATTCTCAATTATTCATCCTTCAACCGATTCAACAACAATGTCTTCAGAGATACATT
ATTTATTTGCTCCATCAACTGCTTCACGTCGATTCTCTCCGGGTTTGTGGTGTTCTCCGT
ACTTGGATCTCTCGCGTTTCAATCTGGAAGAAATATCACCGAGGTTGTCGATCAGGGCGC
TGGCTTGGCCTTTGTTGCTTATCCTGCGGCGGTGTCAAACCTCCCAATATCTCCTCTTTG
GGCCACTCTATTTTTCCTCATGTTACTAAGCCTTGGATTGGATAGTCAGGTAACCAGCTA
TAAAATGGCAATATTTCGCATGTGCTTAATACCATTTCTATAGGCACAACGCAAAATTAA
AACAGTTTTAGTATAAATTTATTATAAATTATAAAAATAATCATTATCACAGAAAACAAG
AAAATAAATATTGAAAAGTAATGCATGCTTTTTTTGTTTTAATTTTGTGTTGTGCAAGAC
ATGCACTTAATCCCTTATTTATTTATTACTTATTATCTAGCTCTTCGCATACGGTAAGAA
ATAGCGTAAAGAAATTAATATTTAAAATGCCTGATGTCTGTTACCATGCGACACTTACAC
TTGAAGACGTAATAGCATTAATATTGAATGAGACACTAAACTGATGATGTCAATATTAGA
TAGGGTTTTCTCCATCCGCATGTATATCTGGGAGACGATTTCAAGGGAAACGCGTGGGAT
CGGAGTACCTTTACCTTTTTTTTTTATTATACAAAACTTGCATACAACATAAACTACATA
ACACCAAGCATTTCATGCTCTTGATGACGTTCCGCCACTAGCGTCCCTTGGGAAAACGTT
TCCTGTGTATACACACCATGGTGTAATAATGTGAAGTGTCTTCATTTAAATTATTGTGTG
GCGTTCACATTTTGAATTTTTTGCGTTTATATGAAACATTCATCAGGCATTTAAATCAAC
ACATTCGATATTTATACAAATAACAATACGCTATACAATTATGTCACCAGGGGCTATCGA
ATCGGGTCTACAAGCCAATGGTACCACTGTCCGGCTCCCCGAGTGAAGCCCATATTATAC
ACCGTGGTAATTTTAATTCAGGACTCCTAATAAAATTCGCAACTTTATTGTTTATTACAT
ATGAACGAATTTCATTTTGATTAAATTAAATTACTAATTTTTCTTGGTGTTCTCAAAAAT
TTAATTGATTTAATTATTAACGATTACACGCGTGAAATTAAACTAAAAGTTAAAATCTTT
TTACTTTGCGGATGAAATTCGTTCATAAAATAAATCCATCAACTAAAAATCTGAGTTAAT
ATTTGATAATAACTAGCGAAATCTATAATAAACAAACTGTTGTGCGATGTTTTTACAGTC
ATGTTGTAACGATTATAATTGAGCCTAAAATATCTTCGATTTTATGATTTTTATTTGATG
GAAAAATGTGTTTATTTTGTACTTTAAATCTGAACTAACTTGATTGGAAATATTAAAATT
CAATTTAAAAAAATGAAAATAATTATTCCTAATTGAAAAAAATTAAATAACTAAATAGCT
ATTTTTATTGTACAATGGAAAATAATAATATTTCCATTTTACTGTTTACTGTATTATTAC
CAATCAAGTTATGTCAGTGACGTTTTTCTTTGTACGATTTCTCATTTTCTTAATTTTCCA
GTTTGGAATGATCGAGGCCGTTATAAAAGGACTTTTTGACGAATTTGCCTTTTTGAGATC
GCACAGAGTCAAATTTTTGGCCGGAATGTGTACTCTGCAGTTCCTTTTGGCGTTGCCGAT
GGTTACAGAGAGTGGTATGTACTGGGTGACTTTGATTGATTGGTATTGTGCTGGATTTTC
ATTGATGTTCGTCGCTCTTTTGGAGATGGTTTGTATTTCATGGATCTATGGAGTAGATCG
TTTCCTCTACGACATCTCTTGTATGATTGGCAAATACCCACCACTCAGTGCCGTATGGAG
AATATTGTGGCTGGGAGTCACACCAACTTGTATCTTTGCTTTGATTATTGCATCTATCAT
TTATTCGTCTCCGGCCACATACAATGATAGGGTTTTCCCAGGATGGGCAATTGGTGTCGG
TTGGCTTTCCTGCATTTTTTCGATCATCATGATTCCCTTGTTGGCTGTATATCAACTCCT
GACACACCCGCGAGCGAAAGGAACCTTCTGGGAGAGAGTTACTGCGCTGATCCAATGTGA
CGATGACTGGGGACCACGTGACCCAAACGTGCCTTACCGGTATCGAAGTAAGAACGCATC
TGTGAAAAGGTCAAGCAAAAGGGACATGATATGTGAAGAAGAAGTTCAACATCTAAACTC
GGACACTACCAAAAGCACAGGCTCTACATCTTCTTCAGGAAATCCTCCTAGTTATCAAGA
TATCAAATCTTGCAAGGCCCGAAAGAAGGACATGTTGGAACTTTCCACACATGTTTATGT
GAATGTTGAAACTTTCCACATGTGTTTATATGTGGATGTTGGAACTTTCTTCATGTGTTT
ATATCTGGATGTTGAAACTTTTCAAGTGTGTTTGTGTTATGACTTTGTGGATGTTGAAAT
TTTCCACATGTGTTTATATGTGGATGTTGAAGCTTTCTACATTTGTTTATGTGGATGTGG
AAACTTTCCACATGTGTTTATGTGGGCGTTGAAATAA
| ProSiteProfiles |
Na/ntran_symport (IPR000175) - T[1-181] 26.686 |
| SUPERFAMILY |
SNS_sf (IPR037272) - T[2-176] 2.62E-32 |
| PANTHER |
Na/ntran_symport (IPR000175) - T[2-178] 5.8E-52 |
| Pfam |
Na/ntran_symport (IPR000175) - T[2-177] 1.4E-38 |
| PRINTS |
Na/ntran_symport (IPR000175) - T[75-95] 1.7E-8 - T[117-137] 1.7E-8 |
| Protein Name | Identity | Bit Score | e-value |
|---|---|---|---|
| SC6A5_HUMAN | 34.653 % | 127 | 3.31E-32 |
| SC6A2_HUMAN | 38.889 % | 141 | 1.64E-37 |
| SC6A1_HUMAN | 33.333 % | 125 | 7.76E-32 |