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  1. Transcript 'Moocci.CG.ELv1_2.S16...'

Transcript Model

Transcript Id

Moocci.CG.ELv1_2.S162754.g03014.01.t

Possible name(s)

EEF2; EFL1; EFTUD2

Location

S162754 [18,339 / 22,783]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 692

>Moocci.CG.ELv1_2.S162754.g03014.01.p
MNKMDRALLELQLDPEDLYQTFNRIVENVNVIIATYAPEDVDIKDPTKFGNIDVHPSKGT
VGFGSGLHGWAFSLKQFAEMYSKKFKIDVEKLMKKLWGDNFFNAKTRKWTTKTDAGSDYK
RGFCMFVLDPIYKAFDCIMNEKTTEVQQLMEKTGIKLKGDDKDKVGKPLLKVFMRLWLPA
GETLLQMITIHLPSPVTSQQYRCELLYEGPQDDEAAKGIRGCDPEAPLMMYVSKMVPTSD
KGRFYAFGRVFSGKVSTGQKVRIMGPNYVPGKKEDLYQKQIQRTILMMGRYIEPIEDVPC
GNIVGLVGVDQFLVKTGTISTFNNAHNMKVMKFSVSPVVRVAVEAKNPGDLPKLVEGLKR
LAKSDPMVQCSIEESGEHIVAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSAE
SDRMCLSKSPNKHNRLFMRCREMEEGIAKEIDDGNIAPRQDAKVRGRLLADSFQWDINEA
RKIWCFGPDTNGPNLLVDCTKAVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGVLSEENMRNIRFDIHD
VTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYACQLTAQPRLLEPVYLVEIQCPENAVGGIYGVLNRR
RGHVFEECQVPGTPMFHVKAYLPVMESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPME
LESKPGQVVTGIRKRKGLNPEIPPLDRFFDKL

Nucleotide sequence

Length: 2,389

>Moocci.CG.ELv1_2.S162754.g03014.01.t
TAGTTATTTCTTGTTATAGGTGTATGTGTCCAAACCGAGACTGTACTTCGTCAGGCCATT
GCAGAAAGAATAAAACCAGTTCTTTTCATGAACAAGATGGACCGTGCCTTGCTGGAGTTG
CAGTTGGATCCTGAAGATTTGTACCAAACTTTTAACAGAATTGTGGAAAATGTTAATGTC
ATTATAGCTACATATGCACCGGAAGATGTTGACATTAAGGATCCCACCAAATTTGGAAAT
ATTGATGTACATCCTTCAAAAGGAACAGTGGGATTTGGTTCTGGACTTCATGGTTGGGCA
TTTTCTTTAAAACAGTTTGCAGAAATGTACTCTAAAAAATTTAAAATTGACGTGGAAAAG
TTAATGAAAAAGCTATGGGGTGACAACTTTTTTAATGCTAAAACCAGGAAATGGACGACA
AAAACTGACGCTGGCTCAGACTATAAACGTGGTTTCTGTATGTTTGTTTTGGACCCAATC
TATAAAGCTTTTGATTGCATTATGAATGAAAAAACAACTGAAGTTCAGCAGTTAATGGAA
AAGACGGGAATTAAATTAAAGGGAGATGATAAGGACAAAGTTGGAAAACCTTTGCTAAAA
GTTTTTATGAGATTGTGGTTACCGGCTGGTGAAACATTGCTGCAAATGATCACTATTCAT
TTGCCATCCCCTGTCACTTCACAGCAGTATCGATGCGAACTCTTATATGAAGGTCCACAA
GATGATGAAGCAGCAAAAGGAATAAGAGGTTGTGACCCAGAAGCACCACTTATGATGTAC
GTTAGCAAAATGGTACCGACATCTGATAAAGGAAGATTTTATGCTTTTGGCCGTGTGTTT
TCTGGTAAAGTAAGCACAGGGCAAAAAGTAAGAATTATGGGGCCTAATTATGTTCCTGGT
AAAAAAGAAGACTTGTATCAAAAACAAATTCAAAGAACTATTCTTATGATGGGCCGATAC
ATTGAACCAATTGAAGATGTTCCCTGTGGAAATATTGTTGGTTTGGTTGGTGTAGATCAA
TTTTTAGTGAAAACTGGAACCATTTCCACTTTCAATAATGCTCATAACATGAAAGTTATG
AAATTCAGTGTTTCACCTGTTGTAAGAGTTGCTGTTGAAGCTAAAAACCCTGGTGATCTT
CCAAAGTTGGTTGAGGGTCTTAAACGATTAGCAAAATCAGACCCAATGGTCCAGTGTTCT
ATTGAAGAGAGTGGTGAACATATTGTTGCTGGGGCAGGTGAATTGCATCTTGAAATCTGT
CTCAAGGACTTGGAAGAAGATCACGCCTGTATTCCTATAAAGAAATCTGATCCTGTAGTG
TCTTATCGTGAAACAGTATCTGCTGAATCCGATAGAATGTGTTTGTCAAAGTCGCCAAAC
AAGCATAATCGTCTTTTTATGAGATGTAGAGAAATGGAAGAGGGAATAGCCAAAGAAATT
GACGATGGAAATATTGCCCCAAGACAAGATGCTAAAGTGAGAGGTCGGCTGCTTGCGGAT
TCTTTTCAATGGGATATCAATGAAGCTAGAAAAATATGGTGCTTTGGTCCAGACACTAAT
GGACCCAACCTGTTAGTGGATTGCACAAAAGCTGTCCAGTATCTGAATGAAATTAAAGAT
TCAGTTGTGGCAGGTTTCCAATGGGCTACAAAAGAAGGAGTTCTTTCTGAAGAAAACATG
CGGAATATAAGATTTGACATTCATGATGTTACTCTTCATGCTGATGCTATTCACAGGGGT
GGTGGCCAAATTATTCCAACTGCTAGACGTTGTCTCTATGCTTGTCAGCTCACTGCACAG
CCACGTTTATTGGAGCCTGTTTACCTTGTAGAAATACAGTGTCCTGAAAATGCTGTTGGT
GGAATTTATGGTGTATTAAACAGAAGACGTGGTCACGTTTTTGAAGAATGCCAGGTTCCT
GGAACACCTATGTTCCATGTCAAAGCATACTTGCCCGTTATGGAATCTTTTGGTTTTACA
GCAGATTTAAGATCAAACACAGGTGGTCAAGCTTTCCCACAATGCGTGTTTGACCATTGG
CAAATTTTGCCTGGAGATCCAATGGAATTGGAATCCAAACCTGGCCAAGTTGTTACTGGT
ATCAGAAAACGAAAGGGTCTTAATCCTGAAATTCCACCACTTGACAGATTTTTTGACAAA
CTTTAAGAGGGTGCGGTGCGCTTGAATATCTGTACAGACACATAACAACCATCTTGATAA
TTTATTATTTTAACTGTTAAGCTAAATTTATTAAGTTAAGTTTCTAATATATGTACAGAG
CTGGTTCCATGCCTTAGCAGTGATCAAAGTTCGTATAATATCGTACTCTTTGCTTTTATG
GGCTATAGCGTGAAAATACTTAAATAAAAACGATGTAAAAACTGAAATA

InterProScan

SUPERFAMILY
P-loop_NTPase (IPR027417) - T[1-193] 7.08E-39
SUPERFAMILY
Transl_B-barrel_sf (IPR009000) - T[194-331] 3.31E-45
Pfam
EFTu-like_2 (IPR004161) - T[244-319] 4.2E-14
SUPERFAMILY
EFG_III/V (IPR035647) - T[334-409] 2.16E-20 - T[576-690] 3.41E-34
SUPERFAMILY
Ribosomal_S5_D2-typ_fold (IPR020568) - T[411-575] 1.72E-64
Gene3D
Ribosomal_S5_D2-typ_fold_subgr (IPR014721) - T[420-571] 6.0E-124 - T[679-682] 6.0E-124
SMART
Transl_elong_EFG/EF2_IV (IPR005517) - T[455-571] 2.5E-26
Pfam
Transl_elong_EFG/EF2_IV (IPR005517) - T[456-571] 1.2E-31
SMART
EFG_V-like (IPR000640) - T[573-662] 1.8E-19
Pfam
EFG_V-like (IPR000640) - T[573-660] 3.0E-21

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
U5S1_HUMAN 38.592 % 537 6.93E-180
EFL1_HUMAN 27.907 % 234 2.31E-65
EF2_HUMAN 74.965 % 1078 0