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  1. Transcript 'Moocci.CG.ELv1_2.S16...'

Transcript Model

Transcript Id

Moocci.CG.ELv1_2.S169368.g03227.01.t

Possible name(s)

CHMP2B; CHMP3; RNF103-CHMP3

Location

S169368 [76,816 / 80,869]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 173

>Moocci.CG.ELv1_2.S169368.g03227.01.p
MQIKQSAKKNDMATCKILAKELVQSKKAVSKIYTAKAQIGSVEMTMKNQAAMVRVSGALE
KSNDVMQIMNKLIKVPEIQQTMQEMSKEMMKAGVIEEMMEDAFDTLDTEEDEEAAQEEID
KVLFDLTAGALGRAPDHVTTDLPEIGEAAAGPSTESDSEEEEEMRQRLEALRS

Nucleotide sequence

Length: 2,054

>Moocci.CG.ELv1_2.S169368.g03227.01.t
AGGCCTATAGCTAAAAAAAAGAACTAAAAAGATGAAAAATGATAAAACTGTGGTTCTGTC
AGTCTGTATCGTGTTTAACTAAAAGTTACAACTGTTAAACAGTTGAGTTTTAATCTGTTA
ATTGCCAATTACATTGCTAAACAGGCAGCACAATATAACGCTTGTTGCATTTGTCATTCT
TTAACTGGATCATTATGGGATTGTTTGGAAAAACCCCTCCCAAAGATCCTAAAATTTTGG
TATGTACCATATAAATACAACATNNATCAAGACTTTTAGACTGGCAGATTAGAGGTGTTC
AGAGAGAACAGGAAAAAGTTAAAATGCAAATAAAGCAGTCTGCGAAGAAAAATGACATGG
CAACATGTAAAATACTAGCAAAAGAGCTTGTCCAGTCTAAAAAAGCAGTTAGTAAAATTT
ATACTGCTAAAGCACAGATTGGATCTGTGGAAATGACGATGAAAAACCAAGCAGCAATGG
TTCGAGTATCTGGAGCTTTGGAGAAGAGTAATGATGTAATGCAAATAATGAATAAGCTAA
TAAAAGTGCCTGAAATCCAACAAACTATGCAGGAGATGTCTAAAGAAATGATGAAGGCTG
GTGTAATTGAAGAAATGATGGAGGATGCATTTGATACTTTAGACACTGAAGAAGATGAAG
AAGCAGCACAAGAAGAAATTGATAAAGTTCTGTTTGATTTAACTGCTGGTGCCCTTGGAA
GAGCGCCAGATCATGTCACTACAGATCTTCCAGAAATAGGAGAAGCTGCTGCCGGCCCAT
CAACAGAATCTGACAGTGAAGAAGAAGAAGAAATGAGGCAACGATTGGAAGCACTAAGAA
GTTAAAGCAATAGTAACAAATTGTTATCGGAGGACTATGAATAAACAAGTTGCATTGATG
CAGAAAATTTGATCTGTAGTCAAATGTAATTTAGGCCTATTTACAGTGATTATGGTATTA
CATTTTATTGTTAATTTAATTCATTTATAATAGATTTTTAATATATCAACAGATTATCAT
TACCTTTTCATAAGTCATTTTGAATATATACAATCAATTTATTTTTAGGTTAGCTATTTG
CTTCTTCATTCAGTAAATTTATTAATGCTCTTATGCAGAGGCAGAACTAGGTTTTATTAA
TAGGGGGGGGGGGATAATATTAGGGATGCCATGTAAATTTTGAGTTTAAACAATCAACAC
TTTTTTAGTTTTATACAACGTTCTGTTGCTTTGACGATTTTTTAATATATGTATAAATAA
ATATAAAATCTTGTTCTTTTTTTAAATATTCAGCTGGACATTGTCCCCCTGGCTAGATCC
GCCACTGCTCTTATGTATTTTTTAGGTCGGTGAGAATAGGTTGGCCTAATATTTTACAAA
TTGCTATTGTTATAAATAAAATCACACGACTCTTACATCATGTTTCCATAGTTTTACATA
CAAATTGAAAGAGTTTAATAAATATTTTTTTCAATGTTATAGATTGGCGTAAATTTTAAT
TTATTTGTTAACCAATATCTTTTTTGTTATTTTGTTAGTCTACACGCAAGGTTAATAACA
ACGTAAAATTAATTTCTTATTACAGTTTTGAAACAATATAGAAACTCAAATACTTATATC
AGATACATAAAAAATGTATTATTGTTTTTAAATTTATCTCTCTTTGCACATTGTTTCTTA
TTTTCTTTGTTTTAAATTTTCTCAAGTAAAAATTGTTATTTAGCACAAGCACAAAATTTT
CATAAACAACTTCAACAAAATTTGGATTTTGTTTACAAATTTTTCACTGTTACAACTTAG
TTTAATAAAATAACATTCACTTTATATACATAAAAACTAATTATGAAACAAAAATTAATT
TAAACAAGTTTAAAGTATTGATTTTGTTTAATATTTGTATTTTGTATATATATTTTCTTT
TCTATATTTTTTCTATGCATTACAAATTGTATAATAAATTCAATTTTTAAATGTTAACAA
AATTAAGGTTTCAGTTATATAGCTTATATTATCTGCTTAGTATTGGTTGCTTGACTTTCC
TATTTACAAAGTCT

InterProScan

Pfam
Snf7_fam (IPR005024) - T[2-139] 1.9E-28

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
CHM2B_HUMAN 30.857 % 72.8 2.64E-16
CHMP3_HUMAN 53.714 % 162 5.33E-51