- Transcript 'Moocci.CG.ELv1_2.S19...'
Transcript Model
Transcript Id
Moocci.CG.ELv1_2.S190583.g03833.01.t
Possible name(s)
TDRD1; TDRD15; TDRD6
Gene model
Location
S190583 [37,514 / 43,442]
Amino acid sequence
Length: 1,975
>Moocci.CG.ELv1_2.S190583.g03833.01.p
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Nucleotide sequence
Length: 5,928
>Moocci.CG.ELv1_2.S190583.g03833.01.t
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AATACTGATGCAAGAAATAGTCAAGTACAGAATATTCCCTCTGTTCCATCTATAATTCTA
ACTTCGGACAGTGGAAAAACATCCCCAATGTTTTTTGATGATTCCTTGTTGTTGGATGAG
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TCCAAAGTTTTATTGCTAAATGAAAGAGAAAATCTGACAAATGAAAGGGAAATAATAAAG
AATATTTTAAATAAACTAACAGAAAGTATAGAAAATAAAGAGAATTGTAATAACATTCTT
GAAAAAGAATGCCAAATTGAACAAAAACAAGCTGGTATTAATAAAGAAAATGTTACGCCA
TTATCAAGCGAACCTTCTCCAATGCCTGATGACGTATTTTATGATACAGTTTATAGTATA
TCTCCTAGTACAGGTGTATCCACAATGGTTGGAGGTATGTTAACTTGA
| Pfam |
Tudor (IPR002999) - T[2-113] 1.1E-18 - T[185-302] 7.9E-15 - T[393-505] 2.5E-17 - T[610-729] 8.2E-10 - T[820-944] 2.7E-14 - T[1034-1154] 3.9E-7 - T[1230-1342] 4.0E-25 - T[1428-1542] 2.7E-26 - T[1652-1750] 4.3E-13 |
| SMART |
Tudor (IPR002999) - T[45-103] 2.4E-9 - T[235-292] 0.98 - T[437-492] 1.8 - T[654-711] 18.0 - T[870-929] 5.2E-4 - T[1083-1144] 2.4 - T[1273-1331] 1.4E-7 - T[1472-1531] 8.3E-14 - T[1682-1737] 7.3E-5 |
| ProSiteProfiles |
Tudor (IPR002999) - T[46-104] 12.517 - T[236-294] 9.838 - T[655-713] 9.334 - T[871-931] 12.376 - T[1274-1333] 15.459 - T[1473-1533] 17.293 |
| Gene3D |
SNase_OB-fold_sf (IPR035437) - T[193-218] 9.1E-20 - T[291-357] 9.1E-20 - T[394-420] 7.0E-25 - T[491-566] 7.0E-25 - T[612-638] 2.5E-13 - T[710-793] 2.5E-13 - T[827-853] 7.6E-19 - T[930-993] 7.6E-19 - T[1431-1458] 1.3E-31 - T[1530-1598] 1.3E-31 |
| Protein Name | Identity | Bit Score | e-value |
|---|---|---|---|
| TDRD1_HUMAN | 23.349 % | 139 | 7.33E-33 |
| TDRD6_HUMAN | 25.537 % | 85.9 | 2.15E-16 |