Aniseed - Transcript Card

Transcript Model

Transcript Id

Moocci.CG.ELv1_2.S191631.g03885.01.t

Possible name(s)

PATL1; PATL2

Gene model

Moocci.CG.ELv1_2.S191631.g03885

Location

S191631 [2,123 / 13,442]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 864

>Moocci.CG.ELv1_2.S191631.g03885.01.p
MDTNFFHLQAETPPLEDGPDPDPDEAIDLLNHETFGSSALEEDWEDEHEQFVVSKNSNTD
LSSSHNFMNEDELEISNQQLAAAVEELVLKSDQDQDAIDPAIVSLRKESRPNTYRTQLDS
DILSPYLNSDISSSSDQTYFLSDGMRSIWGKSPQNVPGEEYGSVKSPLDVHFTKKSPSPI
EDAAIVTAVKSKPRIPNWNQISSNNLSAFLNQSSNARIHKGVLRAEDLEKEFNAANEVRT
PSPTFGISIPKYGPNNQEHPLDRSLPARSVSPVIGSPPAHEMPIGTPPNRLDSKTPINNQ
KVNYRMPPHGARIPPGMQGSQAFMIPRGRGGPPRLGMSLPPQPWPPYPSPRSFPNQRMDM
IHRMEMSRNFPMHHNGRSPSASPVGSPRFGSGPMPVLRPGMPRPFPPNQMHPNFANTPPR
SSGFPPDNRFMPPPPRFSGPGHLHPEHRRFVYMQQQQRNKRFHNNHRNRNNYSGRNRRDP
YSDLMTQKEKDWVIKIQMMALQSDRPEIDDYYYQNYIERQLQRGGLSLDNENSKNKRLLT
PTKANPEHKKYIPVQFKDSLGKLTVSSVYNPRQVIDVVHKSADEEQSETNDSKQASSKRF
EIFKIVEKAYDNLMIIEENNVLLEKPNISPERKLKLTKEINSSKEVLVDLLKINSKTINE
NNDVITHMFLIRKGKRLMARILPYLEKNNTLDIVLCLSKNLTLIIKRDIRDDILSELYNP
MVEFLEGCHLDHLVQIALNITPILNHICKECFGLSFICKLLCLGHKQLDEQNEASDNGKS
WRHFVKCSAVSILALFGEAMKPTSVNLIDKSIAHEIVEVLQWNEEKLLDEGNKNRELAQN
QIKTAAVFFSTLLQDNEENMDKDL

Nucleotide sequence

Length: 3,401

>Moocci.CG.ELv1_2.S191631.g03885.01.t
TTAGATTGTACAGAGAATATTGTAGTATTCTATCCTAAAATTTCATTTGTTACCTATTGT
TAAAAATTGATATGACCTGAAAATGGATACCAATTTTTTTCATTTGCAAGCTGAGACACC
TCCTTTAGAAGATGGTCCTGATCCAGATCCTGATGAAGCTATTGATTTATTAAATCATGA
AACATTCGGATCTAGTGCTCTTGAGGAAGATTGGGAAGATGAACATGAGCAATTTGTTGT
AAGTAAAAATTCCAACACAGATCTTTCTTCAAGCCACAATTTTATGAATGAAGATGAGTT
GGAAATTTCAAACCAACAGCTCGCTGCAGCAGTGGAGGAATTAGTTTTAAAAAGTGACCA
GGACCAGGATGCAATTGATCCAGCGATTGTGAGCTTACGTAAAGAGTCTCGTCCAAATAC
TTACCGTACACAGTTGGACTCTGATATACTGTCACCATACTTGAATTCTGACATAAGTTC
CAGTAGTGACCAAACATATTTTTTATCAGATGGCATGCGCAGCATTTGGGGAAAATCGCC
CCAAAATGTTCCTGGTGAAGAATATGGTTCAGTGAAGTCGCCTCTTGATGTACATTTTAC
CAAAAAAAGTCCTTCACCTATAGAAGATGCAGCTATTGTTACTGCAGTAAAATCTAAGCC
AAGAATTCCAAATTGGAATCAAATATCATCAAACAATTTATCTGCCTTTTTAAATCAATC
TTCAAATGCTCGTATTCATAAAGGAGTTTTACGTGCTGAAGATCTAGAAAAAGAATTTAA
TGCTGCAAATGAAGTTAGGACACCTTCGCCAACATTTGGCATTAGTATACCTAAATATGG
ACCAAATAATCAAGAACATCCATTAGATCGTTCATTACCTGCTAGATCAGTCTCGCCAGT
TATTGGCAGTCCCCCAGCTCATGAAATGCCGATTGGAACTCCACCAAATCGACTTGATTC
AAAAACTCCTATTAATAATCAAAAGGTAAATTATCGAATGCCGCCACATGGTGCACGAAT
TCCTCCTGGAATGCAGGGATCACAGGCATTTATGATTCCACGGGGCAGGGGAGGTCCACC
TAGATTAGGAATGTCCTTACCCCCTCAGCCATGGCCACCGTATCCATCACCGCGAAGTTT
TCCCAATCAAAGAATGGATATGATTCATCGTATGGAAATGTCCAGGAATTTTCCAATGCA
TCATAATGGGCGTTCACCGTCTGCAAGTCCAGTGGGTTCTCCAAGGTTTGGTTCAGGACC
AATGCCAGTTTTACGGCCTGGGATGCCAAGACCGTTCCCCCCAAATCAAATGCATCCAAA
CTTTGCAAACACACCTCCGCGGTCAAGTGGATTTCCACCTGATAATAGATTTATGCCTCC
TCCACCGAGATTTAGTGGTCCAGGACATCTGCATCCTGAACATAGAAGATTTGTTTACAT
GCAACAGCAACAAAGGAACAAGCGTTTTCACAACAATCATAGAAATAGGAATAATTATTC
AGGAAGAAACCGAAGAGACCCCTATTCCGATTTGATGACACAAAAGGAAAAAGATTGGGT
CATTAAAATACAAATGATGGCATTGCAAAGTGATAGGCCCGAAATTGATGATTATTATTA
TCAAAACTATATTGAAAGGCAGTTGCAGCGAGGTGGTTTATCCCTTGATAATGAAAACTC
TAAAAATAAAAGATTGCTTACCCCAACCAAAGCTAATCCTGAGCACAAGAAATATATTCC
AGTTCAGTTTAAAGATTCGTTGGGTAAACTGACAGTCTCCAGTGTATATAATCCACGTCA
AGTTATAGATGTTGTTCATAAATCTGCGGATGAAGAACAATCGGAAACTAACGATTCTAA
ACAAGCTTCAAGCAAAAGATTTGAAATTTTTAAAATTGTTGAAAAGGCTTATGATAATCT
CATGATTATTGAAGAAAATAATGTGTTACTGGAGAAACCAAATATTTCACCAGAAAGAAA
GTTAAAATTGACAAAAGAAATAAACTCAAGCAAAGAAGTTTTGGTCGACTTGTTAAAAAT
TAATTCTAAGACAATAAATGAAAATAATGATGTAATTACACATATGTTTCTAATAAGAAA
AGGGAAACGCTTAATGGCTCGTATTTTGCCTTACTTGGAGAAGAACAATACACTTGATAT
TGTATTATGTCTAAGCAAGAATCTTACATTGATTATAAAAAGAGATATAAGAGATGATAT
TTTATCTGAATTGTATAACCCAATGGTAGAATTTCTTGAGGGATGTCACCTCGATCATTT
AGTGCAGATTGCTTTAAATATAACTCCAATTTTAAATCATATATGCAAAGAATGTTTTGG
ATTGTCATTTATATGCAAGCTATTGTGTTTGGGTCACAAGCAACTAGATGAACAAAATGA
AGCTTCCGATAATGGAAAATCATGGCGTCATTTTGTGAAATGTTCGGCAGTTTCAATTCT
AGCGTTATTTGGAGAAGCAATGAAACCTACATCAGTTAATTTAATTGATAAATCTATAGC
CCATGAAATAGTTGAAGTTTTACAATGGAACGAAGAAAAATTATTGGACGAAGGAAATAA
AAATCGTGAACTTGCTCAGAATCAAATCAAAACAGCTGCTGTTTTCTTTTCAACTTTACT
TCAAGATAACGAAGAAAATATGGACAAAGATTTGTGAGTTAAAAAATTTATCGAGTTTGT
CGATCATGAATAAGATCTATATCGTTACTTAAATATACACTATCTAAACGATAACTAAAA
AATTTGTTTTTCAAAGTTATTATAACTATATTTTACATCAAAACTTTTGTTTAAAGTTGA
TTTTGAAATATTTAATGTAACACCTCAAACACCAAATGTGTACGATTGGAAAAAGTAATC
ATATTTTTGTTTAAGCTAAATTTAGCGTTAATGCAGCATTTGTATTTATTATGTTATTTA
AACCCCCAAACACTACTTTATTGATAGATTACAGGTTTAGGGATGTATGTTACTTGTTAT
AACAAATAATAATAAACAAACAAAACCTATATTCTATTTACTTTANNNNNNNNNNATTAT
TATGTTATTTAAACCCCCACACACTACTTTATTGATAGATTACGGGTTCAGGGATGTATG
TTACTTGTTATAACAAACAATAATAAACAAACAAAACCTATATTTTTGTTTTGTAATATT
ACATTGTATTGTATTGTAATATGGGTGCTCAAACTATTCTTGCATCTTGTAATAATATTA
TCTATAATGTATTATTATTATCTATATATATTATGTATTTCTAAATAAACTAAAATAGTA
TGGTTTAATTATTATTGAATTTTTAGAACGACATATTATATAAAATTATAAAATAGTGTT
TGTTGAATGTTAAGCTAAGTACGCTAATTATATATATATAT

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value
PATL1_HUMAN	39.604 %	190	1.22E-50
PATL2_HUMAN	33.904 %	137	6.97E-34