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Transcript Id

Moocci.CG.ELv1_2.S196951.g04029.01.t

Possible name(s)

GREB1; GREB1L

Location

S196951 [9,424 / 28,754]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 1,907

>Moocci.CG.ELv1_2.S196951.g04029.01.p
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PQNNIEKNPTDFNSNTVSDDNEKEVKPFTGNLQTDPNKSASDKNQTDWEKGPNDKPSTQA
TSSHMVRSLSNSDQDVILSPFVPTPFPTPSVTSTSSQSKSVSNSPDPNTWGQGASMHSQL
PQLVNIENLKEARAEQIKKLQQKQLQTWKLLQQQHLHNAQINNTASIMDPAQRMMPRLTM
GNALPTPPVLSSRADPQRSKTGMNGTPNQQKAIENTNTNTENLPTSPMFRKGFCKGGRDI
RLSTLGINATSVLPYPPDFALVGMTISPSPVLPNQQTQHSTDSMVVVAINLKCLPPCHQD
TANIQGGFFAQCIGCGERCMVSFAVMASHINLRTSTSSVANNVSGSVLLQRHARNFVVRS
TQPPHALVRGASIPWSWNLDGRPSNMAGRSGTDALNQNRISNNLPLLVAPYVNMYMARAR
AAQQQTGNNSTIPNNNMLYPSIVNNLNQPMDINDVSKMSQKLAESENNSKSSSSPILINS
PDISSPSREGSEPFIPPNISSILKYPPVLLSIIPNSAFDVTQPLKNISDDVYYSIIFQEK
FEKIIKSSNLDVLPTSLQSKIHCLLFVLYLSSLDFFEPLSESSYAIFAHRFLVQHSSKFV
RMVENISSQNTVSLSQLMVTDSLINFHISPVSLHHAMCLCFNNITHGYKSTFQLILHVND
SIIDGMVLLITDKIVSRFTKECLTIKQSPIINNIANIKEIIMDSSKEFEDILDKLSSVIP
PQNISEQSESDEEKSLIIDDEAAHNASVNVNNVRQQEFLRAQSYSQYSCSAVMAEQLSQH
IIKVLENKATDFNLESFNKVDCRFFLSSHQSCLTQTEAAIYSSNLCKIMNPGQVLDASKF
IFMPNSKTHKFLSLCELIKQNESTLFVIFYFPQNKTTIASQSSEEQNDNLSMLYKLSTQN
ILFIRCHDNLNYQEKNLNCLQFKLNNSANYFSFSNHCALLLPQDKPQTILFDEQHQSVWR
STLLRYQDIHTTDVCTATVIHEYVTAMLKVGCLSVKPKSIALEDSRFASNTTNSISFIME
LMTQQCISVVLRIPSVITATLAFLQLREMHNKLGLHKKFEIMLYNTSARLSLSKPYLKIL
QEQNGKDCSWKPSSLSEISTIPVLIIYSASVKSEMSIASGFYKLQKQTLRRSYLEMQSKS
EIVSPPSKRKRLSEDEDIDKKEKQDGKLSWKSLADESSAMSNNEINGITKSEKEEVKDIK
DEEAENISPTQIIVPKPPIPPVVLLPKVVYNLCKKYDKFDEDLRNCSSVESSPLNLSPKT
KSSCLEVNIEIPPRSGFVSACCMFLEKFHAHWKELVQIEVYDHPYKQKVNNNMFTVHLLP
GEEPLYPFTADIYANGSSLMWPDLTLLQDMPFDAFLPHYNHREQSRIVCSSLNNEDTKDE
EEDGVASQKSVLVMPGNFSAFDKSHRNCSMCKSIHDQESTAQVYSLSIPDVDSKLLPEDV
DNLVIEFLIPNFHTSKFIFEQADLLSIQFPKSSKNEIKTPVLSFALSGSTCGLFNLDHTL
SKDRLHIIVVRNRDADEYRKNWPDHVLMILPEEFDDFGIGGMKFAALEVFSHCYEVECSR
AETIDDIVWPFVLFLDDDCAIWWKYKQTETIEDNMENCSWEKTSLSEIITRFENTTDATK
YAALGVAPWSSSLPEPNSITNNFCNAFSNCLLSSCYSINLNLVKGIQFKYTMFTNEDIDW
SLSVHNQNLLTVSFNDLAVSIKVIETRDIANVLDRSSALVSVADSDFELIDLHPRLLLDI
YFSREGYSVFNESSRKNPVLIVDGYTSFGPQVFVEVVSSLNKSVDTSKSYSGLFLNSLPA
DFSDDFLQQFNFIKVLFYSIPISPQCISLPPTTITEYFLTKPVTECS

Nucleotide sequence

Length: 5,943

>Moocci.CG.ELv1_2.S196951.g04029.01.t
TTGTTTTAGTATTACACAAGTATAAAAGCCGTAGTCATGATGTAGGTTTGGAATATTTTA
ACTTGTTTAAAACTGCATTAATCTACCTCATTATGAATGCAAATTTTGTTTGAACCATGC
TCTTTCTATTGCTAATTCAACAATTTCAAATTATTATTCTTTACCTATTTAACATCAAAG
AGCTCCGTTGTAACAAGATAAAACGGGGCAAGCAGACTAATGCGTTCCAAAAATTTAGTT
CCTGTACAGATTTTAGTACCCAGTGAACACATGGGAAACAAACAGTCTGTTCACAAAGCG
GCATTTGAAGAAGCGCTTCATTCAACAATAGAAGCTAATCTACGAGCCTCTGGTGTATCT
CCTAGTCATATATTTTCATCTCTTTACCTCCAATCACTACCTCAAAATAATATCGAAAAA
AATCCAACAGATTTTAACTCAAACACTGTTTCAGATGACAATGAAAAAGAAGTAAAACCA
TTTACTGGAAATCTTCAAACTGATCCAAATAAAAGTGCAAGTGATAAAAATCAAACTGAT
TGGGAAAAAGGACCAAATGACAAGCCATCAACACAAGCTACTTCATCTCATATGGTTCGA
AGCTTATCAAATTCTGATCAAGATGTTATATTATCACCGTTTGTTCCTACTCCATTTCCT
ACACCATCAGTTACCTCTACAAGCAGCCAATCGAAATCGGTTTCAAACTCCCCAGATCCA
AATACATGGGGACAAGGTGCCTCAATGCACTCTCAACTGCCACAGCTTGTAAACATTGAG
AACTTAAAAGAGGCTCGTGCAGAACAGATAAAAAAACTGCAGCAGAAACAACTTCAAACT
TGGAAGTTATTACAGCAGCAGCATTTGCACAATGCCCAAATAAATAACACAGCAAGCATA
ATGGATCCTGCTCAGAGAATGATGCCTCGCTTGACAATGGGTAATGCTCTTCCTACTCCC
CCAGTTTTGTCTTCCAGAGCTGACCCACAAAGAAGCAAAACTGGAATGAATGGTACACCA
AATCAACAGAAAGCAATAGAAAATACCAATACAAACACAGAAAACCTTCCAACATCGCCA
ATGTTTAGAAAAGGATTTTGTAAGGGTGGAAGAGACATTCGACTGTCAACTTTAGGAATC
AATGCTACATCAGTTTTACCTTACCCACCAGATTTTGCCCTTGTTGGCATGACAATATCC
CCATCACCGGTTTTACCTAACCAACAAACTCAACATTCAACAGACAGCATGGTTGTTGTA
GCAATAAACTTAAAGTGTTTACCGCCCTGTCATCAAGACACGGCAAATATTCAAGGAGGA
TTTTTTGCGCAGTGTATTGGATGTGGAGAAAGATGTATGGTAAGCTTTGCAGTGATGGCT
TCCCATATAAATTTGCGAACTTCTACATCTTCTGTTGCTAACAATGTTTCTGGAAGTGTC
CTTTTGCAACGCCATGCCAGAAATTTTGTAGTTCGATCTACGCAACCCCCACATGCACTA
GTTCGTGGGGCTTCTATTCCTTGGTCTTGGAATTTAGATGGACGTCCATCTAATATGGCA
GGTAGATCAGGAACAGATGCTCTGAATCAAAATAGAATCTCAAATAACTTGCCATTACTT
GTTGCGCCTTATGTAAACATGTACATGGCGCGGGCACGTGCTGCACAACAGCAAACTGGA
AACAATTCAACAATACCAAACAACAACATGCTTTATCCAAGCATTGTTAATAATCTCAAC
CAACCTATGGACATAAATGATGTGTCGAAAATGTCTCAAAAGTTGGCTGAAAGTGAAAAT
AATTCTAAATCATCATCTTCCCCTATTTTAATAAATAGTCCAGATATTTCGTCACCCTCA
AGAGAAGGGTCCGAACCTTTTATTCCCCCAAATATTTCATCAATTTTGAAATATCCACCA
GTTTTGTTATCAATAATACCAAATTCAGCATTTGATGTTACACAACCACTCAAAAACATT
TCTGATGATGTATATTATTCTATTATTTTTCAAGAAAAATTTGAAAAAATTATTAAAAGC
AGCAATCTTGATGTCTTACCTACCTCATTACAAAGCAAAATCCATTGTCTTCTGTTTGTA
CTTTATCTTTCTTCGTTAGATTTTTTTGAACCTTTATCTGAGAGTTCCTATGCAATTTTT
GCCCACCGATTTCTCGTCCAACATTCTTCTAAATTTGTTCGCATGGTAGAAAACATATCT
TCCCAAAATACAGTGTCACTTTCTCAGCTTATGGTCACAGACTCTTTAATTAACTTTCAT
ATTTCACCGGTTTCATTGCACCATGCAATGTGTTTATGTTTCAACAATATCACTCATGGA
TACAAATCGACTTTTCAACTTATTTTGCATGTTAATGACAGTATTATAGATGGCATGGTG
TTACTTATAACAGATAAAATTGTATCACGTTTTACCAAAGAATGCTTGACAATCAAACAA
TCACCAATAATTAATAATATTGCTAATATCAAAGAAATTATTATGGATTCTTCAAAAGAA
TTTGAAGATATATTGGATAAATTATCTTCAGTTATTCCACCCCAAAACATCTCGGAACAA
TCCGAGAGTGATGAAGAAAAAAGTTTAATAATCGATGATGAAGCAGCTCATAATGCAAGT
GTCAACGTAAACAATGTTCGACAGCAGGAGTTTCTAAGAGCTCAGTCATATTCTCAGTAC
TCTTGCAGTGCTGTTATGGCAGAACAGTTATCACAACATATTATAAAAGTGCTTGAAAAT
AAAGCTACAGATTTCAACTTGGAAAGTTTTAACAAGGTAGACTGCAGATTTTTCCTTTCC
TCACACCAAAGCTGTTTGACACAAACTGAAGCTGCAATATATTCTTCAAATTTGTGCAAA
ATTATGAATCCTGGACAAGTATTAGATGCTTCCAAGTTTATTTTTATGCCAAACTCCAAA
ACACATAAATTTTTATCACTGTGTGAACTGATCAAACAAAATGAATCAACTTTGTTTGTT
ATATTTTATTTTCCTCAAAACAAGACAACAATTGCATCACAATCCTCTGAAGAACAGAAT
GACAATCTATCCATGCTGTATAAACTGTCAACACAAAACATTTTGTTTATTCGTTGTCAT
GACAACTTAAATTACCAAGAAAAAAACCTTAATTGTCTTCAGTTTAAACTTAACAATAGT
GCAAATTACTTTAGCTTTTCCAACCACTGTGCATTACTTCTACCTCAGGATAAACCGCAG
ACAATTTTGTTTGATGAGCAACATCAGTCAGTGTGGAGATCAACTTTGTTAAGGTATCAA
GATATACACACAACTGATGTGTGTACTGCAACTGTAATTCATGAGTATGTGACAGCAATG
TTAAAAGTAGGTTGTCTCTCTGTTAAACCCAAGTCAATTGCCCTTGAAGATTCTCGTTTT
GCTTCAAACACAACAAACTCTATTAGTTTTATAATGGAACTGATGACGCAGCAATGTATA
TCCGTTGTATTACGTATACCATCTGTAATAACAGCCACTCTAGCGTTTCTACAACTGCGT
GAGATGCATAACAAGTTGGGATTGCACAAAAAATTTGAGATTATGTTGTACAATACAAGT
GCAAGACTAAGTTTGTCCAAACCATATTTAAAAATTCTTCAAGAACAAAATGGGAAAGAT
TGCAGTTGGAAACCATCATCATTGTCTGAAATTAGTACAATCCCTGTGCTTATAATATAT
TCTGCAAGTGTAAAATCTGAGATGTCTATTGCTTCGGGATTTTATAAATTGCAAAAACAA
ACACTGCGGAGATCCTACCTTGAAATGCAATCAAAGAGCGAAATTGTTTCGCCGCCGTCA
AAAAGAAAAAGGTTGAGTGAAGATGAAGATATTGATAAGAAAGAAAAACAAGATGGTAAA
TTGTCATGGAAAAGCTTAGCAGATGAAAGTTCAGCCATGTCAAATAATGAGATAAATGGC
ATTACCAAGAGTGAAAAGGAAGAAGTTAAAGATATAAAAGATGAAGAAGCAGAAAATATC
TCTCCAACACAGATTATTGTACCAAAACCTCCAATTCCACCTGTTGTTTTACTTCCTAAA
GTGGTTTACAATTTATGCAAGAAATATGATAAGTTTGACGAAGATTTAAGAAATTGTAGT
TCTGTTGAAAGTTCTCCTTTAAATCTTTCTCCAAAAACAAAATCTAGCTGTTTGGAAGTC
AACATCGAAATTCCCCCTCGAAGTGGTTTTGTGTCTGCTTGTTGCATGTTTCTTGAAAAA
TTTCATGCCCACTGGAAGGAGTTGGTTCAAATTGAAGTCTATGATCATCCTTACAAACAA
AAGGTAAATAATAACATGTTCACTGTCCACCTCTTACCTGGTGAAGAGCCTTTATATCCT
TTTACTGCCGATATCTATGCAAATGGATCAAGCTTAATGTGGCCGGATCTAACGTTACTA
CAAGATATGCCATTTGATGCATTCCTACCTCATTATAATCACAGGGAACAGAGTAGAATT
GTTTGTTCTTCATTAAATAATGAAGATACTAAAGATGAAGAAGAAGATGGAGTAGCATCA
CAAAAATCAGTGTTGGTGATGCCGGGAAACTTCTCAGCCTTTGACAAAAGTCATCGGAAT
TGTTCCATGTGCAAAAGCATACATGATCAGGAGTCTACTGCACAAGTGTATTCTTTATCC
ATACCCGATGTTGATTCAAAACTTCTTCCAGAGGACGTAGACAATTTGGTTATTGAGTTT
TTAATTCCAAACTTTCACACGTCAAAATTTATCTTTGAACAAGCCGATTTGTTGTCAATT
CAGTTTCCAAAATCGTCCAAAAACGAAATAAAAACTCCAGTGTTAAGTTTTGCATTAAGT
GGTTCGACTTGCGGACTCTTCAACCTTGATCATACTCTGAGTAAGGACAGGTTACATATA
ATAGTCGTTAGAAACAGGGATGCTGATGAGTATCGAAAAAACTGGCCAGACCATGTTCTT
ATGATTTTACCAGAAGAATTTGATGATTTTGGAATAGGTGGAATGAAGTTTGCAGCACTG
GAAGTGTTTTCACATTGTTATGAGGTTGAGTGTTCAAGAGCTGAAACGATTGATGACATT
GTGTGGCCGTTTGTTCTGTTTTTAGATGACGATTGCGCAATATGGTGGAAGTACAAACAA
ACAGAAACGATAGAGGATAATATGGAAAATTGTAGCTGGGAAAAAACTTCATTATCAGAA
ATTATCACAAGATTTGAGAATACAACGGATGCAACCAAGTACGCAGCATTAGGCGTTGCG
CCGTGGTCATCTAGTCTTCCAGAACCAAACTCCATAACAAATAATTTCTGCAATGCATTT
TCAAACTGTCTTTTAAGTTCTTGCTATTCAATTAATCTGAATCTGGTGAAAGGTATCCAG
TTTAAGTACACAATGTTTACAAATGAAGACATAGATTGGTCTTTATCTGTCCACAACCAA
AACTTGTTGACTGTTAGCTTTAATGACTTGGCTGTTTCTATTAAGGTCATAGAAACAAGA
GATATTGCTAATGTATTAGACAGGTCAAGTGCATTAGTAAGTGTTGCAGATTCAGATTTT
GAATTAATTGACCTTCATCCACGTTTATTACTTGATATATATTTCTCTCGAGAAGGCTAC
AGTGTTTTTAACGAGTCATCAAGAAAAAATCCCGTGTTAATTGTGGATGGTTATACTTCT
TTTGGACCGCAGGTATTTGTAGAAGTTGTCAGTAGCTTGAATAAATCAGTTGACACATCA
AAATCTTATAGCGGATTATTCCTGAACAGTTTGCCAGCTGATTTTTCTGATGATTTTTTA
CAGCAATTTAATTTTATTAAAGTTTTGTTTTATTCTATTCCAATCTCGCCTCAATGTATT
TCATTACCTCCCACAACTATCACAGAGTATTTTTTGACTAAACCTGTAACAGAATGTTCC
TAA

InterProScan

Pfam
GREB1 (IPR028422) - T[18-82] 1.1E-6 - T[289-529] 3.6E-17 - T[964-1168] 2.2E-13 - T[1332-1874] 9.7E-66
PANTHER
GREB1 (IPR028422) - T[18-1168] 3.4E-129 - T[1175-1298] 3.4E-129 - T[1332-1874] 3.4E-129

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
GREB1_HUMAN 27.036 % 181 1.69E-45
GRB1L_HUMAN 25.303 % 187 1.78E-47