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Transcript Id

Moocci.CG.ELv1_2.S356276.g09702.04.t

Possible name(s)

KHDRBS2; KHDRBS3; QKI

Gene model

Moocci.CG.ELv1_2.S356276.g09702

Location

S356276 [24,953 / 35,578]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 301

>Moocci.CG.ELv1_2.S356276.g09702.04.p
MLSVWNLRRRINDVFLFITEIVKIRSVLFQNGDKQPLELPTPTGSVMTLTEKVYVPVKDH
PEYNFVGRILGPRGLTAKQLEQETKCKIMVRGKGSMRDKKKEEMNRGKPNWEHLNDELHV
LITVEDTENRARLKLQRAVDEVKKLLIPAEGEDDLKKRQLMELAIINGTYRDHSSSIKGQ
PRIITGPAQMITGPALRSPPPGQPPLGMISSTPMVTRLPTGQTILSNQPTNQLFGHAVAD
GGLYYTQLDYPYTHINPTGASLLEYSLADPNSLIGTPGAKLVRQRPDPRAHPYQRAPAAT
N

Nucleotide sequence

Length: 3,299

>Moocci.CG.ELv1_2.S356276.g09702.04.t
ATGCTTTCGGTTTGGAATTTAAGAAGAAGAATTAACGATGTCTTTTTATTTATTACAGAA
ATCGTCAAGATTCGATCAGTTTTGTTTCAAAACGGAGATAAGCAACCTCTGGAGCTTCCA
ACTCCTACCGGATCTGTGATGACTCTGACGGAAAAAGTTTACGTTCCTGTGAAAGATCAT
CCCGAGTACAATTTCGTTGGACGAATTCTGGGACCTCGCGGTTTGACGGCGAAACAATTG
GAGCAAGAAACGAAGTGTAAGATTATGGTGAGGGGCAAAGGATCTATGCGTGATAAAAAG
AAGGAGGAAATGAACAGAGGCAAACCAAACTGGGAACATCTGAATGATGAGCTTCATGTA
TTAATAACAGTTGAAGACACAGAAAACCGAGCCAGACTTAAACTGCAGCGAGCAGTTGAT
GAAGTTAAGAAACTTCTTATACCTGCGGAAGGAGAAGATGATCTAAAGAAAAGACAGCTA
ATGGAGCTGGCCATTATTAATGGAACTTACAGAGATCATTCAAGCAGTATCAAAGGACAA
CCACGAATTATCACTGGTCCTGCGCAAATGATAACTGGACCTGCCTTAAGGTCACCACCG
CCTGGACAACCACCACTAGGCATGATTTCATCTACTCCTATGGTTACCAGATTGCCTACT
GGACAGACGATTTTGTCAAATCAACCAACTAATCAGTTATTTGGACATGCAGTAGCAGAC
GGAGGTCTTTACTACACTCAACTTGATTATCCATACACCCACATTAATCCAACAGGGGCT
TCTTTGTTAGAATATAGCTTAGCTGACCCTAACAGCCTTATAGGTACTCCAGGCGCTAAG
TTAGTTCGCCAACGACCAGATCCAAGGGCACACCCTTACCAAAGGGCGCCAGCTGCGACT
AACTAAATCCACAACTGACTTAAATTTTATTTGGTATAAAAAATTTGTTTAATGTCAGAT
ATTCACTCATATTAATTCATGCTTTAAAGCAATTGAACTATAGTCAACAAAGTTACCTAA
GTTTTTATCCAATGTGCTTTTTACTTTTGCTACCTACTATACCATATTATATCACTACTA
AATGCAAATGTTAGTTTCCTTGATTGACACATTATTACTAATTGTCACATCACATCCACA
ACTGCACATGATTAAGTGCCTTGATAACTTTTAAAAGTATTGTATTTTATAGTTATTCAT
GAATGAATGATTGGTTGTTCTATCAAGTTAGTTCAATAATTTATCCCCTTTAAAACATTG
TGCCTTGATGAATGATTGAACACGAGTGTGCCATGTTATGTAACTATATAAACACCCTTG
TTATTGTGTGATTGTTTATTGTTACACCAACAGAATTTTCATCCTAGTGATTACATCCAT
CCCCTCCCCTACCTTTACCTCAAACAGACAGTGCTCGGCATGGAAATGTTAACATTGGTC
CCATATTTGGTGACGTAGAGAGACTGCAATTGGCGCTCTTCTAACATTCCTAATCATCTC
ACACATCCTCGGTATTGCTTGCTGCTAACACCTGGTAAGCATGCATCTATAATGATGTAT
ACGTTGCTAATATTCAGTATACCTGTAGCCATTCAATCTGTGTTACCACCAAAATCTGGT
TCAATTAACATAATCAATAGCAATTGAGATCCGATGTGGTGCTGGAACAACTCAGTAATT
TTTCCTGATTTGTTTTATATTTTTAGCGACAAAATTTTATATTTGTTTTGAACAACCATC
TTATAGTCAAGATATACAAATTTTTCTATTGGTGTTTTAATATTACTTTTTTTTCTACTT
CATTATTTTGATTTATGAAGTTCACATTCACTATTGCGAACACTATCTCTTGTAAAAGCC
GATACTTGCCCATTTGTTTAACAAACCATTAATAATTTTCCAATAAAAATATTAACATTT
TGTAGGCTAACCTTTAACCTACATAAAGATTTAATAAAACTAAACAAGAATTTTATCATA
CCAGTGTTATGAATATAGTTTATGTATTATTGCATCTTATAGGCATATTTCCACGCCTAC
ACTTGTCCATACCATAGTATATATTGCATCAGCGTTGCCTTCCATTATTATGTAACAATG
TATAACAAAACTCACTTAATCTTTTTTTATATTACTTTATGTATTATTTTAAGTGTTTTT
AATTTTATACACTTAGTCTGTAGTATTCAAATTACTTTAATAATCACATCAATATGTTTA
GATAGTATATATGCTATTTTTGTATGTTTCTAAATAAATTTTATTCTATTTGTCAATTTA
TTCAAATACTTTTATAGAGTGTGTGACAAAATTTATTCTCATGTCATGTGTTTAAGATAA
CAATTATCATGACACAAATATATTCATTATTATTGTATTTAATGCAAATTGTGTGACCAA
TATTTTCCATTCCTAAGCATTGTATTGTATTTTGTTATTTTTGTGTTTATTTTTTTTATT
TTGTATTTGTTCCCATGGTAAATCAACAGTAGCTAAAAGGCTACAATATACCTTTTTAAA
TGTATGTAATGATTTATTATGAATTTAAATCAGGATAGATTTAGATGGATATCTTTTAGA
ATTAAGGATTGTTAACAGTCATTGTGATATTGGTGTAGTGTTTTTTGCATGAAATTTATT
AACAAGCAAATAACTTTACTAATTTTTCTAGAACATAATTATTTCTCACATTTAAATAGT
CTGGTTAATAATTAAAAAACCAATTAAAATATCAAGAGCCCTTTTTAAAAGTAAAATTAA
TAAAAACTTCTAATTTTTAATTATTTATACTTGTAAAATAAAAACTATTTTAGCTGAGAA
ATAATTAATTTCTATGATTGCATTTTGTTCCTTTATGTTAACTTAATCTGAAGCACAACC
CAATGAAACAACACTTTCTTTTTTATACTAAGATTTTTTGTAAATTACAACATTTTCTAC
TTATTCTAATGAAGCATTTGTAAACACTTATGATACATTTACTTTGGGCTATATACATTT
TATTAAAACCTTAATTTCAAATTTAAATTCATTTGTACCTTATAGGGAAAAATTTATCTT
TTAAGGTTTAATTAAGTATATGACAAAAATTTGAGTGCATCATAAATTGTTAAAATTCCA
AGGCATGATGAAACCATGATAATCATATAAAGAAGTTATATTGAACTAAGTGTACTAATA
ATGTAATAGCTAATCATAAATAACCAAGTGTTTTATTACCACGCTTAATTCACATATTTT
AATCTAACCTGTTTTATGCTTGTAAATATTAATAAACCAGTGTATGTTTGCTTTTAATA

InterProScan

Gene3D
KH_dom_type_1_sf (IPR036612) - T[5-178] 6.1E-68
SMART
KH_dom (IPR004087) - T[47-147] 2.8E-9
SUPERFAMILY
KH_dom_type_1_sf (IPR036612) - T[49-171] 1.58E-32
Pfam
KH_dom_type_1 (IPR004088) - T[52-101] 4.4E-6

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
KHDR1_HUMAN 50 % 118 3.2E-30
KHDR2_HUMAN 41.026 % 121 3.87E-32
QKI_HUMAN 52.525 % 274 4.57E-91