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Transcript Model
Transcript Id
Moocci.CG.ELv1_2.S401897.g11820.01.t
Possible name(s)
STRN; STRN3; STRN4
Gene model
Location
S401897 [1,361 / 17,221]
Amino acid sequence
Length: 756
>Moocci.CG.ELv1_2.S401897.g11820.01.p
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DRHIKFFDNNAGKLIHSMVAHLDSVTSLAVDPNGLYLLSGSHDCSIRLWNLDSKTCVQEL
TSHRKKFDESINAVAFHPSASYIASAGADALAKVFV
Nucleotide sequence
Length: 3,563
>Moocci.CG.ELv1_2.S401897.g11820.01.t
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AATGGGAGCTTGAAAAGGCTGAATTACAGACAAGGATAGCGTTTTTACAAGGTGAACGCA
AAGGGCAAGAAAATTTAAAGCGAGATTTAATTCGTCGCATAAAAATGCTTGAATTTGCTC
TTAAACAAGAAAGAGCAAAAGTACACAAGTTGAAGTTTGGTACAGATGCTCCCATTGAAC
AAAGTGGATTAAATGAAAATCAAGGAATAGAAGATTCTAAATTAAATGATGATATGATGT
CAAATTCACAAATGTCATGGAGACAAGGTCGCCAATTGTTAAGACAATATCTCCAAGAAG
TTGGTTATACAGACACAATATTAGATGTAAGATCGCAGCGTGTCAGAGCGTTGCTAGGTA
ATTTTGAACCAGCTTCATCTAATCATCAAGAAAAAGAAGAAGTTCGCATGGTTAATGGAC
TTGCACTCGATAAAGACAAGTCACCCAAATCTATTAGTGAATTAAGAGCAAGTCTTGGTG
TTAAAGAAGGAACAGAATCCGATGTGCTTGCAAACTTTGAGTTTTTGAGTTCTGCTATAG
AAGATGAAGAGGAAGAATCAGAGTTTAGTAACAGGGATATTGTCGAGGATGAACTGGATG
GAAATGCTATTGATGCTGGAGGGGATCAACAACGAAAAGCAAGAGCCAACAACATGCTAT
TGGATGGTGAAGATGAAGATCATGAAGATGAGAATCCTGACACCGAAACTGCTTTGTCGG
AGTTTGATTTTCTCTCATCAAGTAGTTATGATATGGATACGAAACTGACAGATTGGCCAG
TGGACCAAAACAAATTGAATGCCAAGAAGGAGCAGTTTAAAATGGAAAAGAAACATTCAA
AGAAAAAAGGTTTGCACCGACCAGTAAAAAAACACTTGCAGACGATGATTGATACATTAA
GAGGAACTGCTAATGATGAATCTAGTCCTTCAAGGTTGTCTGAAATGCAGATGCTTCGAC
CCGAAAACGATTCTTTACCTTTTACGGTGGGAGGAACAAGAAATTCAGTAGGTGATGATT
CTTTGGAAAGCGCTCTTGGCTTGGGGGAGCTTGCAGGTTTGACCGTTGCAAATGAGGCAG
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CTGGAATTATCACAGCTTCAGAAGATCGCTCGTTAAAGCTATGGAACTTAAACAAAACAG
TTTCCAGCAAGAAATCTCAAGCACTTGACGTTGAACCTATTTATAGTTTCAGAGGCCATA
CATCACCGGTATTATCACTTGCCATAGATTCGGCAGGGGAAGTTTGCTTTAGTGGTGGTG
TAGACTCGAGTATTAGAACGTGGAACATTCCTAGTCAAAATATAGATGCCTTTGATCAAT
ATGTTCCTTCTGTTGTGGGTAAGATGTTGGTGGGCCACACTGATGCTGTCTGGAGCTTGT
GTTTCTCCGGTACGCGAAATCAACTTCTCTCCGCATCAGCAGATTCAACTGTTCGATTAT
GGGACCCTCAGTCTAATGACCCACTTCTAAGAACGTTTACCAGCTCTGATGGTTCAATAC
CAACATGCGCTAAGTTCATTCATTGCGATTCCGGGCAGGCAGTGGTCTCGCATAACGATG
GAAAAATAGTTTTATATGACCTTGAAACAGGTCAGATTCCCGCAACACTAGCTGATGGAG
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ATGACGATCGACATATCAAGTTTTTCGATAATAATGCTGGAAAATTAATCCATTCTATGG
TGGCTCATCTGGATTCTGTGACCAGCCTTGCAGTTGATCCAAATGGCCTCTATCTGTTGT
CTGGAAGTCACGATTGCTCGATTCGGTTATGGAACTTGGACAGTAAAACTTGTGTTCAAG
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AATCAGGAGTTCCTAAAGTTGTCCGTGTAGCTATGCTTATAGTTGCAATCATATCTATCT
GTGCTCTTAGACGCTGCTTGTCACAACCAATTTGAAAATTTTTCATTCCATATTTGGACT
CAAGTGATGAGTACACTTAAGTGCTACTATGTTCCACACTGGACAAGAACAATTAATACA
TTTTATGTTCACAGAAGATAATTATATTATGTTTCGCTGTTTCTTATCATCAAATTCACA
TTTCATTTTACTGTGCTATATATTAATTATTCTTATTAATTATTATTGCTATTATAATTA
CTGTAGATAGAATATGTTGTGATTTAAAATTATCCGGTCTTTTTTACAAGTGAATTATAT
TTACTGAGAAGTGTATATTTCTGTTTAATGCTGATGAATACCTCTGCTACACTTTATTTT
CAAGTTAAAATATTTTTCACTTTTCTGTCTTGTACAGAAACGAGCACACCCGATATACTT
TTACAAAATATTTGAACTTTTTGTATAACTAAACAGGTTTTTATGTTCACAGAGTTATAA
CTAATAATATTTTTGTTAATATTCAACCATATTGATTTTGCCCTACACCAGTGGTTCCTA
ATACTTTTTTTTCCAACACTACACACAATCAGCTAGTTAAAATTATTTTGATTGTAAAGA
ATTGTTAAGCGGCAAAATATTAAAAAATTTTATTGCATAAACTTTGCAGTGTTTCAGCTC
TAAGTAAATACTATAAAGTTAGTATGTGGGAATGGTCATTCGGAACCACTGAAGTTAATT
TTCTTAAAACAGCACAAGACTTGTCTTAAAACTTGTTTTCCTGTCAGTTTCAAGGTGAAA
ACGTCATCAACTAACAATTCAACAGTGTTTTATGTTGACAAAAATCACTTACTCGAATAA
ATTTGTTCATCAGTACTTATCAA
| Pfam |
Striatin_N (IPR013258) - T[38-167] 3.0E-45 |
| Gene3D |
WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf (IPR015943) - T[430-542] 1.7E-18 - T[543-604] 6.3E-12 - T[605-755] 4.9E-37 |
| SUPERFAMILY |
WD40_repeat_dom_sf (IPR036322) - T[434-755] 3.05E-66 |
| SMART |
WD40_repeat (IPR001680) - T[435-474] 9.4E-6 - T[488-527] 2.1E-7 - T[541-580] 3.8E-9 - T[584-625] 6.0 - T[628-668] 1.0 - T[671-710] 6.6E-10 - T[713-756] 1.7E-4 |
| Pfam |
WD40_repeat (IPR001680) - T[438-474] 5.3E-4 - T[490-527] 8.5E-4 - T[547-580] 1.1E-5 - T[672-710] 1.1E-8 - T[715-750] 0.0076 |
| ProSiteProfiles |
WD40_repeat (IPR001680) - T[442-483] 13.282 - T[495-528] 12.313 - T[548-589] 14.986 - T[678-719] 15.722 |
| ProSiteProfiles |
WD40_repeat_dom (IPR017986) - T[442-756] 45.137 |
| PRINTS |
G-protein_beta_WD-40_rep (IPR020472) - T[461-475] 3.2E-7 - T[567-581] 3.2E-7 - T[697-711] 3.2E-7 |
| ProSitePatterns |
WD40_repeat_CS (IPR019775) - T[461-475] . - T[514-528] . - T[697-711] . |
| Protein Name | Identity | Bit Score | e-value |
|---|---|---|---|
| STRN3_HUMAN | 52.995 % | 725 | 0 |
| STRN_HUMAN | 50.785 % | 687 | 0 |
| STRN4_HUMAN | 55.866 % | 411 | 6.28E-133 |