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Transcript Model
Transcript Id
Moocci.CG.ELv1_2.S413272.g12400.01.t
Possible name(s)
ABCD1; ABCD3; ABCD4
Gene model
Location
S413272 [31,026 / 33,690]
Amino acid sequence
Length: 609
>Moocci.CG.ELv1_2.S413272.g12400.01.p
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IPSQYYIVLGEKDKDGFRSLTIYAMEMIILNAIMKSTMTYLSKILYLIWRRNLCLYFHKN
YFSEINFYTLNVIDTKYDNMDQRFTRDVDKQCYEWSLLISKLIIVPFTMIYYSYKCFVST
TYWGPVIIYIYFICGTIINRFLMVPVVKETIKQEKCEGEFRFQHLQVRVNAESIGFYNSG
YTEKYKTNKRLYKLLSTQKSLFGWSYWLNTSVNIFDYTGGILSYLIIAIPVFAGDYDDLT
SEELSAEISKNAFVCIYLVYTFSQLFDMMRVISDIAGHTHRLGELIEEFNLKNNMTQIPN
TESWQQHDTTRDKSDKTGDPEDPSNQIVLKNVDIFTPNHQLLIEDISLNIKKGCNILITG
ETGFGKTSLLRVMRGLWKPTAGLVKSNSDILFFPQKALFMSGTLMQQIVYPTLNGYPEYS
LSSDEEKIKSLMLELNMEKLTEKLGGLNDRFEKSWSDKLSPGEMQRLTFARLIYHSPKIA
VMDEPTSALDLKTETELFKACKAKNITLVTVGHKESLRKFHEVELKLIGNGTWHLSPIPH
VFSYAKYDS
Nucleotide sequence
Length: 1,830
>Moocci.CG.ELv1_2.S413272.g12400.01.t
ATGGAAGAAATTTTAAAAGAGTGTAATGAACAAAAGAAACTTGGAGTCCTATATTGCAAA
CGTCAATTTAAAATTTTTTCCAAAATGTTTGTAAAATTTAAATCATCTTCAACTTGCCTT
ATTGGTATACTTCTTGCAATTGCTTTGCTAACCCAAGTAGTGATTTATGAAGTGGGATTA
ATACCTTCCCAATATTACATAGTATTGGGTGAAAAGGATAAAGATGGTTTTCGAAGTTTA
ACTATTTATGCAATGGAGATGATCATTTTAAATGCTATTATGAAAAGTACTATGACTTAT
CTTTCAAAAATTCTGTACCTGATTTGGAGGCGAAATCTTTGTTTGTATTTTCATAAAAAT
TATTTCTCTGAAATAAACTTTTACACTTTAAATGTTATCGATACAAAATACGACAATATG
GACCAAAGATTTACAAGAGATGTTGATAAACAATGTTATGAATGGAGTTTGCTTATTTCC
AAATTGATAATTGTACCATTTACTATGATCTATTATTCATATAAATGCTTTGTTTCAACA
ACATATTGGGGACCAGTTATCATATACATATATTTTATCTGTGGAACAATCATTAATCGA
TTTTTAATGGTACCAGTCGTCAAAGAAACAATAAAACAGGAAAAGTGTGAAGGAGAATTT
AGATTTCAGCATTTGCAAGTTAGGGTAAACGCTGAATCCATTGGTTTTTATAACTCTGGT
TACACAGAAAAATATAAAACAAATAAAAGATTGTATAAGCTACTTTCAACACAGAAAAGT
TTATTTGGCTGGAGTTACTGGCTTAATACATCAGTTAATATATTTGACTACACTGGGGGA
ATTTTAAGCTATTTAATAATAGCTATACCAGTTTTTGCTGGAGATTATGATGATTTAACC
TCTGAAGAATTAAGTGCAGAAATAAGCAAAAATGCTTTTGTATGCATTTATCTTGTTTAT
ACATTTTCCCAATTGTTTGATATGATGAGGGTGATAAGTGATATTGCAGGACATACACAT
AGGTTAGGTGAATTAATTGAAGAGTTTAACTTAAAAAATAATATGACGCAAATACCCAAT
ACAGAATCTTGGCAACAACATGATACCACCAGAGATAAAAGTGATAAAACTGGTGACCCT
GAAGACCCAAGCAATCAAATTGTACTAAAAAATGTAGATATTTTCACACCAAATCACCAG
CTTTTAATAGAAGATATATCATTAAATATTAAAAAGGGTTGCAATATCCTAATAACTGGG
GAAACTGGCTTTGGTAAAACATCCTTGCTACGAGTCATGCGAGGGCTTTGGAAACCTACT
GCTGGCTTAGTAAAATCAAACTCCGACATATTATTTTTCCCACAAAAAGCACTGTTTATG
AGCGGTACATTGATGCAACAAATTGTTTATCCAACCTTGAATGGTTATCCAGAATATTCT
TTATCATCTGACGAGGAAAAAATTAAATCCTTAATGTTGGAATTAAACATGGAGAAATTA
ACTGAAAAATTAGGCGGACTTAATGACAGATTTGAAAAAAGTTGGTCAGATAAATTATCA
CCTGGGGAAATGCAAAGACTTACTTTTGCCAGGTTAATTTATCACTCTCCTAAAATAGCA
GTTATGGATGAACCCACAAGTGCATTGGATTTAAAAACAGAAACTGAATTATTTAAAGCT
TGCAAAGCAAAAAATATAACCTTAGTAACTGTGGGTCATAAGGAATCATTGAGAAAGTTT
CATGAAGTTGAGCTAAAACTAATAGGAAATGGAACATGGCATTTGTCACCAATCCCACAT
GTATTTTCATATGCCAAATATGACTCTTGA
| Pfam |
ABC1_TM_dom (IPR011527) - T[21-292] 8.2E-58 |
| SUPERFAMILY |
ABC1_TM_sf (IPR036640) - T[35-335] 1.1E-9 |
| SUPERFAMILY |
P-loop_NTPase (IPR027417) - T[385-578] 1.52E-32 |
| ProSiteProfiles |
ABC_transporter-like (IPR003439) - T[387-607] 16.0 |
| Pfam |
ABC_transporter-like (IPR003439) - T[404-547] 3.4E-17 |
| SMART |
AAA+_ATPase (IPR003593) - T[412-599] 6.8E-5 |
| ProSitePatterns |
ABC_transporter_CS (IPR017871) - T[519-533] . |
| Protein Name | Identity | Bit Score | e-value |
|---|---|---|---|
| ABCD4_HUMAN | 44.667 % | 518 | 1.52E-178 |
| ABCD3_HUMAN | 28.44 % | 205 | 8.89E-58 |
| ABCD1_HUMAN | 25.719 % | 183 | 1.71E-49 |