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Transcript Model
Transcript Id
Moocci.CG.ELv1_2.S539038.g20593.01.t
Possible name(s)
ABCC10; ABCC12; ABCC5
Gene model
Location
S539038 [23,824 / 37,601]
Amino acid sequence
Length: 1,389
>Moocci.CG.ELv1_2.S539038.g20593.01.p
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KNIELVEVNQRCVFSSLAAQEWFNIRLQMIGVAMVTAVAFLTIIMHEHGQVSPGIAGLSL
SYALSVTGRLSGVITSFTETEKQMVAVERQSYYIKNIPNENKDEDSDYNISSAWPSQGEV
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DGINIKDVPLYLLRSGLSVIPQDPFLFSGSIRDNLAPIGYYNDTELWDALKHCGLHAKAI
SMGGLDADVGERGRNFSVGQRQLLCLGRAMLTKSKIICLDEATGNIDMESDLAIQYSIRE
CFKDCTLLTIAHRIETVMDSDKVIVMDSGRVVEIGAPADLIVDTSSYFYSLACSGTNSIL
QKYNNVLPS
Nucleotide sequence
Length: 4,309
>Moocci.CG.ELv1_2.S539038.g20593.01.t
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CCAAGCGCTCTCACTATTGGTACATGTGATATACTTGAAAAAATTATTGTTCCTAATGAG
AAATATCGAACTGTTTCATTGAGTTATGCAACAGATTCTAGAGATGATGAACTTATTCAA
GACACAGAAGAAGAGCGATTGCTTGTTAGTGACACTTACAGCGAGGTATCACAGGATAAA
GATGAGGAAGATTGTCCCGTTGACAATGCCAATTTATTTTCCAAGTTAATTTTTTACTGG
GTTCGACCATTAATGCAAAAAGGAAGTCATCGGACATTGCACACCACAAAAGATGTTTAT
GCATTACCTAATGATTTATCAACCAATAAATTAAATGTAATATTTCATGAAAAGTTAAGT
GATTTGAAACTTTTAAACATAAATAATACTCACGAACAAAATGACAGTAAAAAGAATGTT
TTACTCCATGCACTTAGCAAAGCATATGGATGTGTTTATTTTTCCCTTGGAATACTCAAA
TTATTGGCAGATGTACTGGGATTTGCTGGACCACTATTGTTATATAGATTAATTTCATTC
ATTGAGCAGCCAAAAAGTGATATATCAATGGGTTATTGGTATGCATTTGGATTATTTTTA
ACAACATTAGTTGGATCATTTCTCTCAACTCATTTTGACTATCAGTTTCATGACATTTTA
GTCAATTTTCAAGTAAACAAAATAAAGATAAAGTTCAGAACTTCGCTTATAACTTCGGTT
TATGGAAAAACAATTAATGCTGAATCAACACGATTTTACACTTATACAATAGGAGAAGTT
ACTAACCTAATGAGCACAGACATTGATAGAGTTGTAAATTTTTGTGCAAGTTTTCATCAA
TTTTGGAGCTTGCCCTTCCAAGTTGCAATAGCTCTTTATTTACTTTATCAGCAGGTAGGG
GTAGTTTTCCTGGCTGGTGTTGGACTTGCACTTGTAATGATAGTATTCAATCGTTACTTG
GCAATAAAAATTGGCCAATATAATAAGAAAATGATGTCTGAAAAGGATAATAGAGTAAAG
ACGATGCAAGAGCTATTATTAGGAATTCGAGTTATTAAATTCAATGCATGGGAAGCTGCT
ATATTTCAAAGAATAAACCTGATTCGTAACTTGGAGTTAAAGAGTTTGAAGGGGATAAAG
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ACATTTTCTGTGTATTCAGCTCTTGGGAATGAACTAACTGCTGCGAAGGTATTTACTGTA
ATAGCCCTTATCAACATGCTTATTGCACCACTTAATGCTTTTCCATGGGTAATTAATGGT
TTAATGGAAGCTTGGATTTCTATAAAAAGATTGAATTTGTTTGTCAGTCTTCCTGATGCT
AAATTAGACGATTACTATTCACCATTAATAGATAATAAATTAGAAAATCCTGATCAAGAT
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AAGTTACATTTAAGTGACATTAACATCAATATCAAAGAGGTACCGGGTCAATTTATTGGT
GTAGTTGGCGTTGTGGGATCAGGAAAAAGTTCATTGTTATCTGCTATTTGTGCTGAGATG
AGAAAAATGAAAGGTTCAGTTTTAATGAATAAAGATGATGTTGCCTTTGTGTCACAAGAA
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CATGCAGATGATACTGAAGTTGGTGAGAATGGAGTGACACTAAGTGGGGGTCAAAAGGCA
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TTGGCAGCAGTGGACCAGCATGTTGCATCTCACCTGTATGAATGCTGTATACAAGGAATG
TTGGCAAAGAAAACAAGAATTTTATGCACTCATCACACTAAATATCTACGGCATGCAGAT
CAGGTGATTGTAATGGAAGATGGTAAAATTCATAAAATTGGCTCACCAGAAGATATATTG
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ACTGAAGAAAAGGAGAGTGGAACAGTTGCACTACATGTTTACTCTGCATATTGGAAAGCA
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GTGATTTCTGATTGGTGGTTATCATACTGGATAGCTAATGTAGGAAACGGAACTATTTCT
TCACCTACATCTAAAGACTTTGTTTTAAATCAAACTGTTTGGATGACAGATGTTCAGTAT
ACAACATTGTTGCACCAAGACTACGAAGCAAGTCATAATTATTATGAAAACAAGCACAGT
GATGTGAAATGGTACCTGATGGTTTACGGTTGCATCGCAGCCGCTAACAGTTTTGCAACC
TTATTTCGAGCCTTTACATTTGCTTATGGAGGAGTTAGAGCGGCTCAGTTATTACATAAA
ACGCTTCTTCAAACTGTAATGAAGGCTCCAATTAGTTTTTTCAACTCAACACCCATTGGG
AGAATAGTGAACAGATTTTCAAGTGATATGTATGCTATTGATGATAGCCTACCTTTTATT
CTTAACATTTTCCTTGCACAATTAGTTGGGGTTATCGGAACCATTGTACTAAAATGGACA
TCTCGTGAAGTTAAGCGATTAAACACAATTAGTTTGTCACCAATTTACGCCAACTTTAAT
GAAACTATCCTGGGTTTATCCACAATTCATGCTTTTCAGAAAAATGAACTTTATATGAAA
AAAAATATTGAACTTGTAGAAGTCAATCAAAGGTGTGTTTTTTCAAGCTTGGCAGCACAA
GAATGGTTTAATATACGCTTACAGATGATTGGAGTTGCCATGGTAACTGCGGTCGCATTT
CTAACGATAATAATGCATGAGCATGGCCAGGTTTCACCAGGAATTGCTGGTTTATCGTTG
TCATATGCACTATCTGTAACTGGTCGTTTGAGTGGTGTCATCACTTCGTTTACCGAGACT
GAAAAACAAATGGTTGCAGTTGAACGACAGTCTTATTATATTAAGAATATACCCAATGAA
AATAAAGATGAAGATTCAGACTACAACATTTCATCTGCCTGGCCTTCTCAAGGAGAAGTA
CTGTTTCAAAATATAAGCCTCAGATATAGGAAAGATCTACCGTTGGCATTAAATAATGTA
TCGTTTATTGCAGAGAGTGGTGCCAAAGTTGGTATAGTTGGAAGAACCGGTAGTGGAAAA
TCCAGCTTATTGATGGTGTTGTTTAATATGGTCAAGCCATGCAATGGTTCACTACTTATT
GATGGGATTAATATTAAAGATGTTCCACTTTATTTACTGAGATCAGGTTTGTCGGTCATT
CCACAAGATCCGTTTTTGTTCAGTGGTTCAATTCGAGATAACTTGGCCCCCATTGGTTAT
TATAATGACACAGAGCTTTGGGATGCTCTAAAACATTGCGGTCTTCATGCTAAAGCTATT
TCCATGGGAGGTCTGGATGCTGATGTTGGTGAAAGAGGAAGAAATTTCTCTGTTGGCCAG
AGACAGTTGTTGTGTCTAGGCAGGGCGATGTTAACAAAATCCAAGATTATCTGCTTAGAT
GAAGCAACCGGAAACATAGATATGGAATCAGATTTAGCGATACAATACAGTATTCGAGAA
TGTTTTAAGGATTGCACTTTGCTTACAATAGCACACAGGATTGAAACAGTGATGGATAGT
GACAAAGTGATTGTAATGGATAGTGGAAGGGTAGTGGAAATTGGTGCACCTGCTGATCTG
ATTGTAGACACATCTTCTTATTTTTATAGTCTTGCATGTAGCGGAACAAACTCAATATTG
CAAAAGTACAATAACGTACTACCTTCTTAAAAAATAATTAGTTCACACAGTCTGACACAA
ACATTGTTAATGCAATGTGGTTCCATTGGTTCGCAGTCAAATGTCTAAATTCCAAAATTT
TTGCTCACTTTTTTACTAAAATATACTTCAAGAATAAATGAACTTCCAT
| SUPERFAMILY |
ABC1_TM_sf (IPR036640) - T[182-491] 2.35E-33 - T[808-843] 3.4E-43 - T[877-1120] 3.4E-43 |
| Gene3D |
ABC1_TM_sf (IPR036640) - T[182-500] 1.3E-22 - T[791-978] 6.7E-17 - T[979-1121] 1.3E-11 |
| Pfam |
ABC1_TM_dom (IPR011527) - T[197-471] 1.5E-21 - T[808-978] 1.7E-18 - T[981-1087] 7.4E-10 |
| ProSiteProfiles |
ABC1_TM_dom (IPR011527) - T[198-483] 34.864 - T[809-1102] 26.857 |
| SUPERFAMILY |
P-loop_NTPase (IPR027417) - T[520-741] 8.25E-49 - T[1131-1368] 2.61E-67 |
| ProSiteProfiles |
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| Pfam |
ABC_transporter-like (IPR003439) - T[548-681] 9.4E-19 - T[1157-1303] 2.7E-29 |
| SMART |
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| ProSitePatterns |
ABC_transporter_CS (IPR017871) - T[654-668] . - T[1276-1290] . |
| Protein Name | Identity | Bit Score | e-value |
|---|---|---|---|
| MRP1_HUMAN | 34 % | 745 | 0 |
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