- Transcript 'Moocci.CG.ELv1_2.S53...'
Transcript Model
Transcript Id
Moocci.CG.ELv1_2.S539038.g20593.02.t
Possible name(s)
ABCC10; ABCC12; ABCC5
Gene model
Location
S539038 [23,824 / 38,821]
Amino acid sequence
Length: 1,529
>Moocci.CG.ELv1_2.S539038.g20593.02.p
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LACSGTNSILQNLFDRILVSILTILPLPLIDITLYIVWMLSYVQINKQAEKKAIKILYKI
MIFPNNYKAIFLFHVWWYNNADIAGYILS
Nucleotide sequence
Length: 4,587
>Moocci.CG.ELv1_2.S539038.g20593.02.t
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GTGGAGAAATTTTTCAATAACAAAAAAATTACTTCCGATTTATGTTTTATCATCATTTGT
CCAAGCGCTCTCACTATTGGTACATGTGATATACTTGAAAAAATTATTGTTCCTAATGAG
AAATATCGAACTGTTTCATTGAGTTATGCAACAGATTCTAGAGATGATGAACTTATTCAA
GACACAGAAGAAGAGCGATTGCTTGTTAGTGACACTTACAGCGAGGTATCACAGGATAAA
GATGAGGAAGATTGTCCCGTTGACAATGCCAATTTATTTTCCAAGTTAATTTTTTACTGG
GTTCGACCATTAATGCAAAAAGGAAGTCATCGGACATTGCACACCACAAAAGATGTTTAT
GCATTACCTAATGATTTATCAACCAATAAATTAAATGTAATATTTCATGAAAAGTTAAGT
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TTACTCCATGCACTTAGCAAAGCATATGGATGTGTTTATTTTTCCCTTGGAATACTCAAA
TTATTGGCAGATGTACTGGGATTTGCTGGACCACTATTGTTATATAGATTAATTTCATTC
ATTGAGCAGCCAAAAAGTGATATATCAATGGGTTATTGGTATGCATTTGGATTATTTTTA
ACAACATTAGTTGGATCATTTCTCTCAACTCATTTTGACTATCAGTTTCATGACATTTTA
GTCAATTTTCAAGTAAACAAAATAAAGATAAAGTTCAGAACTTCGCTTATAACTTCGGTT
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TTTTGGAGCTTGCCCTTCCAAGTTGCAATAGCTCTTTATTTACTTTATCAGCAGGTAGGG
GTAGTTTTCCTGGCTGGTGTTGGACTTGCACTTGTAATGATAGTATTCAATCGTTACTTG
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AAATTAGACGATTACTATTCACCATTAATAGATAATAAATTAGAAAATCCTGATCAAGAT
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CTAATTGTTACTAGTATCATAGCAGACGAAACCCTGACACTGAAACAAGGACAAAACATC
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GGAGTTAGAGCGGCTCAGTTATTACATAAAACGCTTCTTCAAACTGTAATGAAGGCTCCA
ATTAGTTTTTTCAACTCAACACCCATTGGGAGAATAGTGAACAGATTTTCAAGTGATATG
TATGCTATTGATGATAGCCTACCTTTTATTCTTAACATTTTCCTTGCACAATTAGTTGGG
GTTATCGGAACCATTGTACTAAAATGGACATCTCGTGAAGTTAAGCGATTAAACACAATT
AGTTTGTCACCAATTTACGCCAACTTTAATGAAACTATCCTGGGTTTATCCACAATTCAT
GCTTTTCAGAAAAATGAACTTTATATGAAAAAAAATATTGAACTTGTAGAAGTCAATCAA
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GTTTCACCAGGAATTGCTGGTTTATCGTTGTCATATGCACTATCTGTAACTGGTCGTTTG
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AAAGATCTACCGTTGGCATTAAATAATGTATCGTTTATTGCAGAGAGTGGTGCCAAAGTT
GGTATAGTTGGAAGAACCGGTAGTGGAAAATCCAGCTTATTGATGGTGTTGTTTAATATG
GTCAAGCCATGCAATGGTTCACTACTTATTGATGGGATTAATATTAAAGATGTTCCACTT
TATTTACTGAGATCAGGTTTGTCGGTCATTCCACAAGATCCGTTTTTGTTCAGTGGTTCA
ATTCGAGATAACTTGGCCCCCATTGGTTATTATAATGACACAGAGCTTTGGGATGCTCTA
AAACATTGCGGTCTTCATGCTAAAGCTATTTCCATGGGAGGTCTGGATGCTGATGTTGGT
GAAAGAGGAAGAAATTTCTCTGTTGGCCAGAGACAGTTGTTGTGTCTAGGCAGGGCGATG
TTAACAAAATCCAAGATTATCTGCTTAGATGAAGCAACCGGAAACATAGATATGGAATCA
GATTTAGCGATACAATACAGTATTCGAGAATGTTTTAAGGATTGCACTTTGCTTACAATA
GCACACAGGATTGAAACAGTGATGGATAGTGACAAAGTGATTGTAATGGATAGTGGAAGG
GTAGTGGAAATTGGTGCACCTGCTGATCTGATTGTAGACACATCTTCTTATTTTTATAGT
CTTGCATGTAGCGGAACAAACTCAATATTGCAAAATTTATTTGACCGGATACTGGTTTCT
ATTCTAACAATACTTCCTCTTCCTCTAATAGACATTACATTATATATAGTTTGGATGCTA
TCTTATGTACAAATAAACAAACAGGCAGAAAAAAAAGCAATTAAGATTCTTTACAAAATT
ATGATTTTTCCAAATAATTACAAAGCAATTTTTTTATTCCATGTGTGGTGGTACAATAAT
GCTGATATAGCAGGTTACATATTATCA
| Gene3D |
ABC1_TM_sf (IPR036640) - T[182-500] 1.6E-22 - T[930-1048] 1.3E-17 - T[1049-1191] 1.4E-11 |
| SUPERFAMILY |
ABC1_TM_sf (IPR036640) - T[182-491] 3.66E-33 - T[809-843] 5.23E-42 - T[947-1190] 5.23E-42 |
| Pfam |
ABC1_TM_dom (IPR011527) - T[197-471] 1.7E-21 - T[947-1049] 4.4E-18 - T[1050-1157] 7.8E-10 |
| ProSiteProfiles |
ABC1_TM_dom (IPR011527) - T[198-483] 34.864 - T[950-1172] 24.595 |
| SUPERFAMILY |
P-loop_NTPase (IPR027417) - T[520-741] 9.5E-49 - T[1201-1438] 2.95E-67 |
| ProSiteProfiles |
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| Pfam |
ABC_transporter-like (IPR003439) - T[548-681] 1.1E-18 - T[1227-1373] 3.1E-29 |
| SMART |
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| ProSitePatterns |
ABC_transporter_CS (IPR017871) - T[654-668] . - T[1346-1360] . |
| Protein Name | Identity | Bit Score | e-value |
|---|---|---|---|
| MRP5_HUMAN | 38.235 % | 413 | 1.04E-120 |
| MRP9_HUMAN | 29.792 % | 552 | 1.32E-171 |
| MRP7_HUMAN | 42.147 % | 589 | 0 |