- Transcript 'Moocci.CG.ELv1_2.S54...'
Transcript Model
Transcript Id
Moocci.CG.ELv1_2.S545725.g21062.01.t
Possible name(s)
TGFB1; TGFB2; TGFB3
Gene model
Location
S545725 [31,964 / 35,227]
Amino acid sequence
Length: 230
>Moocci.CG.ELv1_2.S545725.g21062.01.p
MICRDALEKQCVQFGSKELNLGLELTKPCPDPEDENFQGPHRRQSSRGVREKIDILFAGS
NRLMDITEGRGDGVQDITFQNYTKELYPHIVIMMRSEAVMQRASIKGLGDHRRSKRDLNE
DYCFKRNPSETNCCLRELYIDFRKDLNWKWIHAPAGYNANFCAGPCPYLWSMDTQHATVL
SLYKRLNPQASSSPCCVPKQLSALTIMYYHQGRFQIKQLSDMILLSCKCS
Nucleotide sequence
Length: 1,818
>Moocci.CG.ELv1_2.S545725.g21062.01.t
ATGATTTGTCGAGATGCACTAGAAAAACAATGCGTCCAGTTTGGCTCGAAAGAGTTAAAC
TTGGGTCTTGAGTTGACAAAGCCCTGTCCAGATCCAGAGGATGAGAATTTTCAAGGACCA
CATAGAAGGCAGTCAAGTAGAGGCGTACGTGAAAAAATTGACATCCTTTTTGCTGGTTCA
AATCGCTTGATGGATATTACGGAAGGGAGAGGTGACGGTGTACAAGACATCACCTTTCAG
AACTACACAAAAGAGTTGTATCCACATATTGTTATTATGATGCGATCCGAAGCCGTGATG
CAACGGGCTTCGATCAAAGGGCTCGGAGATCACCGTCGGTCAAAGCGTGACCTCAACGAA
GATTATTGTTTTAAACGAAATCCAAGCGAGACCAACTGCTGTCTACGTGAACTTTACATT
GACTTTAGGAAGGACTTGAACTGGAAATGGATCCATGCTCCAGCCGGATATAATGCAAAT
TTCTGCGCCGGACCTTGTCCATATTTATGGAGTATGGATACTCAACATGCAACTGTATTA
AGTTTATACAAGCGATTAAACCCACAAGCATCATCATCGCCATGTTGCGTCCCAAAGCAG
TTAAGCGCGTTAACTATAATGTATTATCACCAGGGACGTTTTCAAATTAAGCAGCTCTCA
GACATGATACTCCTCTCGTGTAAATGTAGTTGAGTTTATTTGCAGTATATTTACTAAGTT
ATCAAAACGTTTTCTTGCATCAGAACACGGGACAGAATTGCGCGGAAGATGGCAAAAATA
TTGCAGTAAAACTCAGACATACACGCATTAATACCTAATTTAGTAAATGAATTTAATTTT
GCATATTTATACCAGCATATTTCTGCTCATACTGTGTGTGTTAACTATATTTAATGCATC
AACATTTAACCCAGATTGGTTAACATCACAATATATTTTCGTTTTCCCTTTTACGTTTCA
TTTTTTATCAATATTTTTAAGTTCTGATTTAAACAAATTTTTTGCCTAAATAAGACAATG
ATTGGTTGAAAATAGATCTTAAATTACACCAAGCCAATCTTGCCTTATTTAAGGGTTACT
TTTTATTTTTTAAATAAAGAAAGTTTAGATATAGCTTAAACTGCCAAACTTTGTATAAAG
CATTAACAAATATTATGTAATAAGGTCTCTTGATAAGTATTATTGCTGTTAAGTCCTGAC
TGCTGGTTCAGTCGGTCGATTGATCACGAATCAAAGCTAAAAACATTTGTCGGAAATTGT
ACACGACAATTATCCTGTTTTCATGAATGCTGTAAAGTTATTTAAACATTTTCTACATTT
CTTCAATACTCAATGGCTATTTCTTTCGTTGTTTTCTTATTCGTACTGTGTTTTATAAAA
CTATCCTCTTTCAATGATTGCCAATTACTGTAATTAATAGGATTACTCAAACTAGAACTG
TTAAAGAATTATTCTTAATGGCACGTTGTATTTCCCTAATTGTATTATCAAATTCTTGTT
TTTGCCAGGATATCAACTATCTTGATTTTATATTTAAAAAAATGGTTCTTTGTAATAAAC
ATTTTATTTTAAGGATATTACATGAAACATTTTGGCCATTTTATATATTTATGCATTTCA
ACGATTAAACGTAAATAAATCTTATAATTTGAACTATTCCAGTTGTGAGTTGTGATGAAC
CCAAGATTTATGCTTTAGTCAAGCTCGCCAAAATTGACTAAAAATAATATAATGCACATT
TGTTTTAAATTGGTATAGGCTATCACTAATATATTATGTACGTTTCAATTATATAAATAT
AGAATAACATTGATAACA
| PANTHER |
TGF-beta-rel (IPR015615) - T[17-230] 1.1E-59 |
| ProSiteProfiles |
TGF-b_C (IPR001839) - T[113-230] 34.998 |
| Gene3D |
Cystine-knot_cytokine (IPR029034) - T[118-230] 6.0E-38 |
| SUPERFAMILY |
Cystine-knot_cytokine (IPR029034) - T[126-229] 9.03E-34 |
| Pfam |
TGF-b_C (IPR001839) - T[132-229] 3.5E-25 |
| SMART |
TGF-b_C (IPR001839) - T[133-230] 1.7E-35 |
| ProSitePatterns |
TGFb_CS (IPR017948) - T[151-166] . |
| Protein Name | Identity | Bit Score | e-value |
|---|---|---|---|
| TGFB3_HUMAN | 44.954 % | 175 | 5.16E-53 |
| TGFB2_HUMAN | 44.037 % | 179 | 2.82E-54 |
| TGFB1_HUMAN | 59.322 % | 162 | 3.34E-48 |