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  1. Transcript 'Moocci.CG.ELv1_2.S58...'

Transcript Model

Transcript Id

Moocci.CG.ELv1_2.S585020.g23453.01.t

Possible name(s)

CTBP1; CTBP2; PHGDH

Location

S585020 [35,074 / 41,403]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 477

>Moocci.CG.ELv1_2.S585020.g23453.01.p
MAGRPLIALLDGRDCSIEMPILKDVATVAFCDAQSTQEIHEKVLNEAVGALLYYSITLTR
EDLEKFKALRIIVRIGAGFDNIDIKAAAEMGIAVCNVPSASVEEVADSTLCHILNLYRRI
TWLQEAVRQGVRPQSAENVREIAVGATRIRGDTLGIIGLGRIGTAVAQRAKAFGFNILFY
DPYLSEGIGKALGFVRVSTLQELLYQSDCVTLHCNLNEHNHHLINDFTIKQMRSGAFLVN
TARGALVDEHALASALKDGRLRAAALDVQDNEPFSSSNSPLRDCNNVVITPHAAWYSEQS
STELREAAAAEIRRAITGRNPDSLRNCINKEYLTISNSASSGIVHSEQPWNMEPPPLHST
SVHSDIRRLEQIPPHISGSATQSGALHTETNGNYRFSGLTPILPVPIPSAAAITTSETTD
IQSRQAQQLPGAIVMPNSVVPGRVSSASPIISRPSNQSPVSTTQIPTTKQDGEHMKE

Nucleotide sequence

Length: 4,165

>Moocci.CG.ELv1_2.S585020.g23453.01.t
TATTTTTAGATATATATATATACGGCTTTATAATGAACTATGGGTATTTTGTGTATGTGA
TACACTAAAAATATCCTTGTTTGTGTAAAATAATTAAATATTAAAGTTAAACTTAAATTG
TATACTTAACGAAGTTCGCTTTAAAATGGCTGGTCGTCCATTGATTGCATTGTTGGATGG
GAGAGATTGTAGCATTGAAATGCCTATCTTGAAGGATGTTGCTACTGTAGCATTTTGTGA
TGCCCAATCCACTCAAGAAATTCATGAAAAGGTATTAAATGAAGCTGTTGGAGCTCTTCT
TTACTACAGTATTACATTAACAAGAGAAGATTTAGAGAAATTTAAAGCCTTACGAATTAT
AGTTCGTATTGGAGCTGGATTTGACAATATTGACATTAAAGCTGCTGCAGAAATGGGAAT
TGCTGTTTGCAATGTTCCTTCAGCTTCCGTTGAAGAAGTTGCAGATTCTACTTTGTGTCA
TATTTTAAATTTATATCGCCGTATAACATGGCTTCAGGAAGCTGTTCGACAAGGTGTTAG
ACCACAAAGTGCAGAAAATGTAAGAGAAATAGCTGTTGGAGCTACAAGAATTAGGGGAGA
TACATTGGGAATCATTGGACTGGGTCGCATTGGGACAGCAGTAGCTCAAAGAGCTAAGGC
TTTTGGGTTCAATATTTTGTTTTATGATCCTTATTTATCGGAAGGTATTGGTAAGGCGTT
GGGATTTGTCAGAGTTAGCACATTGCAGGAATTATTGTACCAAAGTGATTGTGTAACTTT
ACATTGCAATTTAAATGAGCACAATCATCATCTCATAAATGATTTTACCATAAAACAAAT
GAGAAGTGGGGCATTTTTGGTTAATACTGCTAGAGGAGCATTGGTCGATGAGCATGCTTT
AGCATCAGCATTAAAAGATGGAAGACTAAGAGCAGCTGCTTTGGATGTTCAGGACAATGA
ACCATTCTCTAGCTCTAACTCTCCTCTGAGGGACTGTAACAATGTAGTAATTACACCACA
TGCTGCATGGTATAGTGAACAAAGTTCTACGGAACTTAGGGAGGCTGCTGCTGCTGAAAT
TAGGAGGGCTATAACAGGTCGTAATCCTGATTCTCTGCGCAACTGTATAAATAAAGAATA
TCTAACAATATCAAACTCTGCAAGCAGTGGCATTGTTCACTCTGAGCAACCTTGGAATAT
GGAGCCCCCGCCTCTTCACTCCACTTCAGTTCACTCAGATATTCGCAGACTTGAGCAAAT
ACCTCCTCATATTTCTGGCTCAGCCACGCAATCTGGGGCACTTCACACAGAAACCAATGG
AAATTACAGATTTTCAGGATTAACTCCAATTCTTCCAGTACCTATACCATCTGCTGCCGC
AATAACAACTTCAGAAACGACTGATATACAAAGTCGTCAGGCGCAACAACTTCCAGGTGC
AATAGTAATGCCAAACTCAGTTGTTCCTGGAAGGGTCTCATCTGCCTCTCCAATAATATC
CCGCCCTTCCAATCAATCTCCAGTTTCTACTACTCAAATACCAACAACCAAACAAGATGG
GGAACATATGAAGGAGTGAATATTGTTTTATACATTGATGGCTTAAACCATAACTGTATT
TGTATTAAATTTACACTTTTTTACAATCAAGTCAACGTTAATAGGAATAGCTTTCGTGTT
AATATGAGCAAGAACTGAACTTGGCATTCAATAAATAAGCATGAAATTAAAAGTAAAGTC
AGCTGTCAGAGCAAATGCAACTAAATCTTAGCTACTCGAAACTAAAGCTAACTATTAAGC
TGCTAAAATTGTATTTTCTTTTCACTTACCTTCATAATTATTTGAAAATAATGTAAAAAA
AAACATTAATCATGTAGATAATGCAGTTAATATTATTTCATTTGCATATTTTACTAGAAA
TACCATGATTTTTGTTAATATTGTATGAACTTCATTGCAACATGCCAATTCTTTGTTTAC
TACTAAGATCTTTAATACATGAAATTGATATGTTCAATTAAGTTTTATAATAAATTTTAA
ATGCTTACTTTAAAATTATACTAATGGTCGAAGATAGCAGCATATATAAGAAATTTTTAA
TATGGTGGAAATTACTTAGATAAGTTTTGTAGCTTTTGTTGTGGGTAAACTGGATAGGTG
TTTATTAAACTGAAATATAATCGGTCGCTTCATGAAGTGCGCTGTTTGCAACAGATAATT
CGAAGTCTTTTCAATTGCAATCTAATTTTACATTATTATCATAACAAATAAATTAGTGTT
TAGAAAATCACCGTGTTTTATATAAAATCCACAATTATACAGAAAAAGTAATAGTAAGAC
AATAGTTGCATGCATAAAATGATTGCGATATTTAGTTTACAATTAGTTTTTTAAAAATCT
CAATAATAGTGTATTTCTTCGTTTTTCAGCAATGTCCATTTGGTTCTCTATGTCACCCCT
TTGGTATGCTCCTGCTCTTTCTAACTTCCAAGCTAATGTCTCGATTTCCACTTCTAATTG
TGCCTGTTGATATTCAAATAATGTTTTTTCAGGACCAGACTTTGTATGATATACTAATGG
GTATGTATTTTGAAGTGTACTTCGACATTTCGCTAAGAGTTCACCGGCCCTTAACAAATA
TTGCCAGTCAATCCAAGTTCCCTCATTCATCATAACTTTTTCATTAATTTGCTTCTCAAT
TCTTTTTCTTGCTTCTTCTTCTAGCTTAAGGCTGCGATAATGATTTTCCCAGCGCTCAAA
ATAAAACAAATATTTTTTTAACGATTCTCTTGCCTGGGCTTGTTGACTTTGCTGTGCAAT
TACAGGATTTTCTTTGTATCGACTGCATTCATAATACGAGTTACCATGACTATTCCATGG
CCCGAGACACATCCAACAAAAATTATGCTTGCATTTTGAGCACTGTATATGGTTACATCC
ACCATTTTTTTCAATGCAAGTTTGGCACTGAGGACATGTTTTTGTATTTGCACTGATATA
ATTTGCTGTTTCTGTATCATCTGTACATTTGGTTAACCACTTTTTAATTGTTTCACAGTC
AGTGGGGCAGTGGTAATCTTGACAGCAGGCAAAACAAAATGCAGTTTTACATTTTGAGCA
AACTGCTTGTCTTGGTTTTACCGTTTTAGAATAAGCAACCATATCACAGTCTACACCTGG
GCAAAATCTAAGCAAATGATGATGAGTAATTGCAAGGTTACGATTGTACCGTTCATATTT
TTTCTTTACACTTACTGTTTCAAGACTAAAAAATTGTTCAATAAAATCGGATGGACATAG
TAAATTACATTTCACATTCATGCAAGAAACAGTAGATTTCATTTCATCATTTATAATTAT
TTTTATGTATTGTGACCAGCATCCTTTACAAAAACCATGGTTACAAGACAGCATGAACAA
ATTTTTCGATAAATAATCTTCAAGGCAAACGCCACATTGATCAACTTTATTTAACTGTGA
TGACAAAAGTTTTGTGTGCTCTGGTAAAACATTGGCATTTTTAAGCAAGTCTTCCCGTCC
ACTCTTTGTTGCTATTTTTGATTTAATTGTGGTTTTGTTCCACAAATTACTGTTTAAAAC
TAATACTGCTTGGCTTGGAGAAATGTTTAAAATTTTTGCAACCGAAGTGGCTTCTGCTTT
TAGCTGGTCATCTACTTTTTTAAAATCCCAACATTCATATTCAAAGTGTTCCAATTCTTG
AATTTGTTTCTTAACACCATTATTGTTGCTCCTTAAATTATCATTGGAACTTAAAAAATC
ACCAGATTTTTTGTTATTTTGAGAAACTTCAGGGTCACTTTCTAATCCATCGTCATTATT
GTTATAATAATCATCTATTTCATCATAAGAATCAGAATCATTTATGTCCTCACTATCCGA
ATCACTTTGCTGAGACGACATTCAATTCAAGGTAGCAACAGAAGTTTTTTATTTCCTTCC
AATATTTATATACAACGGTACAGTGTAGTTCCTATGGAAAATAGTCCTTAATGTTAGGCT
AGAAAAAAGCTCACAGTACCTAGTTTAATTTTAGACATTCAAAATTAAATTCTTGAAGAA
GGCATGTACTGATACGAATGCAAACAAGGCAACTGGCAATTCGACTTAAGTTAACAATTA
AAAAACTGAAAAATAGATAAACTTA

InterProScan

Pfam
D-isomer_2_OHA_DH_cat_dom (IPR006139) - T[15-324] 2.1E-29
SUPERFAMILY
NAD(P)-bd_dom_sf (IPR036291) - T[104-295] 3.56E-56
Pfam
D-isomer_DH_NAD-bd (IPR006140) - T[111-294] 6.1E-57
ProSitePatterns
D-isomer_DH_CS1 (IPR029752) - T[154-181] .
ProSitePatterns
D-isomer_DH_CS (IPR029753) - T[232-248] .

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
SERA_HUMAN 31.922 % 142 4.61E-37
CTBP1_HUMAN 76.081 % 565 0
CTBP2_HUMAN 68.254 % 548 0