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Transcript Model
Transcript Id
Moocci.CG.ELv1_2.S605358.g25084.01.t
Possible name(s)
ANKIB1; RNF19A; RNF19B
Gene model
Location
S605358 [9,986 / 24,750]
Amino acid sequence
Length: 715
>Moocci.CG.ELv1_2.S605358.g25084.01.p
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EKWEEFTLRRCLSVDPDCRWCPAPDCGYAVIAYGCASCPKLHCERPGCNTDFCYHCRQEW
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VCEAEFCWLCLQEITDLHYLSPSGCTFWGKKPWSKKKKILWQLGLLIGAPLGIGLVAGVA
IPAIIIGLPIWVARRVLAHFQKKNGSKHKRNSAVVMCVMISIIVSPILAALAVGVGVPVM
LLYVYGVVPFSLCRTGGYGMTARTAANRARNAMRIDMGSPVVPTAAGSSMPETSTNHGAT
HLITNPSIGEASVGGMTMASLSLSHGSMEHPERDGDSASTTAIAGTSITGSLSGSVAATS
VLHGRKDVDQHSTHTQVSVASGNYTAVQVHMSDNVSENSIASYIPMSSGTVNKSYSSKSL
GAKRKTSKSKITTRKSSVPKKINEESKSIAETVPSKSLESSSNQVPLNSTIIEVENVTPT
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Nucleotide sequence
Length: 2,700
>Moocci.CG.ELv1_2.S605358.g25084.01.t
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TGCATAACCCAAGTCCACTTGGTATTCTTTACTCAGAGACAACTGTTTTGCTGCCAAATT
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TGATGCAACCAGTCAAAGTAGTAAAAAACATAAAGTTAAAAGAAGACATTATTTCCCACG
TTCATTTCTAAGGGGTTCCTTTTACAACAAGAAGTCCTACCACTATAAGTCAGAAGATGG
AAATGATTCTAGTTTAAATGTTTTGCCTGGTACGTCCAGTCTTTCTGCAGACTCACGTTC
ACTTAGTATGTCATCAAAAGGAGATGCCCTAACCATTGCTAGTGCTCAAAGTGATAATGT
TGCTGGTGCTGCCTCTGCCAAATCGGATTCAAAATCACATTCTAAATATGACAGCATTGG
TGATCCAGCAATGATGGAATGTCCTTTATGCTTGACTACACAAGCTGCTGAAAATTTTCC
ACATTTAATGACTTGTCAGCATAGATCATGTGCCGATTGTTTACAGCAATATTTAACAAT
AGAAATAACTGAAAGCAGGGTTAATTTGATGTGTCCAGAATGTCATGAGCGCCTTCATCC
CATAGATATGATAAATATATTAAAATCATCTCCAAATCTTATTGAAAAATGGGAAGAATT
TACATTAAGGAGGTGTTTATCAGTTGATCCAGATTGCAGATGGTGCCCAGCACCTGACTG
CGGATATGCTGTAATAGCATATGGATGTGCAAGTTGTCCAAAATTACACTGTGAAAGACC
AGGATGCAACACAGATTTCTGTTATCATTGTAGGCAGGAATGGCATCCTAACCAAACTTG
TGATGCAGCTCATTTACAAAGAAGGAAAGAGCTTCGAATACAATCAGACTCTTTAACATA
TAGTCAAGGGTCAAATATTAATGACTACATTAAACCTTGTCCAAAATGTGGTGCTTTAAT
TGCCAAAATGAATGATGGATCTTGTAATCACATGACATGCACTGTATGCGAAGCAGAGTT
CTGTTGGCTATGTCTACAGGAAATCACTGACTTACATTATTTAAGTCCTTCTGGTTGTAC
TTTTTGGGGTAAAAAACCCTGGAGTAAAAAAAAGAAAATTCTATGGCAGCTTGGATTGCT
AATTGGTGCTCCACTTGGTATTGGATTAGTTGCTGGAGTTGCTATCCCTGCAATTATAAT
TGGTTTGCCAATATGGGTGGCTCGTCGGGTTCTTGCGCATTTTCAAAAGAAGAATGGTTC
AAAACATAAAAGAAATAGCGCTGTGGTAATGTGTGTCATGATTTCAATAATTGTCTCGCC
AATTTTGGCAGCACTTGCTGTTGGAGTTGGAGTTCCAGTGATGTTGTTGTATGTATATGG
GGTGGTTCCCTTTTCTCTTTGCCGAACTGGTGGTTACGGTATGACTGCAAGAACTGCAGC
CAATAGGGCAAGAAATGCCATGCGGATAGACATGGGTTCACCAGTAGTACCGACAGCGGC
CGGTTCAAGTATGCCAGAGACCAGTACAAACCATGGTGCTACACACTTAATAACAAATCC
AAGTATTGGTGAGGCTAGCGTAGGAGGAATGACAATGGCAAGCTTAAGTTTGTCACATGG
AAGCATGGAACATCCTGAGAGGGATGGTGATAGTGCAAGTACAACAGCCATAGCAGGCAC
GAGTATAACAGGAAGTTTGTCTGGAAGTGTAGCAGCTACCTCTGTTCTTCATGGAAGAAA
AGACGTTGACCAACATTCCACCCATACTCAAGTTTCGGTTGCTTCAGGAAATTATACTGC
AGTACAGGTACATATGTCGGACAATGTATCTGAAAATAGCATAGCAAGCTATATCCCAAT
GTCTAGTGGCACTGTTAATAAATCCTATTCATCCAAATCTTTAGGTGCAAAAAGAAAAAC
ATCTAAAAGTAAAATCACAACTCGGAAATCCTCTGTTCCAAAGAAAATAAATGAGGAAAG
CAAATCCATTGCAGAAACCGTCCCATCAAAGTCTTTGGAGTCGAGTTCAAATCAAGTTCC
ACTAAATTCAACTATAATTGAAGTCGAAAATGTGACACCTACAATCCATTCTAATACTTT
ATCTGTATCAAAAAATGAAGATGCTACTAGTACTGGTAGTGAATCCAGCAGTTGTGGAAG
CCAACATGCTCTACTTACAGATACAGGAAAAGCGTCAAATTCGTCTTTAACTGTGGTTAA
TATATGCAATGAAAAAAATCCAGAGCATTAGAACAATATTCACCTTTTGCTTAAATCTTT
AAAAAGTCCAAATTGTTTTGTCATTTTCTTTTGTCTTTATTCCATTCAATGTCTTTTTTA
AACTAATATATTATATATTTTTTCTATTTTCTGTTTTTTAGTGGCCAGATATACATTATC
TTGCCAATATGTTGATTGATTTTCTCATATAAATATTAGTTTTATTTTTATTGTTTGCTG
TTTAATTTAAATTAATGTATTAGAAACTGCTTAACTTATTTTATCAAATTTTCTTGGTAC
TTCTTTATACATCTATCCATTTAATACCATTATGCACCACTCTGCATTATTTTCGTTATT
TGCTTTCATATAGCTATTTTTGCTGGATGACTTAAAATATAAATACATGCTGTAAAATTA
| PANTHER |
E3_UB_ligase_RBR (IPR031127) - T[85-538] 6.5E-154 |
| Gene3D |
Znf_RING/FYVE/PHD (IPR013083) - T[108-194] 8.4E-15 |
| SMART |
Znf_RING (IPR001841) - T[113-160] 2.2E-4 |
| ProSiteProfiles |
Znf_RING (IPR001841) - T[113-161] 10.734 |
| SMART |
IBR_dom (IPR002867) - T[181-246] 1.6E-21 - T[257-325] 0.0056 |
| Pfam |
IBR_dom (IPR002867) - T[181-246] 3.4E-12 - T[273-318] 2.1E-8 |
| Protein Name | Identity | Bit Score | e-value |
|---|---|---|---|
| AKIB1_HUMAN | 28.692 % | 90.9 | 9.87E-19 |
| RN19A_HUMAN | 54.331 % | 543 | 0 |
| RN19B_HUMAN | 52.165 % | 504 | 1.44E-169 |