- Transcript 'Moocci.CG.ELv1_2.S61...'
Transcript Model
Transcript Id
Moocci.CG.ELv1_2.S616145.g25994.01.t
Possible name(s)
CNN1; CNN2; CNN3
Gene model
Location
S616145 [834 / 5,940]
Amino acid sequence
Length: 212
>Moocci.CG.ELv1_2.S616145.g25994.01.p
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LMNSLVPGIIANKKLPNTRLLNPFRCMENISAFLDACREFGVEESSLFQTADLYNRDPNL
SQVQLCLLAVCNLAKSKGLTDIDIGIYVAEKQHKNWTEEELRRGDGIIGLQAGTNKCASQ
AGMTPYGAARTVYDKKYTGKGEEADDENNYEY
Nucleotide sequence
Length: 2,526
>Moocci.CG.ELv1_2.S616145.g25994.01.t
ACATAACACATTTGGCTTTTTGCAACTTTCCAAAATTTAACACGACATTCGGACATTATA
TATTTTTTTTTAATTTAGAATAAGAAGTTAATAAAATAATGGCAAGTAATGGTCCAAGTT
ACGGCTTTAGTCGTGAAGTTAAAATGAAGTTGAAAGCCAAATATGATCCTAGTCTTGAGC
CAATTTTGCGGACCTGGATAGCAGAAACAGCAAATTGTGATCCTCAAGATGATTTGTCTT
TTCAAGATTTTTTAAAGGATGGAATCAAATTGTGTATGTTAATGAATAGTTTGGTGCCTG
GTATAATTGCTAACAAAAAGTTGCCGAATACAAGGTTGCTGAATCCATTCAGATGTATGG
AAAATATATCCGCATTTTTGGATGCATGCAGAGAATTTGGTGTAGAAGAATCATCTTTGT
TTCAAACCGCTGATTTGTATAACCGTGATCCTAATCTTTCTCAGGTCCAGTTGTGTTTAC
TTGCAGTATGTAACCTGGCTAAATCAAAAGGTTTAACAGATATAGACATTGGTATTTATG
TTGCGGAAAAACAGCATAAAAACTGGACAGAGGAAGAGTTAAGAAGAGGAGATGGAATCA
TAGGCTTACAGGCCGGAACAAATAAATGTGCTAGTCAAGCTGGTATGACACCATATGGAG
CAGCAAGAACAGTTTATGATAAGAAGTACACAGGAAAAGGTGAAGAAGCTGATGATGAAA
ATAATTATGAATATTAATGTCAACAATCAGTCATAAGATACACATTCCCTACCTATATGA
AGTTGCAGCATGTGAGTTTTAAGCTTGTACTAATAGTTGGCATTCAATCGTGTACTATTA
AATTGTGACATGTTTTTAGTGTTTTACTTTTAAGTTTTGTTTACTATCTAATCTCTATAT
GCACTCAATTTTTTTAAGCCAGACATTGCTTTTAAGTTTTTTTATTAGCTGAATTCTGTA
CCTCTGTATTTTCTTCATATCGTAGTACTGTTTTATTCAATTATGTATACCATATTATTA
CACTTCAAGTTCTATAGCAAGCATCAACATTCACTGTTTAAAATAATTTCTTGCATTCCA
AATACTTTATAAATATTTGGGTTTTTTGTTTATTAATTAATTTAATCATTTAAGCTGTTT
TAGATTTTGTAGCCTTGCCATAAGGATTTATAATATTTTTTTATTTGCTGGTGTTCATTT
TACCTAAAATGTAGAAATCAACTTATTGTAATGCATGGTGTTTATTTTCATTCATATTTT
AAATGTTCTTAAATTTGTGAATAGTTTTTCTGAAATATATACATTCCACTGCAGTGCTTG
CTTTTACAGTAACCAAATTAATTTTGACGAATTTTGTCTTCCTAATATCTGAATATTAAT
TAATGTTATATCATGTTTAACAGCTCATTTTTTGTAGTAGTTTTAATATGTGTCATGTTA
AAAAAAAATTAAATGTTTATAAGTTGTGACAAATATATTAGATTAGTAACCAACATATAC
TAAGTATGATGACATTATTATTTCCCCAGGGTTAGATTTTGGATTAGGGTCTTTTCCATT
ATAATAAGCATAATATTCAATGCTGTTCTGTTGACCAGATTGAACATTTGATGAAATATT
AATTATCCACGGTTTTACTTCTTGCCCATCACACCATCCATCCCTTCCATAAAGCCATGT
TCCATGTTCATTAGGAATTACTCCATCCGTGACTCGATCAGCACAGCCCAATGGTGTCCC
TGCATTTTGGAAAGTTTTGACATATTTGTGTTTGCCATTTACTACAAAATGATGCGATGT
CACACAAAACTCTGCACAGTTCTGGTCATCAGACCCATGTCCTGTTATAACTGCGTAAAT
GTATACCTCGTATGTTTGATTTAACACAGTGGTGAAGTTAAAAGGCACATACTTTTTATT
ATAATCTTTGTCAAATACTCCACCTTGAAATAAAGGCGTTGAATCTGTTGGCCCAAACTG
TTTAACGCCTCGTTTTTCTGTCTTACTAAGCACTAAGTTTAAATTCGACACCCATGGCAT
TGCCCACCAGGCATCCACTTTCATTGTAAAGTTACAAATAGCTGTTTCTTGAAAGTACCC
AGAAGCAAGTAAAGGCGATATCATTGTTATATCTGTGATCCAATGACCCACACCTCGTCG
AAATGGTGTTATCCATCGGCCTATTTCATTGCCGCAATGGGGGTTATTTTCACAGCATAC
ATAGAGAGAAACAGTGTGATCCCATGGTGGGCAACTGGAATCAAAGGATTCTTCACAACT
AAGAGACATGTCCAAATATATGCTTTCAAACATAGTTAAGTTTGTCAGTTTTACTGTGGC
TACTCCCGTTCCATTCTTACCTTTCATTATATCTTTATCAAAAATTGGAACTACCTTGCT
TGATATTTTGTCTATTGTGCTGTTTAGTCTATGGGTATAAACCAGCCATTGTGATTGCCA
TGATAAAAATTGTAAAGAAGGGTATAGAAACCACCCAGCTTCAACTAAATAATTTTTGTA
ATCAAT
| PRINTS |
SM22_calponin (IPR003096) - T[3-17] 3.2E-36 - T[22-35] 3.2E-36 - T[48-63] 3.2E-36 - T[85-101] 3.2E-36 - T[101-116] 3.2E-36 - T[156-169] 3.2E-36 - T[169-184] 3.2E-36 |
| Gene3D |
CH_dom_sf (IPR036872) - T[10-168] 1.7E-32 |
| SUPERFAMILY |
CH_dom_sf (IPR036872) - T[18-156] 1.26E-33 |
| ProSiteProfiles |
CH-domain (IPR001715) - T[24-134] 14.682 |
| SMART |
CH-domain (IPR001715) - T[26-130] 3.7E-14 |
| CDD |
CH-domain (IPR001715) - T[29-129] 1.1349E-18 |
| Pfam |
CH-domain (IPR001715) - T[29-132] 8.6E-18 |
| ProSiteProfiles |
Calponin_repeat (IPR000557) - T[168-193] 12.767 |
| Pfam |
Calponin_repeat (IPR000557) - T[168-190] 9.1E-14 |
| ProSitePatterns |
Calponin_repeat (IPR000557) - T[168-187] . |
| Protein Name | Identity | Bit Score | e-value |
|---|---|---|---|
| CNN1_HUMAN | 44.271 % | 142 | 1.36E-41 |
| CNN2_HUMAN | 45.078 % | 155 | 1.08E-46 |
| CNN3_HUMAN | 47.15 % | 158 | 1.55E-47 |