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  1. Transcript 'Moocci.CG.ELv1_2.S63...'

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Transcript Id

Moocci.CG.ELv1_2.S632878.g27669.01.t

Possible name(s)

UGDH

Location

S632878 [3,273 / 11,698]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 489

>Moocci.CG.ELv1_2.S632878.g27669.01.p
MDIKKICCIGAGYVGGPTCSVIASKCPDVQVSIVDINQARIDAWNSDNLPIYEPGLDKVV
KSCRGKNLHFSSAVDEKIIEAELIFISVNTPTKTYGVGKGRAADLKYVEACARRIARIGG
CNKIVVEKSTVPVRAAASIQRILRSNTNLATSYQVLSNPEFLAEGTAVENLINPDRVLIG
GDDTEEGRQAVESLANIYKRWVPNDQIIRTNTWSSELSKLAANAFLAQRISSINAMSAIC
EATGADVNEVANAVGMDSRIGDKFLKASVGFGGSCFQKDVLNLVYLCEALNLPQVASYWQ
QVIEINDYQRKRFASRIIACLFNTLSGKTITLFGFAFKKDTGDTRESSAIYIAKYLMDEG
AKLAIYDPKVPKQQIMTDLSHPTICDSPEIAERLVTIHDDPYEACKESHAIAICTEWDEF
KKLEYQQILNLMLKPAYIFDGRGILQHEELVSMGFQVEAIGKNVGNEAPFHISQNNGNNI
LKPTSRVLP

Nucleotide sequence

Length: 2,739

>Moocci.CG.ELv1_2.S632878.g27669.01.t
ATGGATATAAAGAAAATATGCTGTATTGGTGCTGGCTATGTTGGTGGACCAACTTGTTCT
GTTATAGCGTCAAAATGCCCCGATGTTCAAGTATCTATCGTTGATATTAACCAGGCGCGT
ATTGATGCATGGAATTCAGATAATTTACCAATATACGAGCCTGGATTAGATAAGGTTGTA
AAATCTTGTCGGGGTAAAAATTTACATTTTTCATCTGCAGTCGATGAAAAAATTATTGAA
GCTGAATTAATTTTTATTTCGGTAAATACACCAACGAAAACATATGGAGTTGGCAAAGGT
CGTGCAGCAGATTTGAAATACGTTGAAGCCTGTGCTCGTAGGATAGCCAGAATTGGAGGT
TGCAATAAAATAGTTGTGGAGAAGAGCACAGTTCCAGTTCGAGCTGCAGCAAGTATTCAG
AGGATTCTACGAAGCAACACCAATCTCGCCACTAGTTATCAAGTTTTATCAAATCCTGAA
TTCTTGGCTGAAGGAACAGCAGTTGAAAATTTAATTAATCCAGACAGAGTTTTGATTGGA
GGAGACGATACAGAGGAAGGAAGACAAGCTGTTGAATCATTGGCTAATATTTATAAAAGA
TGGGTTCCAAATGATCAGATTATACGAACTAATACTTGGTCATCAGAGCTTTCTAAGTTG
GCAGCAAATGCATTTCTTGCACAAAGAATCAGCAGCATCAATGCAATGAGTGCAATTTGT
GAAGCAACTGGAGCGGATGTTAACGAGGTTGCCAATGCTGTAGGAATGGATTCTAGGATT
GGCGACAAGTTTTTAAAAGCGTCAGTTGGATTTGGCGGAAGTTGTTTTCAAAAAGATGTC
TTAAATCTGGTTTACCTTTGCGAAGCCTTGAACCTGCCCCAAGTAGCAAGTTATTGGCAA
CAAGTTATTGAGATAAATGATTATCAGCGAAAAAGATTTGCCAGTCGTATTATTGCATGT
TTGTTCAACACTCTAAGTGGGAAAACAATTACATTATTTGGTTTTGCATTTAAAAAGGAT
ACAGGTGACACACGAGAAAGTTCTGCGATTTACATTGCAAAGTATCTAATGGACGAAGGA
GCAAAACTTGCAATCTATGATCCAAAAGTACCAAAGCAACAAATAATGACTGATTTGAGC
CACCCAACAATATGTGATTCCCCAGAAATTGCTGAGCGGTTGGTGACCATCCACGATGAT
CCATATGAAGCTTGTAAAGAATCTCACGCCATCGCTATCTGTACTGAGTGGGATGAATTT
AAGAAACTTGAATATCAACAAATACTGAACCTGATGTTAAAACCGGCTTATATATTTGAT
GGAAGAGGCATTCTTCAACATGAAGAATTAGTCAGTATGGGGTTCCAGGTGGAAGCTATT
GGTAAAAATGTAGGAAATGAAGCCCCATTTCATATTTCACAAAATAACGGCAACAACATC
CTAAAGCCTACGTCACGCGTTCTGCCTTAGTTCTTCAAAATTTAAATTATTATTTTGGTC
ACATGCAGTGATATTTATATTAGTTGCAACCTGTATCTTTTACGTCCTCATATTCTTATT
TATTTTGCTAGACAATTACTGCACTGTATTAAATAGTTTTATTTCAATTTTACTGCTTTT
AACATGGTTTTTATGGTGCACTGCAATGTTTTGAGTTAAATTATGAAATCTTTAGTTATA
AAATTTACAACTGTATTACAAATTAAAACATGTTTTTTGGAAATTTGTACCATTTGTTAT
ATATATATGTATGAAATACACAATCATGCCAACATTCATATTTTATCACTTTTTTTNNNN
NNNNNNACCAAATTACATTTAAATCATTCCAAGTCAATTTTTTGCTTTTTTATAGACAAT
GTATTGAATGGTTTTAGTTTTTATTGTAATTTTTATTTACAAAATAGTCAATGCTTAGCT
GTACATCTTTTACTAGTGATGGGAGTAAGTGTAGTACAAAACTTTTTTATTCTAAGTTTT
ATTATTTTATAGTGTCTTTGTGATTGTGGAATAACTTTAATTGTAGTATTAAATAAATTA
GGGTTGGGCCAAGTTATGACAAAACCATGACCGCTGCAACCAAGGTCACCGAAGATAGCA
TAACTTTACATAGGATATATTTTATAAATAAATTTGTTAATATTATACAAAATAGTTAGG
AGTTTAATAGTATTTTTATAACTGCAATAACCTTACCATAGTATTTTATTGTGTACAAAT
AAAAACTAATTGTTACCATTAATAGATTAAACAAGTTTAGATTGTAAAGAAAATTTTGAG
TAAAATATATGGTTGCAGAAAGTAAGATTTTGTCATTGTCCGGTTTGGGGTAAAATATTT
AACTTGTTAATTTTTAAAGGTGTATTTTGAATTGTAGTGACTTGTTTATAAATTAGGTGG
GAGATAATTTGTTATACAAATTTTGCATTTTATTTATGTGCAATGTAAATAGTAGAAAAT
ATGAACAAGCTAGTGGAATCATGAAAGATTATAATTCATTTAAAATTGGTTTTCTTGCTA
ATATTTTTCCGTTTGAATTTTTAAAAATCCTGTACAAAAATTGTTTACTTTTAAAAAATA
TGTCTTTTTATCTTTAATATAACAAAAAATTTAAACAGAAGTACTATGGTTATTGCTTGT
ATTTTAATGCCAACATGTCACTGAACTATCATAGCTATTAGTTGTTGTCACTTATTTTTG
CTTGTCAAGCCTTTATTAATAAAAATAACAAACAGAAAA

InterProScan

PIRSF
UDPglc_DH_euk (IPR028356) - T[1-473] 2.0E-249
SUPERFAMILY
NAD(P)-bd_dom_sf (IPR036291) - T[4-204] 2.5E-39
PIRSF
UDP-Glc/GDP-Man (IPR017476) - T[4-462] 1.4E-134
TIGRFAM
UDP-Glc/GDP-Man (IPR017476) - T[4-443] 1.9E-103
Pfam
UDP-Glc/GDP-Man_DH_N (IPR001732) - T[5-190] 1.0E-60
Pfam
UDP-Glc/GDP-Man_DH_dimer (IPR014026) - T[213-307] 9.2E-33
SUPERFAMILY
6-PGluconate_DH-like_C_sf (IPR008927) - T[213-312] 1.29E-28
SUPERFAMILY
UDP-Glc/GDP-Man_DH_C_sf (IPR036220) - T[317-456] 3.92E-33
SMART
UDP-Glc/GDP-Man_DH_C (IPR014027) - T[331-447] 2.5E-37
Pfam
UDP-Glc/GDP-Man_DH_C (IPR014027) - T[332-446] 2.9E-33

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
UGDH_HUMAN 70.362 % 702 0