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Transcript Model
Transcript Id
Moocci.CG.ELv1_2.S644622.g29384.01.t
Possible name(s)
ADRA1A; HTR1A; HTR1B
Gene model
Location
S644622 [39,354 / 49,992]
Amino acid sequence
Length: 424
>Moocci.CG.ELv1_2.S644622.g29384.01.p
MDDAALFNSSASQWNNQTTQSYYDVTDEITKVRRPYVEIPYLFFAIIVGSVGNCFIIAAI
VTETRLRFAVRSCIANLAIADLIVTAVVMPTILSNILQNYRNSLDGAMWLCNILSFATSL
SCQASISSLALIGIERYCKVFVKNYNKHFCKRNTWIMISACWMYGFLLDIPLITGWMGSK
ALLGYDKDLAMCAWNDSQLGYNVFVVMMSVLIPLALTSCLYIRIFIKFREVGTRSRTQSI
QSDISTSVSDSRKGVSSPKTSNSVKSKTEWASESGSISSPSGRDSVRTHHSRVNSFTSHY
TAKLKRMVERERVLHATIFTVLVFYTIFWVPYALVVVTPARFNVQVKRATGWLALSNSII
NFFIYGILNQNFRRSYLKVAKSLKDLLLWPLHYVLLLCKGHSSAASDLQSESSDGIQHSV
KFQV
Nucleotide sequence
Length: 2,103
>Moocci.CG.ELv1_2.S644622.g29384.01.t
TATCACAGATTTTAATTAGAATTTATTTTAACTAAGTAATGGGAGTTAGTTTGTAGTAAA
ATTTTAACTAATATTGCAAAAATAAATTATGGACGATGCTGCATTATTTAATTCCTCTGC
TTCACAATGGAACAATCAAACTACACAATCATATTATGACGTCACAGACGAGATAACGAA
AGTGCGGAGACCTTACGTAGAAATCCCTTATTTATTTTTCGCTATTATTGTCGGTTCAGT
GGGTAATTGTTTCATCATAGCTGCCATTGTGACTGAAACAAGACTTCGATTTGCCGTCAG
GTCATGCATCGCTAACCTTGCTATAGCGGATTTGATTGTTACTGCTGTTGTCATGCCAAC
CATACTGTCCAATATCCTACAGAACTATCGAAACTCCCTTGATGGAGCTATGTGGCTGTG
CAACATTCTCTCGTTTGCAACTTCTCTCTCATGTCAAGCATCCATAAGTTCTCTCGCATT
GATTGGGATCGAGAGATACTGCAAAGTTTTCGTCAAGAATTATAATAAGCATTTTTGCAA
GAGGAACACATGGATTATGATATCAGCGTGTTGGATGTACGGGTTTCTACTAGACATTCC
TCTCATTACAGGATGGATGGGTTCCAAAGCATTACTGGGATATGACAAAGACCTGGCAAT
GTGCGCGTGGAATGACAGCCAGCTTGGATACAATGTATTTGTCGTAATGATGTCAGTTTT
GATTCCACTGGCGCTAACTTCGTGTTTATATATAAGGATATTCATAAAATTTCGCGAGGT
CGGTACCCGGTCTCGAACTCAGTCCATCCAGAGTGACATTTCAACTTCCGTATCAGATAG
TCGCAAAGGTGTATCATCCCCCAAAACCTCAAACTCGGTCAAAAGTAAAACAGAATGGGC
CTCCGAATCCGGCTCTATATCATCTCCTAGCGGACGTGATAGCGTAAGAACTCACCATTC
TCGAGTCAACTCATTCACCAGCCACTATACAGCAAAACTTAAACGCATGGTAGAGCGAGA
GAGGGTCTTACACGCCACTATATTCACTGTATTGGTCTTCTACACCATATTTTGGGTCCC
TTATGCCTTAGTGGTGGTTACCCCAGCCAGGTTTAATGTGCAGGTCAAACGAGCCACTGG
GTGGTTAGCTTTAAGTAACAGCATCATCAACTTTTTTATATACGGGATTTTGAACCAGAA
TTTTCGAAGATCATATTTAAAAGTGGCCAAAAGTTTGAAAGACCTGTTGCTATGGCCGCT
TCATTACGTCTTGTTACTTTGCAAGGGGCACTCTAGTGCAGCTAGCGATTTACAATCTGA
AAGTTCTGACGGGATTCAACATAGCGTTAAATTTCAAGTGTGAAAAATCGAGGTTTGAGA
TTACCTGGTGTAAACCGTGCTTTACTAGTTTTAATCAAATTTGGAACAAGGTTTTATTAC
AAGAGAACGGAGCATTGCTAAACACAAATATATAACAATCATGTTTATCTCACTGTGTTT
TTAATATCAGTAACTTTTTTACAGTAATGAATACAACAGCTAGGGGATTAAATTGTCATT
AATATATAATAACACAGAGTTTACAAAACTGTGCAACGTTAACTAAATCATTGCAAAGAA
AAACGCAAAGCGATGCAAAACTTTCATTGTTTAAGAGAACACACGCACAGACACACACAA
AACAAAAAGACTAATTAATCTTGAAAAAGAGTTGCAAATCAGTTGTTTTACCTTGTTGAC
AAAACCTACCTATATATATTTACACAGTATTTGCTAACAGAAATTTCAGCGTCGGGAATC
CTCCCCTTCATTTAACTGTTTTACATCATACAATTTGATACAGTGCCTACAAAATGTCGA
TGTTCAAAATGTCTAAGTACAACACATTAAACCAAAATGAGCAAATCGTATTATTTTTGT
TCGACATTTTGTGCATTTCGAATATCTACAATTTTTATGCACCGATTTGTTACTAGCGAT
TTTATTGCAGGTATTTAATTTTATATTTACACTGTAATTTACCATTTTTTATTTCCAACC
TTGCAGCATATATTACTTTATTGTGTCGTGTTTTTATTTTATTTTCCTCAATAAAATTAT
TGA
| PANTHER |
Mel_rcpt_1 (IPR027459) - T[32-384] 8.6E-72 |
| PRINTS |
GPCR_Rhodpsn (IPR000276) - T[37-61] 3.6E-29 - T[70-91] 3.6E-29 - T[118-140] 3.6E-29 - T[153-174] 3.6E-29 - T[202-225] 3.6E-29 - T[314-338] 3.6E-29 - T[347-373] 3.6E-29 |
| Pfam |
GPCR_Rhodpsn (IPR000276) - T[52-365] 6.7E-33 |
| ProSiteProfiles |
GPCR_Rhodpsn_7TM (IPR017452) - T[52-365] 26.992 |
| ProSitePatterns |
GPCR_Rhodpsn (IPR000276) - T[124-140] . |
| Protein Name | Identity | Bit Score | e-value |
|---|---|---|---|
| ADA1A_HUMAN | 24.854 % | 92.4 | 2.64E-20 |
| ADA1D_HUMAN | 22.857 % | 79.7 | 5.12E-16 |
| 5HT1B_HUMAN | 24.709 % | 83.6 | 1.46E-17 |