- Transcript 'Moocci.CG.ELv1_2.S64...'
Transcript Model
Transcript Id
Moocci.CG.ELv1_2.S646538.g29621.01.t
Possible name(s)
FBXL2; FBXL20; FBXL4
Gene model
Location
S646538 [19,160 / 33,510]
Amino acid sequence
Length: 625
>Moocci.CG.ELv1_2.S646538.g29621.01.p
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GPWWNENKHSDGKSFDKRPRSKPFFSEDYIDLVFEEAVYPWSIAIYETYNPGAVVRILAL
CQNFPKRKKSESDSNESYPIPMPFKPGCTHWEVLWETSDPKQNIPNVPNEARMFAPILRE
IKNTTRIIRLELCSTHLDYYTEIDAVELTGTLSYCRTSCVDPPLELVKKLSLSDDIPQHI
KNSPSELQVVQFVDNEPKTEFEPTSSSKLEVLIESIPEEIIPNHPYEGLNGNGYFDLLPT
ELKTYIFSFLPYPDLCNCASVCHLFRTLSYTPTNFSNLDLSSYWSILNDDALYSLKSRCN
VANYSKTFSEEDVNNNYGNLQRINLSWYGGGDIASSEMLKEFIMECGTLSLTVLILSSSP
AVTDNILSKISDQCPNLEHLDIRSTDKPTPEGIRVLHKLTKLKFINAYRTKIDDAGIICI
VHSNKHLEHVNIGSCFKILDYDRVLQEMADHCPNLKCGGLQSSSGCFQILTQNSPNLRKL
CVTANRTISNTEISALAQYCPKLQSLDILGTRLVTVHCLEFLLHGCPDLRFLDVSFCSSF
TSSVVDRLRRDFPKVSIKRSFQDLN
Nucleotide sequence
Length: 3,588
>Moocci.CG.ELv1_2.S646538.g29621.01.t
ACATGAAAGGTTGTATTGTGAATTAAAATCTTTCAATAGCACTACCGGCAACCGGCAGAC
CGGTATAGACCTACAAAAAGATAAAACCTTTCTGCTTGTAAGAAAGTTAGAAACGACATA
CAAATTCTCGAAACCTTCAAAATGAAGCCTTCTCAGTTAAAGTACATTAAACAATTTGCC
AGTGGTGTTATAGATTTCACGTCTCAGTATGGTGGTGAACATCCCAAAAGCTTTTCTTAT
TCAGTAAGCAACATAATTGGTGAGCCATACATTTATCCTTCATATGGAGATTGGACTCAA
GCTGCTGTCTTAAGAACATATGGACCTTGGTGGAACGAAAACAAACATTCTGATGGAAAA
AGTTTTGATAAACGCCCAAGATCAAAGCCGTTCTTCAGTGAGGATTATATAGACTTAGTG
TTTGAAGAGGCAGTATACCCTTGGTCAATCGCGATATATGAAACCTACAATCCCGGTGCA
GTTGTAAGGATATTGGCACTTTGTCAAAACTTCCCAAAAAGGAAAAAATCTGAAAGTGAC
AGCAATGAATCTTACCCTATTCCAATGCCATTTAAACCAGGATGTACACATTGGGAGGTA
TTATGGGAAACTTCAGATCCTAAGCAGAACATACCGAATGTTCCAAATGAGGCCCGTATG
TTTGCACCTATACTTCGTGAAATCAAAAACACCACTAGAATAATTAGACTGGAACTGTGT
AGCACACACTTAGACTATTACACTGAAATTGATGCTGTAGAACTTACAGGAACACTGTCG
TACTGCCGCACATCATGTGTAGACCCTCCTTTAGAATTAGTGAAGAAGTTATCTTTATCT
GATGACATCCCACAACATATAAAAAACAGCCCGTCTGAACTTCAAGTTGTTCAATTTGTT
GATAACGAGCCAAAGACAGAATTTGAACCTACAAGTTCAAGCAAGCTAGAAGTTTTAATA
GAATCCATTCCTGAAGAAATTATTCCCAACCATCCCTATGAAGGATTAAATGGAAATGGC
TACTTTGATCTACTCCCAACAGAATTGAAGACATATATTTTCTCGTTCCTTCCATATCCC
GACCTGTGCAACTGTGCTTCTGTTTGTCACTTGTTCCGTACCCTCAGCTACACTCCCACA
AACTTTTCTAACCTTGATCTTAGCTCTTATTGGAGTATTTTGAATGATGATGCTCTTTAC
AGTCTAAAGTCAAGGTGTAATGTTGCCAATTATTCAAAAACATTTTCAGAAGAAGATGTA
AATAATAACTATGGAAACTTGCAGAGAATCAATTTATCATGGTACGGGGGTGGAGATATT
GCATCTTCTGAGATGCTGAAAGAGTTTATCATGGAATGTGGAACTTTATCGTTAACTGTC
TTGATTCTCTCTTCATCCCCGGCAGTTACCGATAACATCCTTTCCAAGATAAGTGACCAA
TGTCCCAACCTTGAGCATTTGGATATTCGATCAACTGACAAACCTACACCAGAAGGCATC
CGTGTTTTACATAAGCTTACCAAGCTTAAATTTATTAACGCTTACAGGACTAAGATTGAC
GACGCTGGTATTATATGCATCGTACATTCAAACAAGCATTTGGAGCATGTCAACATTGGA
AGTTGTTTTAAAATCCTTGATTATGACAGGGTTCTCCAAGAAATGGCAGATCATTGCCCA
AATTTGAAGTGTGGAGGTTTGCAAAGCAGTTCAGGATGCTTTCAAATTTTGACCCAAAAC
TCTCCGAACCTTCGTAAACTTTGCGTCACAGCCAACAGGACCATATCCAACACTGAAATT
TCAGCACTTGCTCAGTACTGCCCTAAACTACAGAGCTTGGACATATTGGGGACCAGATTG
GTGACAGTTCACTGTCTTGAGTTTTTACTCCATGGATGTCCGGATCTACGATTCTTGGAT
GTTTCATTCTGTTCATCTTTTACCTCTTCAGTTGTAGATCGATTAAGACGAGATTTCCCA
AAAGTTTCAATCAAACGAAGTTTCCAAGATCTTAATTAATTAATTTTTAGTAACTAATAA
TTAGTCTAAAAAATTTTTTTACTATACTGGTATTTTATTTTTGATTACATGTAGAATCCT
ATGTTTAGATAAATTAGATTATTAAAAATTAAAATTTTAAAAATACTTTCTACTTCTGTA
TTGCATTTTAATCAATAGTATGAGCTTTATTTCGCTATTTTTATTTCAACTTACTTCATT
TTTCCAGAGAATTTATCGCTTTATCTTGAGATTTATTCAGGGTTTGATAAAGTTTATAAC
CTTGCCGGAATTTATAGAAACTAAGCTACTTAAAACACAAACGCATTTTGTCTCACAGAA
AAATGTGTTACTCTTTTCCAAATTTATATTGTAACCATTGTTAAAAATATTTTTTAATAA
AATCTTACTGTGGCATGTGCTGGCGTACGGGAATCTAATTCCCATATTCCCGACTTTTTC
GTGTGTAGAACCTGCCAGCTGGTGGCCCAATGTTCCCTCAGAGTATTTTTACGCGACCCA
GAAGGGATTTTGTAAATTTAATAAACTGTGGTCCCTCCTGCTATATTTAACTTTTAAAAT
TGTATAGAGTCAAAATTAGATTAAATATCTTAAAATAAAAATTTTTAGAAGTTTAATTGA
CCTTTCTTTGTATAAATAACTAAACATTAATTTGAAATNNNNNNNNNNCCAATAGTATGG
GCTTTATTTCGTTATTTTTATTTCAACTTACTTCATTTTTCCAGAGAATTAATCGCTTTA
TCTTGAGATTTATTCAGGGTTCGATAAAGTTTATAACCTTGCTATGGTTGAAAATAATTT
TTACAATTTTAAAAGATCTAAATATTATTTTAAATCAAAGAGGATTGATTTCATTTTAAC
GTTAAGCATAATATACTAGGCAGTGTGCAACGTTTTATGTCCGTGGTCTGACTTATAAAA
CCAACTTTTAAAGTAAACCAACCGAACGTAATTAATAAATTGTGCCGCCACACGATTTCA
AATTAATGTTTAGTTATTTATACAAAGAAAGNNNNNNNNNNTTGTTTTTTTATTGTAGTA
GTGGTTGAAAATATTTTTTACAATTCTAAAAGATCTAAATATTATTTTAAATCAAAGAGG
ATTGATTATATTTTAAGGTTAAACATAATATACTAGGCCAGGAGTGTGGAACGTTTTATC
TCCGTGAACTGACTTATAAAACCAACTTTTGAAGCAAACCAACCGAACGTAACTAATAAA
TTGCCCCGCCATAGATTTCAAATTAATGTTTAGTTATTTATACAAAGAAAGGGCAATTAA
ACTGCAAAAAAATTGTATTTTAAGATACTTAATCTAATTTTGACTCTATACAATTTTAAA
AGTTAANNNNNNNNNNTGTTTATTTTGTTTTGGGATTTTATTTAAAAATACAAATTTTAT
TCATTTTACTGTATTTCACACNNNNNNNNNNCAATTTTATAGTATCAATTAAAAAATAAA
TTTCTCATTAACGAGTGAGAATTATTCAAAACTAAACATANNNNNNNNNNCGTTTATTTT
GTTTTGGGAATTTATTTAAAAAATACAAATTTTATTCATTTTACTGTA
| SUPERFAMILY |
F-box-like_dom_sf (IPR036047) - T[286-351] 3.4E-14 |
| ProSiteProfiles |
F-box_dom (IPR001810) - T[292-338] 9.497 |
| Gene3D |
LRR_dom_sf (IPR032675) - T[294-516] 1.1E-30 - T[517-621] 1.3E-12 |
| Pfam |
F-box_dom (IPR001810) - T[297-332] 1.7E-7 |
| SMART |
F-box_dom (IPR001810) - T[298-338] 4.9E-5 |
| SMART |
Leu-rich_rpt_Cys-con_subtyp (IPR006553) - T[434-459] 31.0 - T[484-511] 620.0 - T[534-559] 210.0 - T[560-585] 65.0 - T[586-610] 360.0 |
| Protein Name | Identity | Bit Score | e-value |
|---|---|---|---|
| FXL20_HUMAN | 25 % | 86.7 | 4.91E-18 |
| FBXL4_HUMAN | 35.504 % | 348 | 9.23E-112 |