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Transcript Model

Transcript Id

Moocci.CG.ELv1_2.S650429.g30203.03.t

Possible name(s)

RAB11A; RAB11B; RAB25

Gene model

Moocci.CG.ELv1_2.S650429.g30203

Location

S650429 [25,532 / 33,939]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 252

>Moocci.CG.ELv1_2.S650429.g30203.03.p
MKSYTYSDMFLIPVIVLLTYCLEKRFQQKFRRIMGTKDDEYDYLFKVVLIGDSGVGKSNL
LSRFTRNEFNLESKSTIGVEFATRSIQVDGKTIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGA
LLVYDIAKHLTYENVDRWLKELRDHADNNIVIMLVGNKSDLRHLRGVPTDEAKAFSETHG
LSFIETSALDSTNVETAFQNILTEIYRIVSQKQIHDSQADEIPNKDSQGIGIVIPSTNGP
STSKQSTCCKAL

Nucleotide sequence

Length: 1,822

>Moocci.CG.ELv1_2.S650429.g30203.03.t
ATGAAAAGCTATACCTATTCTGATATGTTTCTTATACCTGTAATTGTATTATTGACCTAT
TGCCTGGAAAAAAGATTTCAACAAAAGTTTAGAAGAATAATGGGAACTAAAGATGATGAA
TATGATTACCTTTTTAAAGTTGTGTTAATTGGGGACTCTGGTGTAGGAAAGAGTAATTTA
TTATCTCGATTCACAAGAAACGAATTTAATCTTGAAAGTAAGAGTACAATTGGAGTAGAA
TTTGCGACACGAAGTATTCAAGTTGATGGAAAAACGATAAAAGCCCAGATCTGGGACACA
GCCGGACAAGAAAGATATAGAGCAATTACGTCTGCATACTACAGAGGAGCTGTTGGTGCA
TTGTTAGTTTATGATATTGCGAAACATTTAACATACGAAAATGTTGATCGGTGGTTAAAG
GAACTCAGAGACCATGCTGACAATAATATTGTAATAATGCTTGTCGGTAATAAAAGTGAT
TTACGCCATTTAAGGGGAGTACCAACCGATGAAGCAAAAGCATTTTCAGAAACACATGGA
TTATCGTTTATTGAAACATCAGCGTTAGACTCCACCAACGTTGAAACTGCATTCCAAAAT
ATTCTTACTGAAATCTACCGCATTGTCTCACAAAAACAAATTCATGACTCCCAAGCGGAT
GAAATACCAAACAAAGATAGCCAGGGAATTGGTATAGTGATCCCTTCAACCAATGGTCCC
TCTACATCTAAACAGTCCACCTGTTGCAAAGCACTTTAGGCAATTAGTTGGTGATTTTAT
CTCTTTCTCAAGCAGATATAATTCATTTTTCTAGTCCTGTTCCTGATAGGCCTCTGCACT
TGATTTGTTTATTTTAACAGTTAATATATCAATCCAACGATTTTCCGCAAAAATGATTAA
GATATTTATCAAGTTTATCATAATTTTATTATTACATTTACTGAGATTTTTTCATATTTC
TCTTTAAAATAGGTGCATTAAACTTCAGAATAATAAATTTTCCCTATTTTTGTTTGAATT
TTAGCTGTAATTAATATTAACTTTATTATTAAATTTTATTACTTATTAATAGATTGTTTA
CTAAGATTATTTGTTTTAAAATGTGTGGATATTATAATTAGGCTTGTATAATTTTTTAAT
TGTAAATGCATCCCATACACTTTATGCTGGTATGACGTTTCCACAACTGACTGTTTAAAA
TGATCATTTTTCTTAACCACCATTTCGTCCAGTCATCAAACAATTCTAAATAAAGAGATT
TTTAATGGGTGGTTATTAACTTTGTAATTCTATCTTTGCTTCAAAACTTAATGTTAAAAC
TTACATAAACAAATTACTTTGTAATTTACTATCCAGTATGAATAAATTATAGTAAAATAA
AAATTAATTTGCTATTATGCGATTTTTTTTCTTTTTCAAAGAGTAATGTAATATTAGATG
TGTGTTTACAATTTTTTTTTATTACAAGTTTCAAAAAATTTAATTTTTATTCTCTATTAA
TATAAAAGTTGTATTGCTATCGCAGAATATCAATATACTTATGTATTCTGTAGTTCTAGC
AATCTTTTACTGGTGCAAAATAATTAAGAAAAATCTACACATTGTCATTTGTTTTAAATA
TGATTTAAAAATAATGAATACCCTAAAAAATTTAATATAATTTAAAAGCTCCGTGCTATT
TGTTGTATTTTGTATATGCTTTCTTATGATGAACAGTTTTTAGTAGCGATTAATTTGAAT
GTCATGCAAGTAATATTATACAGCTACACAGATTTGTATTACATTGATTCTGTTAATAAT
ATTCATTACCTATATATATTTA

InterProScan

SUPERFAMILY
P-loop_NTPase (IPR027417) - T[40-213] 1.45E-59
TIGRFAM
Small_GTP-bd_dom (IPR005225) - T[43-201] 1.5E-45
Pfam
Small_GTPase (IPR001806) - T[46-206] 1.1E-61

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
RB11A_HUMAN 80.455 % 361 3.56E-128
RB11B_HUMAN 83.636 % 365 7.48E-130
RAB25_HUMAN 57.798 % 258 1.42E-87