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- Transcript 'Moocci.CG.ELv1_2.S79...'
Transcript Model
Transcript Id
Moocci.CG.ELv1_2.S79567.g01067.01.t
Possible name(s)
EXD3; EXOSC10
Gene model
Location
S79567 [41,805 / 49,424]
Amino acid sequence
Length: 783
>Moocci.CG.ELv1_2.S79567.g01067.01.p
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HPYQYEIEHFIPEASQLQRKEPEKYTDFPKVPCEVVSDKEELMQIVKELENCKEIAVDLE
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RPTTTVSSSANSENCNLTYRDFLQPNFVWKLKAPPKPKGNSKPDQQPKLNQTSAAKTEKE
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FKN
Nucleotide sequence
Length: 5,906
>Moocci.CG.ELv1_2.S79567.g01067.01.t
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GTTCGTTCAAGCAGTGGCCTTCCACAACAACAAGATGACTACGATCTTTACAATACTTTT
CCTGGTTTCAGAAATTTTGTCAAGGAACACAGCACCGAACTTTTGAAAACAATGAATAAA
TGCTTAAATTATGAAGGTTTAAATAAAATTCCTGATGTAGCGGAACATTCATCAATTTCC
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ATGTTAATTGACGAAGAGAAAAAATTACTGAAAAACAAATCTGACCATGGGAAACAAGAA
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GATGATATAAATGAAACATCCTTGATTATTGCTAATCTTGTAAGACAGGGAAGAAACTAC
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CCATGTGAGGTTGTTTCAGATAAAGAAGAACTGATGCAAATCGTGAAGGAGTTGGAGAAT
TGCAAAGAAATTGCAGTCGATTTAGAGCATCATTCATATAGATCATTTCAGGGTATCGCT
TGTTTAATTCAAATTTCTACAAGAAAAAATGATTATTTAATTGATGCACTTGCATTGAGA
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TTTTATAAGTTTATGCCATTTTGTGAACGACCAACAACAACTGTTTCTTCTAGTGCAAAT
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AAAAATAAATAAAGCCAGCTTAATCTAATGGATAAAAAAAATACCAATTGCCAGTATCCT
CGGATACGAAATGATCATTCTTTTTATCTGTGATAACTTATATCCGCAACTCATCTCCAA
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GAACTAGCCATGTGAAATGTTTTAGTGTCAATGGTTGAGTTAGTTACATAATGCACTAAT
GAGTCTGATTTTGGCGGTAAATATGTTTCATTCCATCTATCTTTAAAAGTTTTTCGTAAT
TCTTCATCAAAGTTTGAAAAAGAAATAACTTCATTTTGATTAGTATCAGTATTTTTTGTT
TCATTTTCCACAGCAGTTTCACTTGACACAGCTACATTTCTTAGCTGGCAACATATTGAA
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TTTTACAAAAGCTATGTTTATTGTTTAAATCTTACTTTGCACAAAACAAATTAAATTTAA
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ACATTCTAATAAATATAAATTACAATAGTAACTAAACTATTAACAACAAATAATAATTAG
TTTTAAATGAAGTAAACCATAAATTTACATTTCAGTTTTAAAAAATCTTAACAGTGGGAT
ATAATGATTAGGATTAACGAGGCAAGACGGTCATAGGGTTCATAGGAAAACTTTACAAAG
CAATATAAAGGCACAGAACTATATACCGGTGTCCAGTATACCGGTAATATAAATTATGAA
AATAGTATTTTTTTAGAACAGTATTTATAAATAAATATCTATTCTTTGAATTTAAAAAAA
TTTCCTTAAGCTTTCATTTTCTAATCTTAATTGTTCATTTTCAGATACTAGTACAGGATT
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TACTTCACGGAGATGATGATTATGTGAATTAACATTTTTTTCATGCAAATCTTCAGCGTG
CAGCTGCATGGCAGCAAGCAAACTTTCAGACTGTTGCTTCAACGCAGTAATAAATATGTC
AGATTGAGCTTTAAGTGCAGAAGTAAGAACTTCATGTGATACAAAATTGGCATCACCATT
TACAAATGATTTAGATGGTGCTTCAAAACTTTTTTTATCGACCAACAATTTTTCTTTATC
AATATTGTCTTTAGAATTAGAAAATACATTATCATGATGTGCATCAGCATTTTCAATTAT
ACTCTGCAAATTACTGTTCATTGGTGTTGATGACTTTCGTGCATCTCTTTTAGTAGGTTC
TATAAAATTAAGTTTAGGTGTTTCAAAGTTATTTTGATTAGTTAAACTTCGGGATGGTGC
AACAATACTTGAAGTTCCGCTATTTGATAAAATTTGCTGGTGAGGAGTATTAGTTTTGCT
TTGTGTGGGGCTCATTGAATCTTTACGCAGTGGAGACATAAAATCCTCACAGTAAGAACC
CATTGAATCTCTAGAAGATGAAAATGTATTACCTAAAGTCTGTCGTAGCAAAGAACTCTT
TGAAACAGGACTATGTCCATTTGAAAGAGGTGTATTTACTTGCAAATTATTTATAACAGG
TTGTGATATTTGGTTATCTTTTATTGAACTGCTTGTACTATTTTTAGGCATACTCTCATT
CACCTTATTTTTAATAGAACTTGTGTCAGATTTAATATTGTATGAAACACTAACATTAGT
TTTAGAATGTCTAGATAGTCTTTTGTTAGGAGAAACTTGTCTTGCAAGACATTGTACAGA
AGAATCATGTGCTTTTAAAACATCTGTATATTTTGATGAGCTTCGGAGATCGAATTTGTA
AATTTTTCCAAGGTAAGTACCAGCATACAGATTAACACCATTTTGAGTAAGACATACAGA
TGTGAGTGGTTGATCCAAAATCTTCACATCTATTTCTTTTTTACCATTAGCATCATGTAA
TATTATTTTTTTATCCAAACCACATGAAACCAACAACAAATGATTCAAGGGTGAAAATGA
TAAATCCATTGCAGTCGCAGAATGGGACTTTGAAAATTTATATTTTAGATTCATTTTATT
TATATCCCAAAGGCAAACATGACCACTATCTCCAACTGAACCAAAGCTGTTTGTTTTCCA
AAAGTTCCATCTTATCGCTCTTATTGTGCTACTTTTAGTTCCATTTAATTTCCCTATAAA
CTTTCCTGTTTCTATGTTCCACAGTAACAATTCTCCAACACCATTTCCGGTTATAACATA
ATTATGCATATCATTTATTTCAAGGCATTTAATTGGATCGCTTGGACCATCTGAAAACTT
TTTAACAACAGTTTGGCTTAAAATATCGTGCAGATAGAGTTCACCACAAGCACCACCTGA
AACAACCTGTGAATCATTATTCAAAAGTGCAGCACAATTTTGTTCTTCTCCCGATGCAAA
AACTCCAACAACTTCTGGTTTATTACTTTTGTACAAATTGTTGTTTGCAAAAATTATTTT
GTCTCCTTTACTGGACGTACTTAATATATGTTCGTTGTTGCTACTCCACCGTAAATTGTT
TACATTTTCACTATGATAATTATATTCCTTCAAAAGTGTCATATCATCTCCATCCCATAT
TTTAATTTTATCACCAGCAGAAGCAAAGATTGCTTTTGACATTTTATCAACAAAAATAAA
ATTGTAATCCTCAATTGAATCTAAAA
| Pfam |
Exosome-assoc_fac_Rrp6_N (IPR012588) - T[29-117] 7.4E-17 |
| SUPERFAMILY |
RNaseH-like_sf (IPR012337) - T[169-203] 1.8E-79 - T[239-471] 1.8E-79 |
| SMART |
3'-5'_exonuclease_dom (IPR002562) - T[273-441] 1.8E-47 |
| Pfam |
3'-5'_exonuclease_dom (IPR002562) - T[274-440] 1.3E-44 |
| SUPERFAMILY |
HRDC-like_sf (IPR010997) - T[483-570] 4.45E-23 |
| ProSiteProfiles |
HRDC_dom (IPR002121) - T[492-572] 15.675 |
| SMART |
HRDC_dom (IPR002121) - T[492-572] 3.1E-17 |
| Pfam |
HRDC_dom (IPR002121) - T[497-562] 2.5E-12 |
| Protein Name | Identity | Bit Score | e-value |
|---|---|---|---|
| EXOSX_HUMAN | 46.013 % | 552 | 0 |