Aniseed - Transcript Card

Transcript 'Cisavi.CG.ENS81.R0.1...'

Transcript Model

Transcript Id

Cisavi.CG.ENS81.R0.1384844-1389956.15219.t

Possible name(s)

KCNK10; KCNK2; KCNK4

Gene model

Cisavi.CG.ENS81.R0.1384844-1389956

Location

R0 [1,384,843 / 1,389,956]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 313

>Cisavi.CG.ENS81.R0.1384844-1389956.15219.p
MDLKTLGCLIVAYFIYLLLGAAVFSAIEGPIELQNCRESQRILDEAIKNLRNGNLTENRL
RYLVETMALFYENGIPLSQNISCENRNWNFQSAFFFAGTIVTTIGYGHITPSTRGSRAFC
IIYALLGIPLFAIMFSGLSALFGSALKRVSTMLDNKEMHPFIQNLAIFFVFVSVGFLLFC
FIPAVIISAAEQWEYSDSIYYAIITLTTIGFGDFVAGDNPHMVYTPLYRVMVYFWILFGL
AYMATVINVLTERFRQRGLSIKKRLTGYEEAEGENGAENGQPTHSKTSSNGEDNISRENN
APNETSSLKNHSS

Nucleotide sequence

Length: 1,617

>Cisavi.CG.ENS81.R0.1384844-1389956.15219.t
CTTTACAGGTGTACGGTGTAGTTTCATTGCTTCTGTATCTTAATGGATTTAAAAACGTTA
GGGTGTTTAATAGTCGCATATTTTATTTACTTGTTACTTGGGGCTGCTGTATTTTCAGCA
ATCGAAGGGCCCATCGAGTTACAAAATTGCCGTGAATCACAACGAATTTTAGACGAAGCC
ATTAAGAACTTAAGGAATGGCAATTTAACTGAAAATCGGTTGAGATATCTTGTTGAGACG
ATGGCTTTATTTTATGAAAATGGAATTCCCCTTTCTCAGAACATAAGTTGTGAAAATAGA
AACTGGAATTTTCAGAGCGCTTTCTTTTTTGCCGGCACCATTGTAACAACAATAGGTTAT
GGACACATTACACCGAGCACAAGAGGAAGCAGAGCCTTCTGTATAATTTATGCTCTGCTA
GGAATTCCTTTGTTTGCAATAATGTTTTCAGGGCTAAGTGCACTCTTCGGTTCCGCATTA
AAAAGGGTTTCAACGATGTTGGATAATAAGGAGATGCACCCATTCATACAGAATCTTGCG
ATTTTCTTTGTCTTTGTTAGCGTGGGCTTTCTGCTTTTCTGTTTCATACCCGCGGTTATA
ATATCTGCAGCGGAGCAATGGGAATATAGTGATAGCATATATTATGCCATAATCACCCTC
ACTACTATTGGATTTGGTGACTTTGTAGCAGGTGACAACCCGCACATGGTATACACACCA
CTATACCGTGTGATGGTCTATTTTTGGATCCTATTTGGCCTTGCTTATATGGCTACCGTC
ATTAATGTATTAACAGAACGGTTTCGTCAACGAGGCTTGTCAATCAAGAAGAGATTGACA
GGGTACGAAGAAGCAGAGGGTGAAAATGGGGCTGAAAATGGCCAACCCACCCATTCGAAA
ACCTCATCGAACGGGGAAGATAATATTAGCAGGGAAAATAACGCACCAAATGAAACCTCA
AGCTTGAAAAACCACAGCTCCTAATACCATTGCATTATATTTTACAAACAATTTGAAAAA
TCGTATATGACTAGCAAATCATTATGTCTGATATTTTTACAATATTTGTATATTTGCAGA
ATGTATATCCATAAAAGTCTAAACAAAAAATAAGAAGTCCAAAACTATTCGGAAAGTAAA
TCTGATGGTGGATTTGATTCACACTACACGATGCCTTAAAGTTAAAGTATTTTTTTATCT
TTGTATGCTTTGTTTTTGTGGCAAGGACCTACAAATTTATACAAACAGGCGGTAAGTTTA
AACTTGTAAATCATCACTTCCAGGTTATCTGTTGTAACATGTATTTCTTATATTTTCACA
TATTACTTCTTTTATTATTATTTTATCTTGCCGAAATACTTATTTAACGTTGCCTCTAAA
TTTAGTGTTTTGTATTGCAAATCTGGGGATAGACAGTGTTTGGTTAAATATGCTTATGAG
CCTTAACTGTGTTTTATCTGCAAAAAAACGTAAGTTGTTATTTTGGCATATTGTGCAATG
ATATTAGTTTATTTGTTTTTAGGAATTTATTACATGCCTTATATTTATAACTATTGCTAT
TGTTTATCGCTTTTTTATTTAAATGCCTTATTGCTATGTTATACCACTGTATACCCG

InterProScan

PRINTS	2pore_dom_K_chnl_TASK (IPR003092) - T[9-31] 8.6E-11 - T[132-148] 8.6E-11 - T[231-245] 8.6E-11
Pfam	K_chnl_dom (IPR013099) - T[83-139] 3.6E-17 - T[176-255] 8.1E-17
PRINTS	2pore_dom_K_chnl (IPR003280) - T[99-127] 1.7E-16 - T[207-216] 1.7E-16

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value
KCNKA_HUMAN	39.08 %	177	2.66E-51
KCNKG_HUMAN	33.803 %	155	1.99E-45
KCNK2_HUMAN	36.641 %	167	1.36E-48