Aniseed - Transcript Card

Sequences

Amino acid sequence

Length: 1,309

>Cisavi.CG.ENS81.R162.269581-275884.01555.p
ETYAKALDSVDSGYVEGCCPGLTDASICPTTCPKDKVCDGSSCVYPRDCPCYRNAIRRTT
GAVWKENNGCSNCICMGGEVQCVKETCEVTSCPAGQKLDFAHPDDCCAVCMEDDNSCIDE
SGQLHNVGDSWTSQVNTCELCSCTMQGVKCEAEPCSEVEKPICSDGQMLVTKESGCCSEY
DCVCDKAMCTSTMPICDEHFSAVIVNPTDCCPIYECVCRSETCPVSPSCAFDERRERVNS
DTECCGEYKCERIGCVDESGNFHEVDTTWSMTSDACQQCSCLGDRNIMCKARECADIAKP
TCPGGIEPSVVFDIDGCCASYVCDFVCRGYAGSSRIHTFDGFSYARSCPCSHVLAKDSFG
ANFEVSVKRGYCSGSICTKSLIITDKLSNEIYELSADSKVPETTSSSFVIEIVGKVQTVT
AKSSGVKVVFDQASDTWSIHVPAKFSGQTEGLCGLADSEISNDLWMGSYAVASVSSTATA
NSEDIGAFFNHWLATDSDVGISAGVNGEAVTSACLSDALPETGLIAGGGSSLVRSYCDQL
FASSVFSPLASVVDPSEYVDTCVRAIAGLPVMKIGVAVSADWPGCSVFAAYASAAARVGK
CIEWRNNDFCPYSGCGAGNVYMGCGTSIVKTCDNFKTFNGLSVTYDTEGCFCTGGKVLLD
GECIEASDCPVCSDESGYGRKAGDQWYNAGEPCIVATCQPDSSVVQSQMSCPPAPLCSPN
EVLAKLSDDSVCCTAYVCLPDNHESKCAGLRCPPIVRPRCAVGEQWKATPSGPLSCCLTY
TCECSSDSCPTTPVPSCEEGEELEVVGTDDCCPSATCICKPDTCAPTPECFEAGYVLKVV
EEGRCCVTYECMCDRDTCVATEVPSCLGGETAVVANPGECCPVYACQCDKSQCKPCIEEC
AAGFTRVLVSEPGACCDEYDCKCDVTQCPIAKITPCSSLAGYRLISSAKEIRAPGLPECC
ASEFEEICICDVASCPISTVKCASYERKYQTNPGECCPTYACECDNTQCERGEMSCSSKQ
HLVEKVINSCCSVTVCECDVCEPAQLCKEGWTESDTFDQCGCTIRECVPPTECVHLGETH
EPGLTWMEDVCTECSCSTSPNSLGEYETTCSMIKCGTCSSGYTYVPVAGQCCGDCVQTVC
HHEGKQFAPGQTWIVPDDQCTTCECMIDPISNEVYSQCSAPACAPIDPLCAPEDILSTED
GCCTYCRTRNLPETKCRPVSDFFEEMEHGGCKSAEKVNVTMCEGQCTSASVFSSEAGVFQ
KQCSCCSTIKTEKRTVDLVCPDLSTKVYVYEVALECACHATACGSEPVL

Nucleotide sequence

Length: 4,108

>Cisavi.CG.ENS81.R162.269581-275884.01555.t
GAAACTTATGCTAAAGCGCTGGATTCAGTAGATTCTGGATATGTTGAAGGATGTTGTCCT
GGTCTTACTGATGCATCAATATGCCCAACAACTTGTCCCAAAGACAAAGTATGTGATGGT
TCATCTTGTGTTTATCCCCGTGATTGCCCTTGCTACCGAAATGCCATTCGTAGAACGACT
GGTGCTGTGTGGAAAGAAAACAATGGATGCAGTAATTGCATATGCATGGGTGGAGAAGTT
CAATGTGTCAAGGAAACCTGTGAAGTTACAAGTTGCCCAGCCGGTCAGAAATTAGATTTC
GCTCATCCAGATGATTGCTGTGCCGTTTGCATGGAAGATGACAACAGCTGCATTGATGAA
TCTGGCCAACTCCACAATGTTGGTGATTCATGGACCAGTCAAGTAAATACATGTGAACTT
TGCTCTTGTACAATGCAAGGTGTTAAATGTGAAGCTGAACCTTGTTCGGAGGTTGAAAAA
CCAATTTGTTCGGATGGACAAATGCTGGTGACAAAAGAATCCGGTTGTTGCTCTGAGTAC
GACTGTGTGTGTGATAAAGCGATGTGTACTTCAACCATGCCAATTTGTGATGAACACTTT
TCCGCTGTTATTGTCAACCCTACTGATTGCTGTCCCATCTACGAGTGTGTGTGCAGATCT
GAAACTTGCCCAGTTTCTCCATCTTGTGCATTTGATGAACGACGTGAAAGAGTTAATTCT
GACACAGAATGTTGTGGAGAGTACAAATGTGAACGTATTGGTTGCGTTGATGAGTCTGGA
AACTTCCATGAGGTTGACACTACATGGTCAATGACAAGTGATGCCTGTCAACAATGCTCA
TGTTTGGGTGATCGTAATATCATGTGTAAGGCAAGAGAGTGTGCAGATATCGCAAAACCA
ACATGCCCAGGAGGAATTGAACCTTCAGTCGTTTTTGATATTGATGGTTGTTGTGCAAGT
TATGTCTGCGATTTTGTCTGTCGTGGGTATGCTGGAAGTTCACGTATTCACACATTTGAT
GGCTTTAGCTATGCTCGCTCATGCCCATGCTCACATGTTCTGGCAAAGGATTCATTCGGT
GCAAACTTTGAAGTTTCAGTCAAGCGTGGATACTGTTCTGGATCTATCTGTACAAAGTCT
CTCATTATCACTGACAAATTGTCAAATGAAATCTATGAGCTGAGTGCTGATTCTAAGGTA
CCTGAGACAACATCAAGCAGTTTTGTCATAGAAATCGTTGGTAAAGTGCAAACGGTGACT
GCAAAGTCATCCGGTGTCAAGGTTGTATTCGACCAAGCATCCGATACATGGTCTATTCAT
GTACCGGCTAAGTTCTCCGGACAAACAGAGGGATTGTGTGGTTTGGCTGATAGTGAAATT
AGCAACGACCTTTGGATGGGTAGTTATGCAGTAGCGTCAGTGTCTTCAACTGCAACAGCA
AACTCCGAAGACATTGGAGCCTTTTTCAATCATTGGTTGGCCACAGACAGTGATGTTGGA
ATATCTGCTGGAGTTAATGGCGAAGCTGTAACAAGTGCATGCTTATCAGATGCCCTGCCA
GAAACAGGTCTTATTGCTGGTGGAGGAAGTTCTCTAGTGCGATCATACTGCGATCAACTC
TTTGCATCTTCAGTCTTCTCACCTCTTGCTTCTGTTGTTGATCCAAGTGAATACGTTGAC
ACTTGTGTACGAGCTATTGCAGGGCTACCGGTTATGAAGATTGGTGTGGCTGTTTCTGCT
GATTGGCCAGGCTGTTCTGTCTTTGCTGCTTATGCAAGTGCTGCAGCAAGAGTTGGAAAA
TGCATTGAATGGCGTAACAATGATTTCTGTCCATACAGTGGATGTGGTGCAGGGAATGTG
TACATGGGATGCGGAACTAGCATTGTAAAGACATGTGATAACTTTAAAACTTTCAATGGA
CTTTCAGTAACATACGACACTGAAGGCTGCTTCTGTACTGGTGGAAAGGTTCTTCTTGAT
GGAGAATGTATTGAAGCATCAGATTGTCCTGTATGTAGCGATGAAAGTGGATATGGACGT
AAGGCTGGTGATCAATGGTATAATGCTGGAGAACCATGTATTGTAGCAACTTGTCAACCT
GATAGCTCGGTTGTTCAATCACAAATGAGCTGTCCACCTGCCCCACTATGTTCACCAAAT
GAGGTACTTGCTAAACTATCAGATGATTCTGTATGCTGCACTGCTTATGTCTGCTTGCCT
GATAACCATGAATCGAAGTGTGCTGGATTAAGATGTCCACCAATCGTTCGACCACGATGT
GCTGTAGGTGAGCAATGGAAGGCTACGCCATCTGGACCACTTTCGTGCTGTCTTACCTAC
ACATGTGAATGCAGTTCTGACTCATGCCCAACTACACCAGTGCCGTCATGTGAGGAAGGT
GAAGAGCTTGAAGTTGTTGGCACTGATGATTGTTGCCCAAGTGCAACCTGTATTTGCAAG
CCTGACACCTGTGCTCCTACACCTGAATGTTTTGAGGCTGGTTATGTACTAAAAGTGGTG
GAGGAAGGAAGATGCTGCGTTACATATGAGTGCATGTGTGACAGAGATACATGTGTAGCT
ACTGAAGTTCCAAGTTGTCTTGGTGGCGAAACAGCAGTTGTTGCCAATCCAGGCGAATGC
TGTCCAGTATATGCTTGCCAATGCGACAAATCTCAATGCAAGCCATGCATTGAGGAATGT
GCAGCAGGATTTACCAGGGTGCTTGTCAGTGAACCAGGTGCATGCTGTGATGAGTACGAT
TGCAAGTGTGATGTTACTCAATGTCCAATAGCTAAGATCACTCCTTGTTCATCTCTTGCT
GGCTACAGATTGATATCATCTGCGAAAGAAATTCGAGCACCTGGTTTACCTGAATGTTGT
GCAAGTGAATTTGAAGAGATCTGTATTTGTGATGTTGCTAGTTGCCCAATTTCGACAGTG
AAATGTGCATCATACGAACGCAAATACCAGACTAACCCAGGCGAATGTTGCCCAACATAT
GCATGCGAATGCGATAATACACAATGTGAGAGAGGTGAAATGTCATGCTCCAGCAAGCAA
CATCTTGTTGAAAAGGTCATTAACAGTTGTTGTTCGGTCACGGTGTGTGAATGTGATGTC
TGTGAGCCAGCCCAACTCTGCAAGGAGGGATGGACAGAATCAGATACGTTCGACCAATGT
GGTTGTACAATCCGAGAATGTGTTCCTCCAACAGAGTGTGTCCACCTTGGAGAAACACAT
GAACCAGGTCTCACCTGGATGGAAGATGTTTGCACTGAATGCAGTTGCTCTACATCTCCC
AATTCACTGGGTGAATACGAGACAACTTGCAGCATGATTAAGTGTGGAACTTGCAGTTCT
GGCTACACATATGTTCCAGTTGCTGGTCAATGTTGTGGTGATTGCGTACAAACTGTTTGT
CACCACGAAGGAAAACAATTTGCACCTGGACAGACTTGGATAGTGCCAGATGACCAATGC
ACCACATGTGAGTGTATGATTGATCCTATATCAAATGAGGTCTACAGTCAATGCAGTGCA
CCAGCTTGTGCACCAATCGATCCTCTCTGCGCCCCAGAAGATATTCTTAGCACAGAAGAT
GGATGCTGCACTTACTGCCGAACAAGAAACTTGCCAGAAACCAAGTGCAGGCCTGTGTCT
GACTTCTTTGAAGAAATGGAGCATGGTGGTTGTAAATCTGCGGAGAAGGTTAATGTGACG
ATGTGCGAGGGGCAATGTACAAGTGCATCAGTCTTCTCATCAGAGGCTGGAGTCTTCCAG
AAGCAATGTTCATGCTGTAGCACAATCAAGACAGAAAAGCGCACTGTAGACCTTGTGTGT
CCTGACCTGTCAACCAAGGTTTATGTGTATGAAGTCGCATTGGAATGTGCCTGCCACGCT
ACTGCATGTGGTTCAGAGCCTGTACTGTAGGTTGATTTTATCTTCAACTGACAGATCTTT
GACAACGGACGAATAAGAGGAATCACAGAATTTGTAATGATGCCACTACTAAATTGTTTA
CAGCATTTTTGATTTAAGATTTTAATTTTCCTAAAAATTTAAATTCTTTTACATTGACGT
ATTTAGCTTTTTATTTGGTGACAAACGT

InterProScan

SMART	VWF_dom (IPR001007) - T[51-110] 0.0015 - T[117-182] 4.2E-6 - T[255-323] 7.4E-6 - T[672-738] 1.4 - T[1073-1135] 2.6E-7 - T[1140-1206] 0.39
ProSiteProfiles	VWF_dom (IPR001007) - T[51-111] 9.998 - T[115-185] 9.552 - T[253-324] 9.079 - T[1071-1136] 10.836 - T[1138-1207] 9.198
ProSitePatterns	VWF_dom (IPR001007) - T[138-182] . - T[1091-1135] .
SMART	VWF_type-D (IPR001846) - T[316-469] 2.2E-16
ProSiteProfiles	VWF_type-D (IPR001846) - T[327-540] 20.168
Pfam	VWF_type-D (IPR001846) - T[332-466] 9.2E-11
SMART	Unchr_dom_Cys-rich (IPR014853) - T[530-611] 1.3E-4
SUPERFAMILY	Ser_inhib-like_sf (IPR036084) - T[614-670] 1.8E-7
Pfam	VWF_dom (IPR001007) - T[1073-1135] 1.2E-6
ProSiteProfiles	Cys_knot_C (IPR006207) - T[1216-1304] 14.292
SMART	Cys_knot_C (IPR006207) - T[1219-1304] 1.3E-21