Aniseed - Transcript Card

Transcript Model

Transcript Id

Cisavi.CG.ENS81.R27.1072123-1078198.16488.t

Possible name(s)

SFXN1; SFXN2; SFXN3

Gene model

Cisavi.CG.ENS81.R27.1072123-1078198

Location

R27 [1,072,138 / 1,078,143]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 320

>Cisavi.CG.ENS81.R27.1072123-1078198.16488.p
SCKLNVDIDKPRWDQSTFTGRLRHFCSITDPRKALVSESKLENAKNTVLAYRAGNCIGDT
TKDQLWNAKQLYDSAFHPDSGERMTLLGRMSFQVPGGMAITGLMLQFYKCVQLVVALMQW
ANQSFNALVNYTNRNAASQTSSKQMLFAYASATTTALGKLNLNHFSRKARPVVARWVPFA
AVALGNAVNIPLSRQSELKDGVIITDADGNVLGKSKKCAQIGISQVVFSRVLMAAPGMIC
LPLIMERLIKKQWFRSRTWLHLPFQTTAVGVFLLFMVPLGCAVFPQRASMAVQDLEADVR
MSINKEHGGSIQTVYFNKGL

Nucleotide sequence

Length: 1,240

>Cisavi.CG.ENS81.R27.1072123-1078198.16488.t
TCTTGCAAACTCAATGTTGACATTGACAAGCCAAGATGGGACCAGTCAACGTTTACTGGA
AGACTTCGACACTTTTGTTCAATCACTGATCCGAGAAAAGCTTTGGTGTCTGAATCGAAA
CTGGAAAATGCAAAAAATACAGTCCTTGCTTACAGGGCTGGCAACTGTATTGGGGACACC
ACTAAAGATCAATTGTGGAATGCTAAACAACTTTATGATTCAGCCTTCCACCCAGACAGT
GGAGAAAGAATGACTTTATTGGGAAGAATGTCGTTCCAAGTTCCTGGTGGAATGGCCATC
ACTGGATTGATGCTGCAGTTTTATAAGTGTGTGCAATTAGTAGTAGCCCTAATGCAATGG
GCCAATCAATCTTTTAATGCCCTAGTCAACTATACCAATAGAAATGCAGCTTCACAGACT
TCCTCCAAGCAAATGTTGTTTGCGTATGCTTCAGCAACCACCACTGCTTTAGGCAAGTTA
AATTTAAATCATTTCTCTCGTAAAGCAAGACCTGTGGTTGCCCGCTGGGTCCCTTTTGCT
GCAGTTGCATTGGGAAATGCTGTAAATATACCTTTATCAAGACAATCAGAGCTTAAAGAT
GGGGTAATAATAACAGATGCTGATGGAAATGTTTTAGGAAAATCCAAGAAATGTGCTCAG
ATTGGAATCAGCCAAGTTGTATTTTCGCGAGTATTAATGGCTGCTCCTGGAATGATTTGC
CTTCCCTTGATAATGGAGCGCTTGATAAAGAAGCAGTGGTTTAGATCACGTACTTGGTTG
CATTTGCCATTTCAAACTACTGCGGTTGGAGTATTCTTATTATTCATGGTCCCATTGGGT
TGTGCGGTCTTTCCTCAAAGAGCGTCCATGGCAGTTCAGGATTTAGAAGCTGATGTCCGT
ATGTCAATTAACAAGGAGCACGGTGGTTCAATTCAAACTGTCTATTTTAATAAGGGTTTA
TAATAGAAAGGAATTTATGTGCAATTTTAATGTTTTAATTATCAATTTAATCACTAGGGT
AAGTACATTCCAAGGTGCCTTAAAATCTTGTATCAAAATAGGGTATTATTTTATTGCACT
ATGTTACCTAAAATGTGTATACTGATTCATAGGTGAAAGCTATAATCATGTGCTTTTTAT
TTCTCAATATTGGGTTTTTATTGTAAACCTTTTATGATGCTTTAATTAAATCGATTTTAT
TCTTGTAATTCCGTGCAATGCAATGTTTGCTGCTAATAAA

InterProScan

PANTHER	Mtc (IPR004686) - T[4-320] 1.4E-146
TIGRFAM	Mtc (IPR004686) - T[6-320] 2.8E-114
Pfam	Mtc (IPR004686) - T[13-320] 5.1E-122

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value
SFXN1_HUMAN	49.842 %	313	1.85E-106
SFXN3_HUMAN	50.314 %	311	6.55E-106
SFXN2_HUMAN	53.016 %	326	1.21E-111