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  1. Transcript 'Cisavi.CG.ENS81.R90....'

Transcript Model

Transcript Id

Cisavi.CG.ENS81.R90.476132-489578.16656.t

Possible name(s)

ATP6V0A1; ATP6V0A2; ATP6V0A4

Gene model

Cisavi.CG.ENS81.R90.476132-489578

Location

R90 [476,131 / 489,578]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 818

>Cisavi.CG.ENS81.R90.476132-489578.16656.p
LSLQSLFKMGSLFRSEEMCLAQLYLQSEAAFACVSELGELGLAQFRDLNPDVNAFQRKFV
NEVRRCDDMERKLRFLEKEVKKDNLAIDDTGENPPAPLPREMIDMENKFDKLETEMKSVN
SNQEALKKNFLELTELKHILRKTQQFFEQCLQIILTKYKKNNNQVYFPIIYNYNLQWLSN
IVHFFYYRFVAGVLMRDKISAFERVIWRACRGNVFLRYTEIEAELEDPHTGDKVNKYVFI
VFFQGDQLKSRIKKICTGFRATLYPCPETPQERREIALGVMTRIEDLQTVLNQTADHRRM
VLSQVALNIRVWLIKVRKIKAIYHTLNLFNVNIEKCLIAECWCPVVDIDRIQLALRRGTE
LSGSSVPSIMQQMQTKENPPTYNQTDKFTSGFQAIIDAFGVSNYREVNPAPFTIITFPFL
FAVMFGDMGHGLLMFLFALYLVLKENRYMKHKPEDEIFKMMFDGRYLILLMGLFSIYTGF
LYNECFSRSINIFGTSWNFLMEFRCVMTLDPNKPGVFRGYPYFYGIDPIWQSAENKITVQ
NSYKMKNAVLMGFAQMIFGLSLAFCNRRHFKDKLTLYCELLPQLLFLCALIGYLCMCILY
KWSTAPSLLIGLIDMYMLTDPKSNNRVPLYTGQYQVQIFLVIVTVLCVPWMFLSKPYILY
KRSKQKKGHTRFMFFHTKFVKHIKLLIIMLISQFDMSEVIIYQAIHTIEFCLSCISHTAS
YLRLWALSLAHSELSEVLWSMVMHTGLATSGTSGAILSFFVFWFFSSLTVSILLVMEGLS
AFLHAIRLHWVEFQSKFYKGEGYIFSPFSFTLIVEGKV

Nucleotide sequence

Length: 2,722

>Cisavi.CG.ENS81.R90.476132-489578.16656.t
CTGAGCCTACAGTCCCTGTTTAAGATGGGCAGTTTGTTTCGCAGTGAAGAAATGTGCCTG
GCACAGTTGTATCTTCAGAGTGAAGCTGCGTTTGCCTGTGTCAGTGAACTTGGAGAGTTG
GGATTGGCTCAGTTCAGAGACTTAAATCCTGATGTAAATGCTTTCCAACGAAAGTTTGTC
AATGAAGTCCGTAGGTGCGACGACATGGAAAGAAAGTTGCGTTTTCTTGAAAAAGAGGTG
AAGAAGGATAATTTGGCCATTGATGACACTGGTGAGAATCCACCTGCTCCTTTGCCCCGT
GAGATGATTGATATGGAGAATAAATTTGACAAATTGGAGACGGAAATGAAAAGTGTTAAT
TCGAATCAAGAGGCATTGAAAAAGAACTTTCTGGAACTGACTGAGCTAAAACACATTTTA
AGAAAAACTCAACAATTTTTTGAACAGTGTTTACAGATTATATTAACCAAATACAAAAAA
AACAATAATCAAGTTTACTTCCCAATCATCTATAACTATAATTTGCAGTGGCTTTCAAAT
ATAGTTCATTTTTTTTATTATAGATTTGTTGCTGGGGTGTTAATGAGGGATAAGATTTCT
GCATTTGAACGAGTGATTTGGAGAGCTTGTCGTGGCAATGTATTTCTTAGATACACTGAG
ATTGAAGCTGAATTAGAGGATCCCCATACAGGTGACAAAGTGAACAAGTATGTTTTCATT
GTATTCTTTCAAGGAGATCAGTTGAAAAGCAGAATAAAGAAAATATGTACAGGGTTTCGT
GCCACTTTATATCCGTGTCCGGAGACCCCACAGGAACGGAGGGAAATTGCTCTTGGTGTC
ATGACCAGAATCGAAGATCTGCAAACTGTTTTAAATCAAACCGCTGATCATAGAAGAATG
GTTTTGTCCCAAGTTGCGCTTAACATACGAGTGTGGCTCATAAAAGTTCGAAAGATAAAG
GCGATCTACCACACACTGAACCTGTTCAACGTAAACATTGAGAAGTGTTTGATCGCCGAA
TGTTGGTGTCCAGTTGTTGACATCGATCGAATTCAACTCGCTTTGAGAAGAGGAACAGAG
TTGAGTGGATCATCTGTTCCTTCCATAATGCAACAAATGCAGACGAAGGAAAATCCACCA
ACTTACAATCAAACTGACAAATTTACTTCTGGGTTTCAAGCAATAATCGATGCATTTGGC
GTCTCCAACTACAGGGAGGTTAACCCAGCTCCATTCACCATAATAACGTTCCCGTTTCTA
TTTGCGGTTATGTTTGGCGATATGGGTCACGGCCTTCTGATGTTTTTATTTGCTTTATAC
TTGGTGTTAAAGGAAAATCGCTATATGAAACACAAACCTGAAGATGAGATATTTAAAATG
ATGTTTGATGGTCGTTACCTAATATTACTGATGGGTCTATTCTCCATTTACACCGGCTTT
CTTTATAATGAATGCTTTTCTCGATCCATCAATATATTTGGCACTTCCTGGAATTTTTTA
ATGGAATTTCGATGTGTAATGACTCTGGATCCAAACAAACCCGGCGTATTTCGCGGTTAC
CCATATTTCTATGGTATTGACCCGATCTGGCAGTCAGCTGAAAACAAGATTACAGTGCAA
AACAGTTACAAAATGAAGAATGCTGTATTAATGGGTTTTGCTCAGATGATTTTTGGTCTT
TCACTTGCGTTTTGTAATCGCAGGCACTTCAAGGATAAACTTACACTTTACTGTGAATTG
TTACCACAGTTGTTATTTCTGTGTGCTCTCATTGGCTATCTCTGTATGTGTATTCTATAC
AAGTGGTCAACTGCTCCCAGTTTATTAATTGGGTTAATAGACATGTATATGTTAACTGAC
CCGAAATCGAACAACAGAGTGCCATTGTACACCGGTCAATACCAGGTGCAAATATTTCTC
GTCATTGTCACAGTACTATGTGTTCCTTGGATGTTTTTAAGCAAACCTTATATTTTGTAC
AAAAGGTCAAAGCAAAAGAAAGGGCATACTAGGTTCATGTTTTTTCATACTAAGTTCGTC
AAGCATATAAAGTTATTAATTATTATGCTTATTTCCCAGTTTGACATGAGTGAGGTGATT
ATCTACCAAGCCATCCATACAATTGAATTTTGCCTCAGTTGTATTTCTCACACAGCGTCT
TATCTACGACTCTGGGCTCTAAGTCTTGCTCATTCTGAGTTATCGGAGGTGCTTTGGTCC
ATGGTGATGCATACAGGGCTTGCTACAAGTGGAACAAGTGGTGCGATTCTTTCCTTCTTT
GTGTTCTGGTTTTTTTCTTCGTTGACTGTTAGTATTTTGTTGGTGATGGAAGGTTTGTCT
GCTTTTCTGCATGCCATTCGTCTGCACTGGGTTGAGTTTCAGAGCAAATTTTACAAAGGA
GAAGGGTATATTTTCTCTCCGTTCTCTTTTACTCTCATCGTAGAGGGAAAAGTGGAAGAA
TAGTGGTTATTTAAATTACTGTATTGAACTTTAATAGACGGTTATAGATGGGTGAATTGT
ATATCTTAGTTGCCTTGTTTATTTTAATTTATGTTTTGTATTGACCTATAATGTAATTTT
TCTTGTTAAATTTCAGACCAACATATTTTTATTGTAACTTCCACAGTTTTGGATTTTGTT
ATGTGCTGGGTTGAACAATGTGCTTAATTAAGGATTTTAAATTAAATTGCCTGTAAGAGA
ATAAAAACTAACTATTAAACAA

InterProScan

PIRSF
V-type_ATPase_116kDa_su_euka (IPR026028) - T[8-817] 5.4E-289
PANTHER
V-ATPase_116kDa_su (IPR002490) - T[9-817] 0.0
Pfam
V-ATPase_116kDa_su (IPR002490) - T[35-669] 4.0E-239 - T[693-810] 6.9E-62

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
VPP1_HUMAN 57.075 % 962 0
VPP4_HUMAN 50.353 % 864 0
VPP2_HUMAN 45.974 % 757 0