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Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C10.248.v1.A.SL1-1

Possible name(s)

FDPS; GGPS1

Gene model

KH2012:KH.C10.248

Location

KhC10 [1,649,698 / 1,651,911]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 355

>KH.C10.248.v1.A.SL1-1
KSEVFQIMSSKSELWDLFDKHFQEIVRELSISPVNGGNEICWSFERIKDLLEYNAPHGKR
TRGLTVVAAFKTIAGDGISEDEMKLALTMGWAVEILQASFLVADDLMDQSKTRRGQACWY
LNPNVGYQAVNDGMILETCVFTLIRQHCKGKAFYADIFDLFHKVILNTLMGQSLDMEASE
QPTVDFTLFTETKHAAIIKYKTAFYSFYLPVAIAFYMAGINDEQCHTAACDILTKIGCLF
QIQDDYLDCYGDPEVTGKIGTDIEDNKCSWLIIKAIQLATPEQIRILQENYAKKDPEKVA
IVKRVFDDINIKPIFLKHEEETYASICDEINKFSDPRVPHSIFLDLLNKIYRRKK

Nucleotide sequence

Length: 2,213

>KH2012:KH.C10.248.v1.A.SL1-1
TAAAAAGTGAAGTTTTCCAAATCATGAGTTCAAAATCAGAGCTGTGGGATTTATTTGATA
AACATTTTCAAGAAATTGTTCGAGAGTTGTCCATCTCACCAGTTAATGGAGGAAATGAAA
TATGCTGGAGTTTTGAAAGGATAAAAGACTTACTTGAGTATAATGCACCTCATGGTAAAA
GAACTCGTGGCTTAACAGTGGTGGCTGCATTTAAAACAATAGCAGGAGATGGAATATCTG
AAGATGAAATGAAACTTGCTTTAACTATGGGTTGGGCTGTTGAAATATTACAAGCTTCTT
TCTTAGTTGCAGATGATTTAATGGATCAGTCAAAAACACGGAGGGGTCAAGCGTGTTGGT
ACCTTAATCCAAATGTTGGATATCAAGCAGTTAATGATGGTATGATTTTGGAGACTTGTG
TCTTTACACTGATAAGACAGCATTGTAAAGGAAAGGCATTTTATGCTGATATATTTGACC
TTTTTCATAAAGTTATTTTAAACACATTGATGGGGCAAAGTTTGGATATGGAAGCATCAG
AACAGCCTACGGTTGATTTCACTTTATTCACTGAGACAAAACATGCGGCAATAATTAAGT
ATAAAACCGCATTCTACTCATTCTATTTACCAGTAGCTATTGCCTTTTACATGGCAGGAA
TTAATGATGAACAATGCCACACTGCCGCATGTGATATTTTAACAAAAATAGGGTGTTTAT
TTCAAATTCAGGATGATTATTTGGATTGCTACGGAGATCCAGAAGTTACTGGCAAAATTG
GGACTGACATAGAAGATAATAAGTGTTCGTGGCTTATAATAAAAGCCATCCAGCTTGCAA
CACCTGAACAGATCCGAATTCTTCAAGAAAATTATGCGAAAAAAGATCCAGAAAAAGTCG
CCATTGTGAAACGAGTTTTTGACGACATCAACATAAAACCTATCTTTCTAAAACATGAAG
AAGAAACATATGCCAGCATTTGTGATGAAATAAACAAGTTTTCTGATCCTAGGGTTCCAC
ATTCTATCTTTCTTGATTTACTAAACAAAATTTACAGACGTAAAAAGTAAAAACTGATTT
AATTTATTGCAACAGAACTACTGAGCTAATCGTAATACCAAGTTCTGACACGTAATCTTA
TGATAAATATGCAATACCTACCTAAATCAGTAATTTATTTTACGCAGTTCTTTTTATAAT
CTAACTAAAGTAATGAATTAAAGTCATTGTGTATCCATAAAAATAACTGTGCAATATCTT
ACTGATTCTCAAAATAGATTGATTGCAGCTGTAATTTTGTAACAATTTATTCTTATACAA
TATAAGAGCCAATGCTCACGGTTTGAACTTATTATTATATAAGTAATACTTAACACATAA
AGCATTTCTTAAATTCGCACAAAAAAATGGCAAGATCAAAATTCAGTTTCATCCTCATGG
GATTTATGATGCATGGTATGAATATCTGCTGTTGTTTTCCTTATACCTCTTGCTTCAGTA
TATGGTGGTGGGGCAGAGTCGGATGACATACATTCAACATGGTGGTTCACTATCTCACAT
TCTGCAACACTTTGAATTCTCTTTCTTTGTTGCCAGTTTTCTCTAAAATCCATAAATGTA
GTTTGCACCGGAAAATATCCGTTGGCAGTTTCATATTTGGTATGATACGCTGGTAACTTC
ACATATAAATCCTTTTCAGTTTTGCCAGAGAAAGTATCAAAAGTATGGCACCGAACAGGT
CTATTGCATCCCACATTGAAAACTTGCTGTAACCCACTGGAGTGCCTTGTGTCTGCCACC
CTGGCTGCTTCACATGCAATTGGTCTTTGTTCGGGTAAATACGACCATGTCACTACAGAT
GAGCTTGTACTGCCATGTACAGAGCATGTGCATGACCCTAAAATTCTGTGGTTTTCATGT
GATTGATTTTCATATCTGTATTAAGTTTGAGACTTATGGTAATGATGATACCATATACAC
TATAAGCATAAAGTAAAACACAAATACCACAACCAAATTACACAAATAATGTTTTTATAT
ACCAATATGTTATTTATTTAAAATAAATGTATAACCTTGGTTCAACTACAATTTCACTGT
CGCTTTGACGTCTTGTAATTGGAATGTTGACTTCATTTGTCACGTGCTCCACCCGAGGCA
ATGAAGACATCTCGTAATCCTGATAATTATGTAATAATAATAAATTATGACAT

InterProScan

Gene3D
Isoprenoid_synthase_dom_sf (IPR008949) - T[11-355] 9.2E-100
SUPERFAMILY
Isoprenoid_synthase_dom_sf (IPR008949) - T[26-354] 1.83E-83
Pfam
Polyprenyl_synt (IPR000092) - T[46-308] 3.2E-85
ProSitePatterns
Polyprenyl_synt_CS (IPR033749) - T[101-115] . - T[236-248] .

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
FPPS_HUMAN 49.558 % 348 2.64E-118