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  1. Transcript 'Boschl.CG.Botznik201...'
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Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C10.480.v1.A.SL1-1

Possible name(s)

CACNA1H; TPCN1; TPCN2

Location

KhC10 [1,608,476 / 1,611,711]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 800

>KH.C10.480.v1.A.SL1-1
KTMVEMLECNHVPSAHEDQLDKKQSVCLLSSDVLDQNHTQESEETTPPQAVSNNHLDVPH
STSYSYNKFGQVKLQASVFLEDALEYRSVHHKTNDFALKLYQWSHSAPAVYLVNVTTFLL
LMLAFVEEPSSLIWSSDPRRGYTRVVLPPGYTEGVELVCLVILCIDTIVQSYLVTKQYER
SFIRQYPWIAGGYVVLMISFIDVVISLALGNTVYRIRVRRLFRPYFFVQNTTLLKKTLKA
IRNTLPEIASVLTLLSLHLYFFTMLGMLVFPHTHVHINGTHHHGEEFNNTEWQEYFKTID
NALMSLVVLLTTANNPDVMMPSYSENRLYALYFIMFSLIGTFLIFNLLTAIIYNQFRGYF
KSSMQTSYFRRCVALSAAYNVIRSGSCHNVELHDGCTTDSKISLTVTIEVLANTCMQPEK
RNLLKQRTKPFLQNNVSEISYGEFCCLFEGIDSVVNATIQSQATVPMWRSRQMRLIQRMV
MSRYFNLIGNLMVLLNAILMTVEIAIHYEESFQTVFSRLNIMNYIFVVYYCIEQVLKIIS
LGKRYFCTLSCLYDGLLSIALITVELVQLSEFGNQAADISTGLTLWDCARIVNILILLRL
LRIIPNFKPMALVTNVMVQIIRSLRSFMGIIILIYYVFAIIGMMAFEKAIDPPPGLKPNT
DYDVITSVPDTTLTPPNAYKCGTYQQLEYWANNFDDFAASLVVLWDVMVVNNWGVFLTAF
KDMVSPWSQIYFVAWWLVSAVVCVNLFVALILDHFIDKWEGSMQAGNVRRGTIQSLFQRH
LQRPSDECIQDELRKHPNFV

Nucleotide sequence

Length: 3,235

>KH2012:KH.C10.480.v1.A.SL1-1
ATTTCCAGCAAATTACGAAATGTAGATTTGGTAGATATTTTAGCTTGTCCTGCTAAAAAA
CTATGGTAGAAATGTTGGAGTGCAATCACGTTCCCTCTGCCCACGAAGATCAATTGGATA
AAAAGCAAAGTGTATGTCTACTGAGTTCAGACGTATTGGACCAAAACCACACACAAGAAA
GTGAAGAAACTACACCCCCTCAAGCTGTCTCCAATAATCACTTAGATGTGCCACATTCTA
CTTCATATAGCTACAATAAATTTGGTCAAGTAAAGTTACAGGCATCAGTTTTTCTTGAAG
ATGCTTTAGAATACCGCAGTGTTCACCATAAGACAAACGATTTTGCTTTAAAACTTTACC
AGTGGTCTCATTCAGCACCTGCTGTTTATTTGGTAAATGTAACAACATTTCTACTTCTTA
TGCTTGCCTTTGTAGAAGAACCATCATCTCTTATTTGGTCCTCCGATCCTAGAAGAGGCT
ACACAAGAGTTGTCTTGCCGCCTGGATACACTGAAGGTGTAGAGCTTGTATGTTTGGTAA
TACTGTGTATTGATACTATTGTTCAGAGCTATTTGGTAACAAAACAGTATGAAAGGTCAT
TTATTCGACAATACCCATGGATTGCTGGTGGGTATGTCGTTTTAATGATCTCATTTATTG
ATGTTGTGATTTCTTTAGCACTTGGGAATACAGTATATAGAATAAGAGTACGGCGGCTTT
TTCGCCCGTATTTTTTTGTTCAGAACACCACACTGCTTAAAAAGACACTGAAAGCTATAC
GGAATACTTTGCCAGAGATTGCCTCCGTTTTAACCTTGCTTTCACTGCACTTATACTTTT
TCACAATGTTGGGAATGCTGGTCTTTCCGCATACACATGTTCATATAAATGGCACCCATC
ATCATGGAGAAGAATTTAACAACACAGAGTGGCAGGAGTACTTCAAAACGATAGATAATG
CCCTCATGTCTCTTGTGGTTCTTCTTACAACTGCCAACAATCCAGATGTCATGATGCCAT
CTTACTCAGAAAATCGTCTGTACGCTCTTTATTTTATTATGTTCTCGCTTATAGGAACAT
TTCTTATATTTAACCTGTTAACAGCCATTATTTACAACCAATTTCGTGGCTATTTCAAAA
GCTCAATGCAGACAAGTTATTTTCGTCGATGTGTTGCATTAAGTGCAGCTTATAACGTCA
TACGTTCAGGTTCTTGTCATAATGTAGAACTGCATGATGGCTGTACAACAGACTCCAAAA
TATCTCTAACAGTAACAATTGAAGTACTGGCCAATACTTGCATGCAACCAGAGAAACGTA
ACTTGTTAAAACAACGCACTAAGCCTTTTTTACAGAACAATGTATCTGAGATTAGTTATG
GGGAATTTTGTTGTTTGTTTGAAGGCATTGACTCAGTTGTAAATGCTACAATACAATCTC
AGGCAACTGTACCAATGTGGCGTTCAAGACAGATGAGGTTAATACAGAGAATGGTGATGT
CTCGCTACTTTAACTTAATTGGAAACCTTATGGTTCTTTTAAATGCAATTTTAATGACAG
TAGAAATTGCCATTCACTATGAAGAATCATTCCAAACTGTGTTCAGCCGTCTTAACATTA
TGAATTACATATTTGTTGTTTATTATTGCATTGAGCAGGTCTTGAAGATTATCTCACTTG
GAAAAAGGTATTTCTGCACTCTAAGCTGTCTTTATGATGGCCTTCTATCCATAGCTTTGA
TTACAGTGGAATTAGTTCAACTTTCAGAGTTTGGAAATCAAGCAGCTGATATAAGCACTG
GCTTGACATTATGGGATTGCGCAAGAATTGTCAACATTTTAATACTGCTGCGCTTGTTGA
GGATTATTCCCAACTTCAAACCCATGGCTTTGGTCACCAATGTAATGGTTCAAATAATAA
GAAGTCTGAGGTCTTTCATGGGCATCATAATTCTCATATATTATGTATTTGCTATTATAG
GAATGATGGCGTTTGAAAAAGCAATTGACCCACCACCTGGCTTGAAGCCTAATACAGATT
ATGATGTTATAACCAGTGTCCCTGATACTACGTTGACGCCTCCAAATGCATACAAATGTG
GCACATACCAACAGTTGGAATACTGGGCAAATAACTTTGATGATTTCGCTGCTTCTCTTG
TTGTACTGTGGGACGTGATGGTAGTTAATAACTGGGGTGTCTTTCTTACGGCCTTTAAAG
ATATGGTGAGCCCATGGTCACAGATATACTTTGTTGCTTGGTGGCTTGTGTCGGCAGTGG
TTTGTGTAAACCTCTTTGTGGCTTTAATTCTGGATCATTTTATCGACAAATGGGAAGGCA
GTATGCAGGCTGGGAATGTTAGGAGAGGAACAATTCAGTCTCTGTTTCAAAGACATTTGC
AACGCCCTTCTGATGAGTGCATTCAAGATGAACTAAGAAAACATCCGAATTTTGTTTAAG
GTTTTATTATTTAAAAGTTTTACTACAATTTTAATTGCAGCATGATTACATTTTAGCCTA
GTAAGAAGCATATATATTTTAATGATTATTTTATAGAAACATTAAATAATCTCAATATAT
TTTTATCGTTAAACACTTGATAGTCTAAAGCTTTTCAAATTGATTTTATATTTAAGTAGG
TTTTATAATGCAGCGTTTTATTCTAATGGTATAAATTGTGAAAAGTGTGTTGGTTTAACA
CTGCCAATGTGCAATATGTGGTGTATTTAACTGTGTCCATATATTGTTGAAAGTTACTTG
GTATGTAGTGTAATGGCTTCAGTTGTATAGTACGTAATATATTATTGTACTTTGTCTAAC
TGTGGCTAATGTGTAATTCATAATCAAGTTCCTTGGTTATAGAGACACTCCAGTATTATC
CATTACAATCAGGTCATTTGTCAGAACTTATCTAAAAATCCATGTATAAACTAACCTCCG
TGTTAATTATATTTAAATGTGCCATATTATAAATTGTTGCAGCTTACTAGAACTAAAAGT
GAAGAAAAGTTAAAATGACTGTAATCTTAATTATTTTTACCTAATGTTTACTTCAGATTC
CTAAATTTTGTATCCAAATATTAAAAAAAAATATTGTAAACCAAACTTGATTCATTCTTA
TTTGATTTTACTGCTTTTATTAACTTTGAAACATTACATGTTCATTTATTTATTACCATG
CTTTGAGATATTGGCAGCAGTTTTCAAATACATATGCAGTCAGGTTTAACAACAA

InterProScan

PANTHER
TPC2 (IPR028798) - T[69-799] 6.9E-269
Pfam
Ion_trans_dom (IPR005821) - T[151-356] 3.3E-19 - T[483-755] 4.1E-27
Gene3D
Volt_channel_dom_sf (IPR027359) - T[474-608] 5.8E-14

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
TPC1_HUMAN 23.973 % 122 2.09E-28
TPC2_HUMAN 38.223 % 442 3.83E-144