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  1. Transcript 'KH2012:KH.C10.571.v1...'

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C10.571.v1.A.SL2-1

Possible name(s)

KH.C10.571

Location

KhC10 [3,609,443 / 3,611,747]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 594

>KH.C10.571.v1.A.SL2-1
NVKGEALVALEQDKINRVRKMQDDVTADYTELMKYVSDKCEKIMGKPPCKYTVVGMGSLA
RAQITLYSDFEHVIVLDDKVENMNKREGKKVMRYFRWFTTIFHIIVINLQETIIPAVAIP
TLNGEEGDWFFDRITPKGISFDGMMPHASKIPLGRQQSTKGKPWKTELIKPVMEMLKYLE
SEVDMKEGYHLADILSKTCFVAGDQSLYKDFEQRANLIVIANDISSKFKQVKEQINEDLN
TFMMRHQIEFLRLVASENNIKRLIYRNATLFIAALGRIHHIPEASCFDILDKLKDIGFFD
EETTHKLKFMVAVALEIRFKMYMKSKKQEDAICVLDNDDIEPLVTNLVALVGKESLIQFV
TTTTQLTEDFWSTDFGSFNNRMITLTTRILTLGMLNMEEDFKKECQKFVEDETNITEETF
DIVLKFICDVIRYTAMFENNLAVGLIIVKNTLEYCKREEEEFVAKAFMIRFLVLIGGITD
EVGMLNNQLQVILKGSGLICRKKHKNKFHDCWWAMFSYAWALERMKQHELAIDVFRSLSQ
LNQLNSEYTNNWGCFYMFFIQVFVLIQFKEFSKAQSVLIQLLPIQGIMAKRVKH

Nucleotide sequence

Length: 2,304

>KH2012:KH.C10.571.v1.A.SL2-1
ATAATGTAAAGGGAGAAGCACTTGTTGCCTTGGAACAAGATAAAATAAACAGAGTGAGGA
AAATGCAAGATGATGTTACTGCAGATTACACTGAGTTAATGAAGTATGTCTCTGATAAAT
GTGAAAAGATCATGGGGAAGCCACCGTGTAAATACACAGTTGTAGGAATGGGGTCATTAG
CTCGTGCCCAGATTACTCTCTATTCTGATTTTGAGCATGTTATTGTTCTAGATGATAAAG
TTGAAAACATGAATAAACGGGAAGGAAAGAAGGTTATGCGATACTTCAGGTGGTTTACCA
CTATCTTTCACATTATTGTGATCAACCTCCAAGAAACCATAATTCCTGCAGTTGCAATTC
CAACACTAAACGGTGAAGAGGGAGACTGGTTTTTTGATAGAATTACACCAAAGGGCATCT
CCTTTGACGGAATGATGCCTCATGCAAGCAAAATCCCGCTTGGCAGGCAACAGTCAACTA
AAGGTAAGCCTTGGAAAACAGAACTAATTAAACCAGTAATGGAAATGCTGAAATACTTAG
AGAGTGAAGTAGATATGAAAGAAGGATATCATCTTGCTGATATTTTGTCCAAGACTTGCT
TCGTAGCTGGTGATCAATCTTTGTACAAAGATTTCGAACAAAGAGCAAACTTAATTGTGA
TTGCGAACGATATATCCAGTAAATTTAAACAAGTAAAAGAACAGATAAATGAGGATCTGA
ATACTTTCATGATGCGGCATCAAATCGAGTTTCTAAGATTAGTAGCATCAGAAAACAACA
TTAAACGTCTGATCTACAGAAACGCAACCTTATTTATTGCTGCTCTTGGTAGAATTCATC
ACATACCAGAAGCCTCTTGTTTCGATATATTGGATAAATTAAAAGACATTGGGTTTTTCG
ATGAAGAAACCACACACAAATTGAAGTTCATGGTGGCTGTGGCATTGGAGATAAGATTTA
AAATGTATATGAAGAGTAAAAAGCAAGAAGATGCTATTTGTGTTCTTGATAATGATGATA
TAGAGCCTCTGGTTACAAATTTAGTAGCATTAGTGGGAAAGGAAAGCTTGATTCAGTTTG
TTACAACAACAACACAGCTAACTGAAGATTTTTGGAGTACAGACTTTGGTTCATTTAACA
ACAGAATGATAACCCTAACTACCAGGATTCTTACACTGGGTATGTTAAATATGGAGGAAG
ATTTTAAAAAGGAATGTCAAAAATTTGTCGAAGATGAAACAAATATCACTGAGGAAACCT
TTGATATTGTATTAAAGTTTATTTGCGATGTAATACGTTATACAGCCATGTTTGAAAATA
ATCTTGCTGTTGGTTTGATTATTGTCAAAAACACACTAGAATATTGTAAAAGGGAAGAAG
AAGAATTTGTTGCTAAGGCATTCATGATTCGCTTTCTTGTATTGATAGGTGGTATAACCG
ATGAAGTGGGAATGTTAAATAATCAATTACAAGTTATTTTAAAAGGAAGCGGATTAATTT
GTAGAAAAAAACACAAAAACAAATTCCATGATTGCTGGTGGGCTATGTTTAGTTATGCCT
GGGCTTTGGAACGTATGAAGCAACATGAGTTAGCTATTGATGTGTTCAGGAGTTTATCAC
AGCTGAATCAGTTAAACTCAGAGTATACAAACAATTGGGGTTGTTTTTATATGTTTTTTA
TTCAAGTTTTTGTTTTGATTCAATTTAAAGAATTCAGTAAAGCTCAATCAGTACTAATTC
AATTATTACCAATTCAAGGAATAATGGCTAAACGTGTTAAGCATTAGTGTTACTTTTTAC
TTGCAAAATGGCACTTTGGTTTAAAAAACTACCTTGAATCATTTATCTGCAACGTTCATG
GTATTCGTGTATGTATTGCAAATGGTGCGGAAATAGGAACGGGCATGCGAGAAAACACTT
TTGTTACTTTTCATTTTCTGAAGCGATTTTTGTCGGGAGAAGAAAGTAATGAGGAGCTTG
AAGCACAGTGGCGTATACTGCTTAATGATATGTGTGGTGATACTGCTTGATGATAAGTGT
GGTGATACAAGTGATGATGACTAAAATAGATTCACAATTATGAAAATCATGTTTTTATAT
GTTTTGTCCTCGCATGCGCCTCATTCCAACTTTAAACTGTTCGTGTGTAAATGACATTTA
AATATCTTAACCAAAGTTAAGTGTTAGTATCATATTTTTCAATTTTGTTGCTACTTTTTT
TTAATGTGTGTTATGATTCTCTTGACTGACTTACATTATCATGAATACAATTATAATGTA
AAATAGTACTTTGGTGTGTTGGTA

InterProScan

Pfam
GlnD_Uridyltrans_N (IPR005105) - T[17-99] 4.6E-7
SUPERFAMILY
TPR-like_helical_dom_sf (IPR011990) - T[502-581] 4.93E-5

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value