- Transcript 'KH2012:KH.C1.1026.v1...'
Transcript Model
Transcript Id
KH2012:KH.C1.1026.v1.A.SL2-1
Possible name(s)
ASB3; CTTNBP2; GPR75-ASB3
Gene model
Location
KhC1 [6,676,117 / 6,678,303]
Amino acid sequence
Length: 401
>KH.C1.1026.v1.A.SL2-1
NRNMKRKLKAKESFIPYSRIYKAVENGNAWLLRTLVERYEVKSLPDNYLCAAIKATNVDC
VKTLINLGANPNAKDETGRPVLLKTVQMRRGKEPEIYEISKCLVEAKANVNAVFNGETAL
AYSACFYGEKVIDLFLEYNADPHLGVTPATTRAVQFGNLDAINSFTPFTKTTIELQVKKK
RHSPIYCLLDSTRIECLVALLNAGYPVDGSLPGSGCPPPHNIWNVINYPSDDFHCYYSAN
FVELVTTLLENKLSVATFTKPALRKLLRGTETGSITLLLQEGITEALFEKLPTEREVYKT
IGFDVENPRLPTPRTLTIFNQHKTMLYYFIKSIPNMGVTFDVEYDILIKNYPRPTLQCVV
PTLKALSRWAIRKSFHKVKAPFNKIVSLPLPQPLVEYLYKK
Nucleotide sequence
Length: 2,186
>KH2012:KH.C1.1026.v1.A.SL2-1
GAATAGGAATATGAAAAGAAAACTAAAAGCAAAGGAATCTTTTATTCCCTATTCAAGAAT
ATACAAAGCAGTTGAAAATGGTAATGCGTGGCTGCTACGTACATTGGTGGAAAGGTATGA
AGTAAAGTCTTTGCCAGACAACTATTTGTGTGCTGCTATCAAAGCAACAAACGTTGATTG
TGTCAAAACTTTGATAAACTTGGGAGCGAATCCTAATGCTAAAGATGAGACCGGGCGTCC
CGTGTTACTAAAAACTGTACAGATGCGCCGAGGAAAAGAACCTGAGATTTATGAAATTTC
AAAATGCTTAGTGGAGGCCAAAGCTAATGTGAATGCTGTATTTAATGGAGAGACAGCACT
CGCATATAGTGCATGTTTTTATGGTGAGAAAGTTATTGACCTGTTTCTTGAATATAATGC
AGACCCTCATCTAGGTGTTACTCCAGCAACTACACGAGCTGTTCAGTTCGGAAATTTAGA
TGCAATTAATAGTTTTACTCCTTTTACCAAAACTACTATTGAGCTTCAAGTAAAGAAGAA
ACGTCATTCTCCCATCTACTGTTTATTAGATTCCACCCGCATTGAATGTTTGGTTGCTTT
GTTGAATGCAGGGTATCCCGTTGATGGTTCTTTGCCGGGAAGTGGCTGTCCACCCCCCCA
TAATATATGGAATGTGATTAATTATCCTTCTGATGATTTCCATTGTTATTATAGTGCTAA
CTTTGTTGAATTAGTTACAACTCTTCTTGAAAATAAGCTCAGTGTAGCTACCTTTACAAA
ACCAGCTCTCCGCAAATTGTTGAGGGGAACAGAAACTGGTTCAATTACTCTTCTGTTGCA
GGAAGGTATTACAGAAGCTCTGTTTGAAAAATTACCCACAGAACGTGAGGTGTATAAAAC
AATTGGGTTTGACGTTGAAAACCCCAGACTGCCAACGCCGCGAACATTAACCATTTTTAA
TCAACACAAAACCATGCTTTATTATTTTATAAAATCAATTCCAAATATGGGTGTTACATT
TGATGTAGAATATGACATTTTAATCAAAAACTATCCACGTCCAACACTACAGTGTGTGGT
ACCTACATTGAAAGCTTTATCAAGGTGGGCAATACGTAAATCGTTCCATAAAGTTAAAGC
CCCTTTTAATAAAATTGTTTCTCTGCCACTTCCCCAACCTCTTGTCGAATATCTTTATAA
AAAGTGATTTTTTTTGTAATATTCCTCGTTCTCACAAGTTTTAATTTAACAATCATAGCA
TTACTTGCAATAGTTGCAATTACAATGTATCTTATATTTCTTTTAACCAGTGGCGCAGAC
AAAAAATATCCAAGTTGTTTTCTGTTGGGTGTAGAAGCCACACTTAAACTATAGTTAAGA
AATGTATTTAACATTGATTGTTTTTTTTACTTTTTTCTTAATGTTAAGAATATATGTTTC
TTCCAGAATTGTTCTATGTCTGTTTTACTGTGTTAGAGGTATTCTAATTAAATAATAATG
AAAAGAAGTTACAACAACAACAACAAACTTTTGATACCATACTCAAGGATTTCTAAAGCA
GCAGAATGTACACAACAATTGCCGACTTTATTGCAACGATATGAAGTTAAATCTGTGCTG
ACAAGTGTTTATCAATTAGACAAGTACAATTTTAAAAAGGTCAGGCGGATTTTGTTGAAC
TGTTAATTAAACATGCGGCAAATGCCAAAACCAAAAGCGATTACCCAGCTTTGCAATGCA
AATGGGAAGTATTAATAAAACACCGGAGGATATTAAATCAAGTATTGCAAAAACTTTACT
AGATGCTAAAGCTTTAGTGAATGAAGTGCATAATGGTGAAACTGCCCTTTCATACGCAGC
ATCCTATGATGAAGGGAAAGTGATAAAACTTCAAAGTGGACAATACGTAAAGCATTTCAT
AAAGTTAAACAACTTATTTACTTACTGCTTCCTTCTTCACTGTTAGAATACCTACAGTGA
TTTTAATGAATTCTTTTCCCCCACTGTACTAAAATATTTTTACTTACAAATGATGAGATA
AAGTATAATATTAGCAATGCGTTTTTCTTTTAATAAATCAATTCTTATTTTGGCTTTAAA
ATCCTATTATGCTTTAATCAGACTTTTATATATATATATATATACATTTTAGTTATGTAT
GAAAGTTATACCAAGTAAAATAAAGC
| Gene3D |
Ankyrin_rpt-contain_sf (IPR036770) - T[2-283] 1.3E-19 |
| SUPERFAMILY |
Ankyrin_rpt-contain_sf (IPR036770) - T[20-207] 2.19E-17 |
| SMART |
Ankyrin_rpt (IPR002110) - T[44-73] 85.0 - T[115-144] 3.6 - T[180-209] 800.0 - T[309-338] 2800.0 |
| ProSiteProfiles |
Ankyrin_rpt-contain_dom (IPR020683) - T[49-115] 9.224 |
| CDD |
Ankyrin_rpt-contain_dom (IPR020683) - T[49-162] 4.90738E-14 |
| Pfam |
SOCS_box (IPR001496) - T[360-398] 6.2E-7 |
| ProSiteProfiles |
SOCS_box (IPR001496) - T[360-401] 9.123 |
| Protein Name | Identity | Bit Score | e-value |
|---|