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  5. Transcript 'KH2012:KH.C1.1147.v1...'

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C1.1147.v1.A.SL1-1

Possible name(s)

NCSTN

Location

KhC1 [8,995,363 / 9,005,050]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 713

>KH.C1.1147.v1.A.SL1-1
RIHILEMKFLFPVWTIFIFCLSCDFVFSQTSKVYKLIYKDFDVNSYDKCIRLLNGTSEIG
CQSKNGGNTGAIYHVNSTVRITDFLQNSHLKNYIPLVDVNYFNNKLIQQFINSGKVQGVL
VYEPEGFVKPSNSWSPELKCPKERFGLYNASYGPQYECKPDNNPWNPPGDGLTQQNIPFP
IFHILQTEAVQEIVQCYNKYNSKEVYPLCSMQMKSHMFGAVDAPTCIRRTTYQTTLTPQM
YCDAMGGWNMVASLKPLISRKNKTKSDSTILVTAALDSRAFMMLNTAPGNSLATGFITLL
AVAKAIGGISEKQKNELNKNIMFVLFDGEAFDNIGSTRTVFDMQHMNFPVVENKAMIQPA
AVKLEDIDSIVEIGELGHVDSQLYVHTDPMSAALHKSRIDQIIAEINNNAQGINATKASS
SVGLVPSSLQTFLKSRNLPGVVVTDYDKQTKNKYFFSRYDELKNLNINYNGNTTDEEMLQ
LLQPLAQKLSNVALATAKMLYLEAATTSILPPEISLNTSLVTEMLFCYLYKANCSLFTEA
TSTNSVTKLPNFPYNRYVTVFQTSTTGLPIINNWGVLSRNLLAIFTGEHLPDNSTTCQRS
LSTDETTTYFYFNGKLNNGTRENFCVKSSSFVTKALAPAIEDNELTSNVENYGLWAESRW
TTTTFNLRMFLQHDEVNQGMTLLAGLLVLLVSFTVVYIVDTKAETLFQPAGVI

Nucleotide sequence

Length: 2,721

>KH2012:KH.C1.1147.v1.A.SL1-1
ATTTGAATAACTTTTATAAAGGATACATATATTAGAAATGAAATTCCTTTTTCCTGTGTG
GACCATCTTTATCTTTTGTTTGAGTTGTGATTTTGTCTTCTCTCAAACATCCAAAGTTTA
CAAACTCATCTACAAGGACTTCGATGTGAATTCTTATGATAAATGTATTCGACTACTGAA
TGGAACTTCAGAGATTGGATGCCAATCAAAGAATGGAGGGAACACGGGAGCAATTTATCA
TGTCAACTCAACTGTCAGAATCACTGACTTTTTACAGAATAGTCATCTGAAAAACTACAT
TCCGTTGGTTGATGTTAATTACTTTAACAACAAATTGATCCAACAGTTTATAAATAGTGG
GAAAGTACAAGGAGTTCTTGTTTACGAACCAGAAGGTTTTGTTAAACCATCCAATAGTTG
GTCTCCTGAACTAAAATGTCCAAAGGAAAGATTTGGTTTATACAATGCAAGTTATGGGCC
TCAATATGAATGCAAGCCCGACAATAACCCATGGAACCCACCTGGTGATGGATTAACTCA
ACAAAATATTCCATTTCCGATTTTCCACATCCTTCAAACTGAAGCAGTGCAAGAGATTGT
TCAGTGTTACAACAAGTACAACTCCAAGGAAGTCTACCCTTTATGTTCGATGCAAATGAA
GTCTCATATGTTTGGAGCTGTTGACGCACCAACTTGTATAAGGAGAACAACTTACCAAAC
TACATTAACACCACAGATGTATTGCGATGCTATGGGAGGCTGGAACATGGTTGCGTCATT
AAAACCTCTTATAAGTCGAAAGAACAAAACTAAATCAGATTCAACAATATTGGTTACGGC
AGCTTTGGATAGTCGTGCTTTTATGATGTTAAATACTGCACCTGGGAATTCTCTTGCTAC
TGGTTTTATAACTCTGCTTGCTGTTGCTAAAGCTATTGGTGGAATAAGTGAAAAACAGAA
AAATGAATTGAACAAGAATATTATGTTTGTACTTTTTGATGGGGAAGCATTTGATAACAT
TGGTAGCACAAGAACTGTGTTTGATATGCAGCACATGAATTTTCCAGTGGTTGAAAACAA
GGCAATGATCCAACCAGCTGCAGTAAAACTTGAAGACATCGACAGTATTGTTGAGATTGG
TGAACTTGGTCACGTGGATAGCCAACTATATGTACATACTGATCCAATGTCTGCAGCTTT
GCACAAGAGCAGGATTGACCAAATAATTGCGGAAATCAACAACAACGCACAAGGTATAAA
CGCAACAAAAGCCTCGTCTTCTGTTGGTTTGGTTCCTTCTTCTTTACAAACCTTTTTAAA
ATCACGAAATCTTCCCGGGGTCGTTGTCACTGATTATGACAAACAAACCAAAAACAAGTA
TTTCTTCAGTCGTTATGATGAATTAAAAAACCTGAATATAAACTATAATGGAAACACAAC
AGATGAAGAAATGCTTCAACTATTGCAACCCCTTGCCCAGAAACTATCAAATGTTGCTCT
TGCCACTGCAAAGATGCTTTACCTTGAAGCTGCAACTACTTCAATTTTACCTCCTGAAAT
TTCATTAAATACAAGTTTGGTAACCGAGATGTTGTTTTGTTATCTTTACAAAGCAAACTG
CAGTTTATTTACTGAAGCCACTTCAACTAATAGTGTGACCAAGCTACCCAATTTTCCGTA
CAACAGATATGTCACTGTGTTTCAAACGTCAACTACCGGGTTGCCCATCATTAACAACTG
GGGTGTTTTATCTCGTAACCTGCTGGCTATCTTCACCGGCGAACATCTACCCGACAATTC
TACAACATGCCAACGATCACTTTCAACTGATGAAACCACCACCTATTTCTATTTCAACGG
CAAATTAAACAATGGGACTCGTGAGAACTTTTGTGTGAAGTCCTCCAGCTTTGTAACAAA
AGCTCTTGCCCCTGCAATTGAAGATAATGAACTTACAAGCAATGTTGAGAACTATGGTTT
ATGGGCAGAAAGTAGATGGACAACGACAACTTTTAATTTAAGAATGTTTCTTCAACATGA
TGAAGTTAATCAGGGTATGACTCTTTTGGCAGGCTTGTTAGTTCTCCTTGTGAGTTTTAC
AGTTGTTTACATCGTTGATACCAAAGCTGAGACGTTGTTCCAACCAGCAGGTGTTATATG
AAGAACCGGTTTCAACCAGTTACAACCAGATCTTGCATTAACATCAATTGATGTTTGATG
CTTATATCTCCACACATGAGATTACTGTGAAAGTGTTAATCATTTTTTTAATGAATTTGT
GCATTATGAGTTGCTGGGGTTATTCAGTATTTCTAAATTCTTAAGATTTTCAAACTAAAA
TACATCACTGCAAATTATATTCAGTTCAGATTTTTTATTTCCCAAAGGATATTTGTTAAA
CTTTTATTGCTCAGAATGTTAAATATCATACTCTAAAAGATTTGGTGCATAATAATCATG
CCAACTTGGAAGAATATTGTAACTTACATCACACATATAGAAAATTTGTGAATGTAAGAA
GAGAACAATTTTCATTTATTTTTGACCAAAAGCTGTAGCACTGTAAAATTTGATTTGATT
TCTGTTTCTAGATTAATTCATACACAAGTTCATAAAATTGTGTTTACTTTTGATTTTCTC
GTTTTAAGTGAATCTTTTTTAAGCTTTATTTAAAGGCATGAGTACCAGTGCTTTATCTGT
ATAAAAAGTGTTGAAAAACTA

InterProScan

PANTHER
Nicastrin (IPR008710) - T[8-706] 4.7E-179
Pfam
Nicastrin (IPR008710) - T[269-501] 1.2E-45

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
NICA_HUMAN 31.971 % 329 1.16E-102