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  1. Transcript 'KH2012:KH.C1.1207.v1...'

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C1.1207.v1.A.SL1-1

Possible name(s)

SFXN1; SFXN2; SFXN3

Location

KhC1 [7,588,201 / 7,593,888]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 337

>KH.C1.1207.v1.A.SL1-1
FLTVQMADNIEETPPCKSCKLSVDLEKPRWDQSTFGGRLKHFYAITDMRKLFVPDSQLDH
AKNLVLAYRAGKCIGDTTEEQLWNAKHLYDSAFHPDSGEKMNLFGRMTFQVPGGMAITGL
LLQFYKTPAQVALMQWFNQSFNAVVNYTNRNAASETSTKQMMFAYATATTTALGVALGLN
IYSRKAPPVVARWVPFVAVASANAVNIPLSRQTELLNGVTITDAEGNVMGKSKKCAQKGI
SQVVFSRILMAAPGMVCLPIMMESLIKRKWFRSRTWLHLPFQVTGLGVFLIFMVPAACAV
FPQQASMKVGDLELDVRKSIEEKHGNLINTVYFNKGL

Nucleotide sequence

Length: 2,219

>KH2012:KH.C1.1207.v1.A.SL1-1
GTTCTTGACTGTCCAAATGGCCGACAACATTGAAGAAACCCCACCATGCAAATCCTGCAA
ACTTAGTGTAGATTTAGAAAAACCAAGATGGGATCAATCAACATTCGGTGGGAGACTAAA
ACATTTTTATGCAATAACCGACATGCGGAAGTTGTTTGTGCCAGATTCTCAACTGGATCA
TGCAAAAAATCTTGTCCTGGCTTACAGAGCTGGAAAATGTATCGGTGACACAACAGAAGA
ACAATTATGGAACGCTAAGCATCTTTATGACTCAGCATTTCACCCGGACAGTGGAGAGAA
AATGAATTTATTTGGGCGAATGACTTTCCAAGTGCCAGGAGGAATGGCAATTACTGGCCT
TTTATTGCAATTTTATAAAACACCTGCGCAAGTTGCATTAATGCAATGGTTTAACCAGTC
ATTTAATGCTGTAGTCAACTACACAAACCGCAATGCTGCTTCAGAAACATCAACGAAACA
AATGATGTTTGCATATGCTACTGCTACAACTACGGCATTAGGTGTTGCCCTTGGATTGAA
CATTTACTCAAGGAAGGCACCGCCTGTTGTTGCACGCTGGGTCCCATTTGTTGCTGTAGC
TTCAGCTAATGCTGTGAATATTCCTTTATCAAGACAAACGGAATTGTTAAATGGAGTTAC
AATCACAGATGCCGAGGGCAATGTGATGGGAAAATCAAAGAAATGTGCTCAGAAAGGAAT
AAGTCAAGTTGTTTTCTCCCGAATTTTAATGGCTGCACCAGGAATGGTTTGCCTCCCCAT
TATGATGGAGAGTTTGATCAAGCGGAAATGGTTTAGATCACGAACATGGCTACACCTTCC
TTTTCAAGTAACTGGCCTTGGAGTATTTTTAATATTCATGGTTCCAGCAGCTTGTGCAGT
CTTCCCACAGCAAGCATCAATGAAAGTTGGAGATTTGGAGTTAGATGTTCGTAAATCAAT
TGAGGAAAAACACGGCAATCTTATCAATACTGTGTACTTTAATAAGGGTTTATAATTCTA
ACTCTGCATATAATTTTAGACAATTTTAATAATTCCCTTGATTTAGTAGTGCCCAATATT
AATACATTCCAAAAATGTAACCTTTTCTATACTACCTAAAAGGTTTAGTCACTTTAGTGC
TTTATTGTAATAATAAAACGCTTTTGTGTTTGTTTAACATACATAACATGTTTTATCACT
TAATCGATCAATTTAAGACCCAACATAAATGATCCTGTTAAACATTGTTTTCTAAACAGG
TAACATTCATTATATAAATATTGGCAGATGTTTTTATTGGTTCATTTTCTGCCACACCCA
TGTCACGTAGCTGCTTTCATTTTAAATCATTTTTTTTACAATTTTACATATAGTTATCTG
CTAACTATTTGATGCAATAATTTTGTTGTTTTAATTACTGCGCAATCAGGTAAATGGTGT
TAGTAATGAATAAAATCGATGATATATATATATGTGATGCTCACAAATAGTTTAAATGCA
TCAGCTATAGAATAGTAGTTGGGGGTAAATGCAAAACTGTACAAAACCAGGTTTGTTATG
AATCTGTTATGAAAGACAATATTTGGATGTTATTTTCTAAAAGTGTCCCGTCTTCCCCCA
CTCTACTATATCTCAAGCACAAACTATGGTTTTCCAAATCTAGTTCTTAAACCTTGCATT
AATTATCGACTAATATAAACATTGTTTTAAAACATACAAACAAGAAACTAACTGATTCAA
TTGAACATGTTGGTACCATGCTAAACAATATAATTGCACAATGGTGGTATATACAAATGA
ACGAATATTTCAGGCGATTTCCAACATATGTACGTTTCCAAAAAGTAGGTATTTTATAAA
ATAAAACCATTTCAATTATCATTCTGTCAGTGGATAAGTCAGAGAAAAATAAAATAATCT
TGAACAAATACTTCTCACTAATAAAAGTAAAATAACTGGAAAAATTTAAAACAACAGCCT
ATGTACAACCATAACAGTGAAAAATACAATTAATTAACAATTTCTTTTTAACCTCTTAAA
TATATTAATAATAGCACTAAAGTACAAACCTGTTTATAAAGACTTGATTAAACAAAAAAT
CCATTTATAAACTGAAAGAGTTATTTGATTTCGGTAAAACATTTAATAAAAAAAAAGTTT
GAAAATGAAAGACCAAGTTTAGAGATTTTCAGGCAGCAATATACAGCATACTAAAACAT

InterProScan

PANTHER
Mtc (IPR004686) - T[20-337] 1.4E-156
TIGRFAM
Mtc (IPR004686) - T[23-337] 5.1E-116
Pfam
Mtc (IPR004686) - T[30-337] 5.8E-127

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
SFXN1_HUMAN 48.16 % 317 8.59E-108
SFXN3_HUMAN 47.634 % 315 5.3E-107
SFXN2_HUMAN 55.732 % 337 1.84E-115