Aniseed - Transcript Card

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C1.1207.v2.A.SL2-1

Possible name(s)

SFXN1; SFXN2; SFXN3

Gene model

KH2012:KH.C1.1207

Location

KhC1 [7,589,351 / 7,593,888]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 211

>KH.C1.1207.v2.A.SL2-1
TPAQVALMQWFNQSFNAVVNYTNRNAASETSTKQMMFAYATATTTALGVALGLNIYSRKA
PPVVARWVPFVAVASANAVNIPLSRQTELLNGVTITDAEGNVMGKSKKCAQKGISQVVFS
RILMAAPGMVCLPIMMESLIKRKWFRSRTWLHLPFQVTGLGVFLIFMVPAACAVFPQQAS
MKVGDLELDVRKSIEEKHGNLINTVYFNKGL

Nucleotide sequence

Length: 1,841

>KH2012:KH.C1.1207.v2.A.SL2-1
AACACCTGCGCAAGTTGCATTAATGCAATGGTTTAACCAGTCATTTAATGCTGTAGTCAA
CTACACAAACCGCAATGCTGCTTCAGAAACATCAACGAAACAAATGATGTTTGCATATGC
TACTGCTACAACTACGGCATTAGGTGTTGCCCTTGGATTGAACATTTACTCAAGGAAGGC
ACCGCCTGTTGTTGCACGCTGGGTCCCATTTGTTGCTGTAGCTTCAGCTAATGCTGTGAA
TATTCCTTTATCAAGACAAACGGAATTGTTAAATGGAGTTACAATCACAGATGCCGAGGG
CAATGTGATGGGAAAATCAAAGAAATGTGCTCAGAAAGGAATAAGTCAAGTTGTTTTCTC
CCGAATTTTAATGGCTGCACCAGGAATGGTTTGCCTCCCCATTATGATGGAGAGTTTGAT
CAAGCGGAAATGGTTTAGATCACGAACATGGCTACACCTTCCTTTTCAAGTAACTGGCCT
TGGAGTATTTTTAATATTCATGGTTCCAGCAGCTTGTGCAGTCTTCCCACAGCAAGCATC
AATGAAAGTTGGAGATTTGGAGTTAGATGTTCGTAAATCAATTGAGGAAAAACACGGCAA
TCTTATCAATACTGTGTACTTTAATAAGGGTTTATAATTCTAACTCTGCATATAATTTTA
GACAATTTTAATAATTCCCTTGATTTAGTAGTGCCCAATATTAATACATTCCAAAAATGT
AACCTTTTCTATACTACCTAAAAGGTTTAGTCACTTTAGTGCTTTATTGTAATAATAAAA
CGCTTTTGTGTTTGTTTAACATACATAACATGTTTTATCACTTAATCGATCAATTTAAGA
CCCAACATAAATGATCCTGTTAAACATTGTTTTCTAAACAGGTAACATTCATTATATAAA
TATTGGCAGATGTTTTTATTGGTTCATTTTCTGCCACACCCATGTCACGTAGCTGCTTTC
ATTTTAAATCATTTTTTTTACAATTTTACATATAGTTATCTGCTAACTATTTGATGCAAT
AATTTTGTTGTTTTAATTACTGCGCAATCAGGTAAATGGTGTTAGTAATGAATAAAATCG
ATGATATATATATATGTGATGCTCACAAATAGTTTAAATGCATCAGCTATAGAATAGTAG
TTGGGGGTAAATGCAAAACTGTACAAAACCAGGTTTGTTATGAATCTGTTATGAAAGACA
ATATTTGGATGTTATTTTCTAAAAGTGTCCCGTCTTCCCCCACTCTACTATATCTCAAGC
ACAAACTATGGTTTTCCAAATCTAGTTCTTAAACCTTGCATTAATTATCGACTAATATAA
ACATTGTTTTAAAACATACAAACAAGAAACTAACTGATTCAATTGAACATGTTGGTACCA
TGCTAAACAATATAATTGCACAATGGTGGTATATACAAATGAACGAATATTTCAGGCGAT
TTCCAACATATGTACGTTTCCAAAAAGTAGGTATTTTATAAAATAAAACCATTTCAATTA
TCATTCTGTCAGTGGATAAGTCAGAGAAAAATAAAATAATCTTGAACAAATACTTCTCAC
TAATAAAAGTAAAATAACTGGAAAAATTTAAAACAACAGCCTATGTACAACCATAACAGT
GAAAAATACAATTAATTAACAATTTCTTTTTAACCTCTTAAATATATTAATAATAGCACT
AAAGTACAAACCTGTTTATAAAGACTTGATTAAACAAAAAATCCATTTATAAACTGAAAG
AGTTATTTGATTTCGGTAAAACATTTAATAAAAAAAAAGTTTGAAAATGAAAGACCAAGT
TTAGAGATTTTCAGGCAGCAATATACAGCATACTAAAACAT

InterProScan

Pfam	Mtc (IPR004686) - T[2-211] 1.9E-81
PANTHER	Mtc (IPR004686) - T[3-211] 5.2E-100

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value
SFXN1_HUMAN	48.815 %	195	5.71E-62
SFXN3_HUMAN	45.411 %	187	4.73E-59
SFXN2_HUMAN	54.589 %	210	7.27E-68