Aniseed - Transcript Card

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C11.323.v1.A.SL1-1

Possible name(s)

RNF165; ZNRF1; ZNRF2

Gene model

KH2012:KH.C11.323

Location

KhC11 [313,742 / 321,288]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 222

>KH.C11.323.v1.A.SL1-1
PQKWIMGGKLSSDGNSTRNRTFAEHSGPSDPSNGINGSSQGGAMMTAGSLPVHRRPMIRF
DSSMMQETSQARLDPRLSRANSESDARLRIPRSGFGLFYRLQEERQDDGAGSSRNFGRAR
HSLPHSLPPYFLSPMRDAKCPMCGKVIPAEDVEVHFVMCLTKPRVTYNEDTLSVTLGECA
ICFEDLEEGESIARLPCLCIYHKGCIDEWFKKSQTCPEHPPD

Nucleotide sequence

Length: 1,985

>KH2012:KH.C11.323.v1.A.SL1-1
ATTCATGTATTATAAATATTGGCTTTAACAAATATTGATCAAAACGTTGTGAAACTGCTG
GAAAATTGAACATATATTAATAATGTTGATCTACTGCGTGTGACCCCAGAAGTGGATAAT
GGGCGGAAAACTTTCAAGTGATGGAAACTCAACTCGAAATCGGACTTTTGCCGAACACAG
CGGGCCTTCGGATCCCTCGAACGGGATCAATGGTTCGTCACAAGGTGGTGCTATGATGAC
AGCAGGGTCGCTTCCCGTACATCGACGACCGATGATCAGATTTGATTCGAGTATGATGCA
AGAGACAAGCCAAGCAAGGTTAGATCCTCGACTTTCGAGGGCAAACTCTGAGTCGGACGC
TCGACTACGAATACCTAGGTCAGGTTTTGGATTATTTTATCGCTTGCAAGAGGAAAGGCA
AGATGATGGAGCGGGTAGCTCAAGAAACTTTGGAAGGGCAAGACACTCGTTACCCCACTC
TCTTCCACCTTACTTCCTCAGCCCTATGAGAGATGCAAAATGTCCGATGTGTGGAAAAGT
CATTCCTGCCGAAGATGTGGAAGTTCATTTTGTGATGTGTTTAACCAAGCCTAGAGTCAC
ATATAATGAGGACACATTATCAGTAACTTTGGGCGAATGTGCGATTTGCTTTGAAGATTT
AGAGGAAGGAGAATCCATTGCTCGTCTGCCGTGCTTATGTATTTATCACAAAGGCTGCAT
TGATGAATGGTTCAAGAAAAGCCAGACTTGTCCAGAACATCCACCAGATTAACTATTGGT
TTGGACATATATGGATCACTGTGTTGCACGAAAGACATGGATTTTCTCTTTTTCTATTGT
TTTCAGTGGCTGGCAACCATTTTGCTGAGAAATGTCAAATAATTCAAAAGCAATAATTTT
ATTTAGGTTTACACTGGTTGGAGTAAACATAGAAATGTTAGAGTGTTTGCTTACACTGTA
ATATGAAACTTCTAATTGCTTTTGTTGTGAAATAAATGCTGTTTAAATAAAAGATAAGGT
AACATAATCCCTCCCCCAATAATAAACCATACATATGGATTTGTTAAATTAAAAAGCAGC
TACTCGTTAAAAATGGGGTTGTATCTGTTGGGATAATTATCATGAATATTCAAACTTTGT
TTTTTTTTTATTATATAATAATAATAAATTATGACATCACTTGTTACCATTTTCAGTAAT
ACTGTATTTTTCTAGACTTTTTACAATTCTTGTGCTCCTGTCACAATTCTGATTATTATG
TCACAACACATTAAAGTTTTTTTTTCTGATAATCAAAAGTTTATGTCATAGGGCAGTGTA
TATTGTCTCATTTTTCACCCAAGTATTGCATTTGTATATATTGTTCTATGTTGCTTCTCT
ATTTCAAATGGACAATCGAACTAACAAACAAAGTACTTTACATGGTGATGCAATCACTGT
TTTGCACCTCCTAATCTAACACCACACAATATATTCTGATTGTTTGTCATCCACACTGTT
AAGTTTAGATTAGACTTAGAAGTTTTGAGATATAAACATTGTTTGAAGCTTATTGTATAT
TTGGTTACACTTATGTATGGTATAAATATTATGTTCAAATTATCATTGGCTTAAATGTTA
TTTTCCTTTTTGGTATTCGTTGTATTTGGTGAACTGAAAATATGATTTTTATACCCTCTA
TTGCTTCACAGCAAATGTGCCAAAACATACAACTAAAAAAAATAATATTTTAAAAAAGCT
CTCCAATATATAAACTTGTTATATCCTTAAAATATATCAGAAACAGTAATGCTCTGTATT
TAGAATCACAGTAGTTACAACAGTATTATACCCAAGTAATAATCAAGTCCTTTTTGTTGC
ACGTTATATTTCTTGCTAATGGTGGCCAACTATAATTCAGAATCCCCTTTTTCTTTGAAT
GTTCTTTTGTAAATATACTTCTGCATTCTGATACTTGCAATGAGCATAAAATTTGTGATA
TGCTG

InterProScan

Gene3D	Znf_RING/FYVE/PHD (IPR013083) - T[158-218] 1.1E-14
Pfam	Znf_RING (IPR001841) - T[178-217] 8.6E-10
ProSiteProfiles	Znf_RING (IPR001841) - T[179-219] 10.114
SMART	Znf_RING (IPR001841) - T[179-219] 0.0014

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value
ZNRF2_HUMAN	47.586 %	142	6.59E-42
ZNRF1_HUMAN	46.565 %	135	1.39E-39