- Transcript 'KH2012:KH.C11.638.v1...'
Transcript Model
Transcript Id
KH2012:KH.C11.638.v1.A.ND2-1
Possible name(s)
CD22; HMCN2; MALT1
Gene model
Location
KhC11 [496,430 / 505,876]
Amino acid sequence
Length: 625
>KH.C11.638.v1.A.ND2-1
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HLLRYTYSMRLPFIKLWNDAKPKRS
Nucleotide sequence
Length: 2,950
>KH2012:KH.C11.638.v1.A.ND2-1
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ACCTAATATTAATATCAGAAGTTCCACAAGAAATTCTTAATCGACTTATTTCTTATCTCC
GCAATGATGGTGAAAGTGGTTGGCGGACTTTGGTTTATCATCTGCAACAAAGGGATCATT
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CATGCAGATGCGCGGCTGAGAAGCTTGCTAATGATTTGTGGATGCTCGAAAAATCTCAAC
AAAAATTCATGAGTACACCAATGCCAGAATGCAGCAAATACTCATCGGTTGGGCCATCTT
ACGTACCCAATGGTCACTCTACTCATGCTCAACCAAACCATCTTTTTGATCAAGCCATGT
TTTCAAGTCTTAACAACCTAAATAAACCTTCAAAGCCTTACATCTCAATTATGAAGCAAC
CAACGCCCCAATCAGTGAAAATAGGTGATGATTTAATGTTGGTTTGCAAGGCAGAAGGGG
ATCCAGTACCAGTGCATTACCAATGGTACAAAGATGGCCACATGCTCCCAAATCAAAACA
AACATGTACTAATGATTGGAGAAACTTTGCTTGAACATCAGGGGTTTTATTATTGTCATT
TAAGGTCGCCCAACCCCCCTGCTGTTGAAAAACGCACAGATGAAGTGTTTGTCAGTGTTG
TTTTAGCACCTTCTGCAACTCCATTCTGTGCCACAAACAAAGTTGCGTTATTGATTGCTA
ACGAGCATTATGCCCATAATCCAAGGTTACCTGCCACTAGTCATGATATCAGAGCTTTAA
CAAAGATATTACAGGAGGACCTTGGTTTTAAAACTCTTTCGTTCACCAACTTAACTTACA
CAAACATGATGTCTGCATTTATTTTGTTCAAAGATCTTGTTTCATCAGGTTGCTACTGTG
TATTTTACTTTGGTGGACACGGATATGAAAATGACGGCAAATGCTTTCTGGTCCCCATTG
AAGCCCCTCCAGATTATCAAAATCATGATTGTGTGCAAGCCCAGTCTGAGTTGGAAAATG
TGAAGCGACGTGGGGATCCAAACCTTATGCTCATTCTGTTAGATATTTGTAGAAAAAGAA
ATCCAATGAATCCAACCTCACATCAAAGTAACGGAAGTTCGTTTGCAGATAAAGTTGTTT
TTGCTTATGCAACCACAGAAAGTGCTGAAGCATATGAAAAATATGGGGAGAAACATGGGA
TATTTGTTGACTCACTTCGTAAACATCTAACTACCCCTATAAGAGTGAACCACATGTTAT
CTGATGTGCAGGATGAGATAAAGAAAAGCGACGTACAGATTTCTGAGGTTAAATCCACGC
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CTTACAAGGAGGTTGATAGGATATGGAACTCACTGCACTTCACCCCACTCCCTGTCCTGC
TTAAGTTCGAAGCTTGCGATGCCGAAGTCACGATCAGTTTCACCAACATTCTTACTAATG
CTGTGAATATCAGTGTTAATGTTATAAAGTGTGGGAAAGGTGTGGAATGTAAACCTTTCA
TCTGTACAAATTATTTTGGAAATTTAGTAGTATCGCATTGCTCATCCGAATTTGAACCAC
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GGCATTATTGTTTTTAAATTTACCTAGTTATTAATGTACTGGTTTAGTGGTTTATAAGAT
ATGTTACTAATTTTGGTGCTAACTTAAAAACCAGGAGTGGTATTAGCCGGAACGTAACGG
AACACCATTCCAAATGCTCAATAAACATTTTTGGTTATCAAAATGGCATAGTCGCAAGAC
AAAACTAGATTACCTTAATATGATTGCTTTGTTATAGTAACTTACTTATAGTTCTGGATG
TTTTGGTCCTAAAAATTCAGTACTGGCTATAACATATTCTATATTAACAACAAAAGTGTT
GGCTGAGCCTCTAGTAGTTATTATACCTGTTTAAAACAATTAATTCCAGATTTGCTCACT
TTTATTTAAACTTATAATTATTGTATAATCTAAATCCATTCTTGCACATAAGTCATTAAT
ATCTCAGTAGCGTGTCAACTTTTTTGCAACAGATTTAATCTTTCCTGATTTCTTTTATGA
ATAGTAATAGATTTTGTAAAACTAAATAATGTTATTTTTTTGTGATGCAAACAAAAGACA
CAGTGATGTAAAAGTCCAAAAGTGTAATGAATGACAATTTGTATTCTCTAATGATTTTAA
ATTTCTTGCAGAAAATTATTGTTTTATATTCTCCATAATCATGTTTATTGTATCTTTATG
TTGGTGCTTTAGAACAAGGCACTTAAACTGTATGTCTCAAAACTTATCTAATTAACTATA
ATTTGTGAAAAGTCCCACAATTGTTTATATTTGCAAAATGGTTTAAAATTTGGTGTGCCT
CACACAAATCAAGGGAATCCAAGTGTCCTGTAGCCGAAACACACATGATTATTGCAATTA
TTGATCAATTCCTTATTTGTACACAGTTGGGTGTTATCTATTTTTTCTTTTATTTATTTC
TGCCCAATGTACAAAATATGTTTTTTCTAATACTGTTCTTTTAAAATAAACAGTAAAATA
TTATGAAGCA
| Gene3D |
Ig-like_fold (IPR013783) - T[159-244] 2.0E-15 |
| SUPERFAMILY |
Ig-like_dom_sf (IPR036179) - T[161-234] 4.12E-16 |
| ProSiteProfiles |
Ig-like_dom (IPR007110) - T[162-248] 11.442 |
| SMART |
Ig_sub (IPR003599) - T[170-250] 9.4E-9 |
| SMART |
Ig_sub2 (IPR003598) - T[176-235] 3.7E-4 |
| SUPERFAMILY |
Caspase-like_dom_sf (IPR029030) - T[260-478] 3.74E-26 |
| ProSiteProfiles |
Pept_C14_p20 (IPR001309) - T[261-340] 11.076 |
| Protein Name | Identity | Bit Score | e-value |
|---|---|---|---|
| MALT1_HUMAN | 31.535 % | 203 | 4.25E-56 |