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  1. Transcript 'KH2012:KH.C11.638.v1...'
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  4. Transcript 'KH2012:KH.C11.638.v1...'

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C11.638.v1.A.SL1-1

Possible name(s)

CD22; HMCN2; MALT1

Location

KhC11 [496,463 / 505,876]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 625

>KH.C11.638.v1.A.SL1-1
NMHTTSSIRNLILISEVPQEILNRLISYLRNDGESGWRTLVYHLQQRDHLFSEDEINSFE
TIHAPTLVIEGLKKRNKTVDYLLSFLHLLPCRCAAEKLANDLWMLEKSQQKFMSTPMPEC
SKYSSVGPSYVPNGHSTHAQPNHLFDQAMFSSLNNLNKPSKPYISIMKQPTPQSVKIGDD
LMLVCKAEGDPVPVHYQWYKDGHMLPNQNKHVLMIGETLLEHQGFYYCHLRSPNPPAVEK
RTDEVFVSVVLAPSATPFCATNKVALLIANEHYAHNPRLPATSHDIRALTKILQEDLGFK
TLSFTNLTYTNMMSAFILFKDLVSSGCYCVFYFGGHGYENDGKCFLVPIEAPPDYQNHDC
VQAQSELENVKRRGDPNLMLILLDICRKRNPMNPTSHQSNGSSFADKVVFAYATTESAEA
YEKYGEKHGIFVDSLRKHLTTPIRVNHMLSDVQDEIKKSDVQISEVKSTLSENRCLTDKI
QLNDVKAIKAYKEVDRIWNSLHFTPLPVLLKFEACDAEVTISFTNILTNAVNISVNVIKC
GKGVECKPFICTNYFGNLVVSHCSSEFEPQSCQVSNLEHLQEHLPVTVGFRYKFPSEEQW
HLLRYTYSMRLPFIKLWNDAKPKRS

Nucleotide sequence

Length: 2,917

>KH2012:KH.C11.638.v1.A.SL1-1
ACCAATAGTTTTTTTGTATAATTAATTCTAGCCTCCTACAAGTCTTGTTGTGCATATAAA
ACATGCATACAACTTCATCCATAAGGAACCTAATATTAATATCAGAAGTTCCACAAGAAA
TTCTTAATCGACTTATTTCTTATCTCCGCAATGATGGTGAAAGTGGTTGGCGGACTTTGG
TTTATCATCTGCAACAAAGGGATCATTTATTCAGTGAGGATGAGATAAATAGTTTCGAAA
CCATCCATGCCCCAACACTTGTAATTGAGGGTTTGAAGAAACGAAACAAAACTGTTGATT
ATTTGTTGAGCTTCCTTCACCTACTACCATGCAGATGCGCGGCTGAGAAGCTTGCTAATG
ATTTGTGGATGCTCGAAAAATCTCAACAAAAATTCATGAGTACACCAATGCCAGAATGCA
GCAAATACTCATCGGTTGGGCCATCTTACGTACCCAATGGTCACTCTACTCATGCTCAAC
CAAACCATCTTTTTGATCAAGCCATGTTTTCAAGTCTTAACAACCTAAATAAACCTTCAA
AGCCTTACATCTCAATTATGAAGCAACCAACGCCCCAATCAGTGAAAATAGGTGATGATT
TAATGTTGGTTTGCAAGGCAGAAGGGGATCCAGTACCAGTGCATTACCAATGGTACAAAG
ATGGCCACATGCTCCCAAATCAAAACAAACATGTACTAATGATTGGAGAAACTTTGCTTG
AACATCAGGGGTTTTATTATTGTCATTTAAGGTCGCCCAACCCCCCTGCTGTTGAAAAAC
GCACAGATGAAGTGTTTGTCAGTGTTGTTTTAGCACCTTCTGCAACTCCATTCTGTGCCA
CAAACAAAGTTGCGTTATTGATTGCTAACGAGCATTATGCCCATAATCCAAGGTTACCTG
CCACTAGTCATGATATCAGAGCTTTAACAAAGATATTACAGGAGGACCTTGGTTTTAAAA
CTCTTTCGTTCACCAACTTAACTTACACAAACATGATGTCTGCATTTATTTTGTTCAAAG
ATCTTGTTTCATCAGGTTGCTACTGTGTATTTTACTTTGGTGGACACGGATATGAAAATG
ACGGCAAATGCTTTCTGGTCCCCATTGAAGCCCCTCCAGATTATCAAAATCATGATTGTG
TGCAAGCCCAGTCTGAGTTGGAAAATGTGAAGCGACGTGGGGATCCAAACCTTATGCTCA
TTCTGTTAGATATTTGTAGAAAAAGAAATCCAATGAATCCAACCTCACATCAAAGTAACG
GAAGTTCGTTTGCAGATAAAGTTGTTTTTGCTTATGCAACCACAGAAAGTGCTGAAGCAT
ATGAAAAATATGGGGAGAAACATGGGATATTTGTTGACTCACTTCGTAAACATCTAACTA
CCCCTATAAGAGTGAACCACATGTTATCTGATGTGCAGGATGAGATAAAGAAAAGCGACG
TACAGATTTCTGAGGTTAAATCCACGCTGTCTGAAAATCGCTGCCTCACTGATAAAATAC
AACTTAATGATGTCAAAGCTATTAAAGCTTACAAGGAGGTTGATAGGATATGGAACTCAC
TGCACTTCACCCCACTCCCTGTCCTGCTTAAGTTCGAAGCTTGCGATGCCGAAGTCACGA
TCAGTTTCACCAACATTCTTACTAATGCTGTGAATATCAGTGTTAATGTTATAAAGTGTG
GGAAAGGTGTGGAATGTAAACCTTTCATCTGTACAAATTATTTTGGAAATTTAGTAGTAT
CGCATTGCTCATCCGAATTTGAACCACAATCTTGCCAAGTTTCAAACTTGGAGCATTTGC
AGGAACATTTACCGGTTACTGTTGGTTTTCGATACAAATTCCCATCAGAAGAGCAATGGC
ATCTATTACGTTATACTTATTCAATGCGATTACCTTTTATAAAGCTTTGGAATGATGCAA
AACCAAAGAGATCCTGAATCTATCAGAGGCATTATTGTTTTTAAATTTACCTAGTTATTA
ATGTACTGGTTTAGTGGTTTATAAGATATGTTACTAATTTTGGTGCTAACTTAAAAACCA
GGAGTGGTATTAGCCGGAACGTAACGGAACACCATTCCAAATGCTCAATAAACATTTTTG
GTTATCAAAATGGCATAGTCGCAAGACAAAACTAGATTACCTTAATATGATTGCTTTGTT
ATAGTAACTTACTTATAGTTCTGGATGTTTTGGTCCTAAAAATTCAGTACTGGCTATAAC
ATATTCTATATTAACAACAAAAGTGTTGGCTGAGCCTCTAGTAGTTATTATACCTGTTTA
AAACAATTAATTCCAGATTTGCTCACTTTTATTTAAACTTATAATTATTGTATAATCTAA
ATCCATTCTTGCACATAAGTCATTAATATCTCAGTAGCGTGTCAACTTTTTTGCAACAGA
TTTAATCTTTCCTGATTTCTTTTATGAATAGTAATAGATTTTGTAAAACTAAATAATGTT
ATTTTTTTGTGATGCAAACAAAAGACACAGTGATGTAAAAGTCCAAAAGTGTAATGAATG
ACAATTTGTATTCTCTAATGATTTTAAATTTCTTGCAGAAAATTATTGTTTTATATTCTC
CATAATCATGTTTATTGTATCTTTATGTTGGTGCTTTAGAACAAGGCACTTAAACTGTAT
GTCTCAAAACTTATCTAATTAACTATAATTTGTGAAAAGTCCCACAATTGTTTATATTTG
CAAAATGGTTTAAAATTTGGTGTGCCTCACACAAATCAAGGGAATCCAAGTGTCCTGTAG
CCGAAACACACATGATTATTGCAATTATTGATCAATTCCTTATTTGTACACAGTTGGGTG
TTATCTATTTTTTCTTTTATTTATTTCTGCCCAATGTACAAAATATGTTTTTTCTAATAC
TGTTCTTTTAAAATAAACAGTAAAATATTATGAAGCA

InterProScan

Gene3D
Ig-like_fold (IPR013783) - T[159-244] 2.0E-15
SUPERFAMILY
Ig-like_dom_sf (IPR036179) - T[161-234] 4.12E-16
ProSiteProfiles
Ig-like_dom (IPR007110) - T[162-248] 11.442
SMART
Ig_sub (IPR003599) - T[170-250] 9.4E-9
SMART
Ig_sub2 (IPR003598) - T[176-235] 3.7E-4
SUPERFAMILY
Caspase-like_dom_sf (IPR029030) - T[260-478] 3.74E-26
ProSiteProfiles
Pept_C14_p20 (IPR001309) - T[261-340] 11.076

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
MALT1_HUMAN 31.535 % 203 4.25E-56