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  1. Transcript 'Cisavi.CG.ENS81.R44....'
  2. Transcript 'Haaura.CG.MTP2014.S4...'
  3. Transcript 'Cisavi.CG.ENS81.R337...'
  4. Transcript 'KH2012:KH.C11.638.v1...'

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C11.638.v1.A.SL3-1

Possible name(s)

CD22; HMCN2; MALT1

Location

KhC11 [496,494 / 505,876]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 625

>KH.C11.638.v1.A.SL3-1
NMHTTSSIRNLILISEVPQEILNRLISYLRNDGESGWRTLVYHLQQRDHLFSEDEINSFE
TIHAPTLVIEGLKKRNKTVDYLLSFLHLLPCRCAAEKLANDLWMLEKSQQKFMSTPMPEC
SKYSSVGPSYVPNGHSTHAQPNHLFDQAMFSSLNNLNKPSKPYISIMKQPTPQSVKIGDD
LMLVCKAEGDPVPVHYQWYKDGHMLPNQNKHVLMIGETLLEHQGFYYCHLRSPNPPAVEK
RTDEVFVSVVLAPSATPFCATNKVALLIANEHYAHNPRLPATSHDIRALTKILQEDLGFK
TLSFTNLTYTNMMSAFILFKDLVSSGCYCVFYFGGHGYENDGKCFLVPIEAPPDYQNHDC
VQAQSELENVKRRGDPNLMLILLDICRKRNPMNPTSHQSNGSSFADKVVFAYATTESAEA
YEKYGEKHGIFVDSLRKHLTTPIRVNHMLSDVQDEIKKSDVQISEVKSTLSENRCLTDKI
QLNDVKAIKAYKEVDRIWNSLHFTPLPVLLKFEACDAEVTISFTNILTNAVNISVNVIKC
GKGVECKPFICTNYFGNLVVSHCSSEFEPQSCQVSNLEHLQEHLPVTVGFRYKFPSEEQW
HLLRYTYSMRLPFIKLWNDAKPKRS

Nucleotide sequence

Length: 2,886

>KH2012:KH.C11.638.v1.A.SL3-1
CCTCCTACAAGTCTTGTTGTGCATATAAAACATGCATACAACTTCATCCATAAGGAACCT
AATATTAATATCAGAAGTTCCACAAGAAATTCTTAATCGACTTATTTCTTATCTCCGCAA
TGATGGTGAAAGTGGTTGGCGGACTTTGGTTTATCATCTGCAACAAAGGGATCATTTATT
CAGTGAGGATGAGATAAATAGTTTCGAAACCATCCATGCCCCAACACTTGTAATTGAGGG
TTTGAAGAAACGAAACAAAACTGTTGATTATTTGTTGAGCTTCCTTCACCTACTACCATG
CAGATGCGCGGCTGAGAAGCTTGCTAATGATTTGTGGATGCTCGAAAAATCTCAACAAAA
ATTCATGAGTACACCAATGCCAGAATGCAGCAAATACTCATCGGTTGGGCCATCTTACGT
ACCCAATGGTCACTCTACTCATGCTCAACCAAACCATCTTTTTGATCAAGCCATGTTTTC
AAGTCTTAACAACCTAAATAAACCTTCAAAGCCTTACATCTCAATTATGAAGCAACCAAC
GCCCCAATCAGTGAAAATAGGTGATGATTTAATGTTGGTTTGCAAGGCAGAAGGGGATCC
AGTACCAGTGCATTACCAATGGTACAAAGATGGCCACATGCTCCCAAATCAAAACAAACA
TGTACTAATGATTGGAGAAACTTTGCTTGAACATCAGGGGTTTTATTATTGTCATTTAAG
GTCGCCCAACCCCCCTGCTGTTGAAAAACGCACAGATGAAGTGTTTGTCAGTGTTGTTTT
AGCACCTTCTGCAACTCCATTCTGTGCCACAAACAAAGTTGCGTTATTGATTGCTAACGA
GCATTATGCCCATAATCCAAGGTTACCTGCCACTAGTCATGATATCAGAGCTTTAACAAA
GATATTACAGGAGGACCTTGGTTTTAAAACTCTTTCGTTCACCAACTTAACTTACACAAA
CATGATGTCTGCATTTATTTTGTTCAAAGATCTTGTTTCATCAGGTTGCTACTGTGTATT
TTACTTTGGTGGACACGGATATGAAAATGACGGCAAATGCTTTCTGGTCCCCATTGAAGC
CCCTCCAGATTATCAAAATCATGATTGTGTGCAAGCCCAGTCTGAGTTGGAAAATGTGAA
GCGACGTGGGGATCCAAACCTTATGCTCATTCTGTTAGATATTTGTAGAAAAAGAAATCC
AATGAATCCAACCTCACATCAAAGTAACGGAAGTTCGTTTGCAGATAAAGTTGTTTTTGC
TTATGCAACCACAGAAAGTGCTGAAGCATATGAAAAATATGGGGAGAAACATGGGATATT
TGTTGACTCACTTCGTAAACATCTAACTACCCCTATAAGAGTGAACCACATGTTATCTGA
TGTGCAGGATGAGATAAAGAAAAGCGACGTACAGATTTCTGAGGTTAAATCCACGCTGTC
TGAAAATCGCTGCCTCACTGATAAAATACAACTTAATGATGTCAAAGCTATTAAAGCTTA
CAAGGAGGTTGATAGGATATGGAACTCACTGCACTTCACCCCACTCCCTGTCCTGCTTAA
GTTCGAAGCTTGCGATGCCGAAGTCACGATCAGTTTCACCAACATTCTTACTAATGCTGT
GAATATCAGTGTTAATGTTATAAAGTGTGGGAAAGGTGTGGAATGTAAACCTTTCATCTG
TACAAATTATTTTGGAAATTTAGTAGTATCGCATTGCTCATCCGAATTTGAACCACAATC
TTGCCAAGTTTCAAACTTGGAGCATTTGCAGGAACATTTACCGGTTACTGTTGGTTTTCG
ATACAAATTCCCATCAGAAGAGCAATGGCATCTATTACGTTATACTTATTCAATGCGATT
ACCTTTTATAAAGCTTTGGAATGATGCAAAACCAAAGAGATCCTGAATCTATCAGAGGCA
TTATTGTTTTTAAATTTACCTAGTTATTAATGTACTGGTTTAGTGGTTTATAAGATATGT
TACTAATTTTGGTGCTAACTTAAAAACCAGGAGTGGTATTAGCCGGAACGTAACGGAACA
CCATTCCAAATGCTCAATAAACATTTTTGGTTATCAAAATGGCATAGTCGCAAGACAAAA
CTAGATTACCTTAATATGATTGCTTTGTTATAGTAACTTACTTATAGTTCTGGATGTTTT
GGTCCTAAAAATTCAGTACTGGCTATAACATATTCTATATTAACAACAAAAGTGTTGGCT
GAGCCTCTAGTAGTTATTATACCTGTTTAAAACAATTAATTCCAGATTTGCTCACTTTTA
TTTAAACTTATAATTATTGTATAATCTAAATCCATTCTTGCACATAAGTCATTAATATCT
CAGTAGCGTGTCAACTTTTTTGCAACAGATTTAATCTTTCCTGATTTCTTTTATGAATAG
TAATAGATTTTGTAAAACTAAATAATGTTATTTTTTTGTGATGCAAACAAAAGACACAGT
GATGTAAAAGTCCAAAAGTGTAATGAATGACAATTTGTATTCTCTAATGATTTTAAATTT
CTTGCAGAAAATTATTGTTTTATATTCTCCATAATCATGTTTATTGTATCTTTATGTTGG
TGCTTTAGAACAAGGCACTTAAACTGTATGTCTCAAAACTTATCTAATTAACTATAATTT
GTGAAAAGTCCCACAATTGTTTATATTTGCAAAATGGTTTAAAATTTGGTGTGCCTCACA
CAAATCAAGGGAATCCAAGTGTCCTGTAGCCGAAACACACATGATTATTGCAATTATTGA
TCAATTCCTTATTTGTACACAGTTGGGTGTTATCTATTTTTTCTTTTATTTATTTCTGCC
CAATGTACAAAATATGTTTTTTCTAATACTGTTCTTTTAAAATAAACAGTAAAATATTAT
GAAGCA

InterProScan

Gene3D
Ig-like_fold (IPR013783) - T[159-244] 2.0E-15
SUPERFAMILY
Ig-like_dom_sf (IPR036179) - T[161-234] 4.12E-16
ProSiteProfiles
Ig-like_dom (IPR007110) - T[162-248] 11.442
SMART
Ig_sub (IPR003599) - T[170-250] 9.4E-9
SMART
Ig_sub2 (IPR003598) - T[176-235] 3.7E-4
SUPERFAMILY
Caspase-like_dom_sf (IPR029030) - T[260-478] 3.74E-26
ProSiteProfiles
Pept_C14_p20 (IPR001309) - T[261-340] 11.076

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
MALT1_HUMAN 31.535 % 203 4.25E-56