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  1. Transcript 'KH2012:KH.C12.398.v1...'

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C12.398.v1.R.ND1-1

Possible name(s)

SLC23A1; SLC23A2; SLC23A3

Location

KhC12 [2,445,778 / 2,453,301]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 626

>KH.C12.398.v1.R.ND1-1
SLRFNLNSASTKMDGVDNTSFVSNEIPRFSSSDDVSVSDLTSHEVDDDDSSDLLYKVDDA
PAWYACVAFGIQHYLVALGGMVGLPLLLAGPLCIPNDDDGDVARAFIISTVFFVAGICTM
LQTTFGIRLPIMQGGTFSFLPPTLAILSLPHNKCPPALPSGFNNVSYTLYNDTDGSIIDG
TEVWQRRIREVQGAIAVSSCLQILLGLTGAIGFLLRFIGPLTIAPAVALIGLDLFSTAYG
DASTQWGIAMFTSFVLILCSQYLKNVNIPFPHYSMKKKFTWKKAPIFKMFPVLFALVLAW
LLCLILTECNALPSDPDNPAYKARTDIKLNVLYKAPWFRFPYPGQWGLPRVTLAGVIGMM
AGVVAGIVESIGDYYACARLSGAPNPPTHAINRGILMEGFGCLLAGVIGTSTATTSFSEN
IGAIGITRVGSRRVLQVAGFIFFILGMLSKFGSIFVTIPDPVIGGLFCVMFGMIAAVGLS
NLQYVDLNSPRNLFIIGFSIFMGLTVPEWMKANQGVIQTGVMEIDQILSVLLETSMLVGG
ILALVFDNTIPGTESERGIVKWRNAKNGNEVLDEKTLLQQEADCYKLPFPTNCCRFSRYI
PILPEFMGRYDGDVEKGQSMNFVTKF

Nucleotide sequence

Length: 2,221

>KH2012:KH.C12.398.v1.R.ND1-1
GTATAGTATAATCTTTAAGATTCAACTTAAATTCTGCAAGTACTAAAATGGACGGAGTAG
ATAATACATCGTTTGTGAGCAACGAAATTCCACGCTTTAGTAGTAGTGATGACGTGTCGG
TGAGTGATCTGACGTCACATGAGGTAGATGACGACGATTCATCAGATCTGTTGTATAAAG
TTGATGATGCCCCTGCATGGTATGCATGTGTTGCCTTTGGAATTCAGCACTATTTGGTTG
CACTTGGGGGCATGGTGGGGCTACCTTTGCTCCTGGCTGGTCCCTTGTGTATTCCTAACG
ATGACGATGGAGACGTTGCAAGGGCTTTTATCATAAGCACTGTCTTCTTTGTGGCTGGCA
TATGCACAATGCTACAAACAACTTTTGGGATAAGGTTGCCAATCATGCAGGGCGGTACGT
TCAGTTTTCTTCCACCTACACTTGCCATTCTGTCTTTGCCTCACAATAAATGCCCTCCAG
CTCTACCTAGTGGATTTAACAACGTCTCATACACTCTATATAACGACACAGATGGAAGCA
TTATTGATGGGACCGAAGTATGGCAGAGGAGAATAAGAGAGGTTCAAGGGGCAATAGCTG
TCTCTTCATGTTTGCAAATTTTGCTTGGCTTGACTGGTGCTATTGGTTTTTTACTTCGAT
TTATTGGACCTTTAACCATTGCCCCTGCTGTTGCATTGATTGGGTTGGACCTCTTTTCCA
CAGCTTATGGAGATGCATCCACGCAATGGGGAATTGCAATGTTCACATCCTTTGTTCTTA
TTCTATGCTCACAATACTTAAAGAATGTGAATATTCCATTTCCACATTACTCAATGAAAA
AGAAATTTACTTGGAAAAAAGCTCCAATTTTTAAGATGTTCCCTGTACTGTTTGCGTTGG
TACTGGCGTGGCTACTCTGCCTTATTCTAACAGAATGTAATGCTCTACCAAGCGACCCAG
ACAATCCTGCATATAAAGCTAGGACAGATATAAAGCTTAACGTTTTGTACAAAGCCCCAT
GGTTTCGGTTTCCTTACCCGGGGCAGTGGGGATTACCCCGGGTGACTCTTGCTGGGGTGA
TAGGAATGATGGCTGGGGTTGTGGCGGGGATTGTTGAATCGATTGGGGATTACTACGCAT
GTGCAAGACTCTCTGGGGCCCCTAACCCCCCCACCCATGCTATTAACAGGGGAATTCTTA
TGGAGGGGTTTGGCTGCTTGCTGGCGGGTGTCATTGGGACAAGCACGGCTACAACCTCCT
TCAGTGAAAATATTGGAGCAATTGGAATCACAAGAGTTGGAAGTAGAAGGGTCCTGCAAG
TAGCTGGCTTCATCTTCTTCATCCTTGGGATGCTTAGCAAGTTTGGGAGCATCTTCGTCA
CGATCCCGGATCCAGTGATCGGAGGTTTGTTCTGTGTGATGTTTGGGATGATCGCGGCAG
TCGGACTCAGCAACTTGCAGTATGTGGATCTTAATTCACCCAGGAATCTGTTTATAATTG
GTTTCTCTATCTTCATGGGATTAACAGTGCCAGAATGGATGAAAGCAAACCAAGGTGTTA
TACAGACTGGGGTGATGGAGATCGACCAAATATTATCTGTGCTTCTGGAAACTTCCATGC
TAGTTGGTGGAATACTTGCTCTTGTATTTGATAACACAATTCCAGGTACTGAAAGTGAAC
GTGGTATTGTAAAATGGCGAAACGCTAAGAACGGTAATGAGGTTCTTGACGAGAAAACTT
TGCTTCAACAGGAAGCAGATTGTTACAAACTTCCCTTCCCGACTAATTGCTGCAGGTTTT
CTCGGTATATTCCCATTTTGCCAGAGTTTATGGGCAGGTACGATGGAGATGTAGAAAAAG
GACAAAGCATGAACTTTGTCACCAAGTTTTAATGTGAAATGTAGTCTATTTGTACGTAAA
TAAAAATACAAAATATTTTGAAGCTGTTGTGTTGTTTTTCTACTCATCTTGTCTGTTACC
CAGGTATAATTTCAAACTAATCTTTATTACTGCACAAAAGAATCTTTGTTTTAACATTTT
TACTTGGTGCTAATATTTTAACTTCTTGAGATTTCCATTCTGTTTGCTGCCACACATAAC
TGGTAAGAATGCTTTTTGTGTTTCCAAAATTGGGGTGCAGTCTCGGATTCGATATTCTGT
TGTGGTTATATTTCTACCTATATCATGTTAGTTGAATAAATAATGATTTTTTTGCTACTG
A

InterProScan

Pfam
Xant/urac/vitC (IPR006043) - T[67-510] 1.5E-89
ProSitePatterns
Xan_ur_permease (IPR006042) - T[458-478] .

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
S23A1_HUMAN 47.668 % 541 0
S23A2_HUMAN 50.087 % 547 0
S23A3_HUMAN 31.161 % 246 3.48E-73