Aniseed - Transcript Card

Transcript 'KH2012:KH.C1.307.v1....'

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C1.307.v1.A.SL2-1

Possible name(s)

GLS; GLS2

Gene model

KH2012:KH.C1.307

Location

KhC1 [4,457,292 / 4,462,664]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 517

>KH.C1.307.v1.A.SL2-1
DCRFVAQAGMWLRKTNICVLFNQEYLKLKGMYASQYLPFKHARVFSYVQQSVVNSQRNHI
TGTAAAAEASSLIYQILSNGKKTLALRHLKEKLNGNGILWNDPRLKQLHQNIQDWQSNNL
HHENETINTSITADTFLHFLKDEVTLKLFCKVFSKGCVIPNFKKFTEIIADCFETAKKSQ
HGKVADYIPQLAKADPESWGLSICSVDGQRFSIGDANESFCLQSCVKPFVYAIAVSDYSS
EMIHRYMGQEPSGLYFNALNLNTEDKPHNPLINSGAIVVCSLIKPDQLLSERFEYVQKYL
RDMCADEHVSFDNTVFLSEKQTSFQNFSIAYYLMEKNCFPVNTSLRTTLDFYLQLCAVTT
TCQSAAVAASTLANGGVSPLLQNKDRLLQPASVRNTLSLMHSCGMYDYSGKFAFQVGLPA
KSGVAGGLLVVIPNVMGFMCRSPLLDDKGNSVRGIEFCRELVRTFNFHTYDDLLHSVKKK
DPRKLNRLLTSDEMRLSYLYKVMYEYDSETDDSIQHD

Nucleotide sequence

Length: 2,103

>KH2012:KH.C1.307.v1.A.SL2-1
GATTGTCGTTTTGTTGCGCAAGCCGGCATGTGGTTGAGAAAGACAAACATCTGTGTGCTA
TTTAATCAAGAGTACCTCAAACTCAAGGGCATGTACGCTTCTCAGTATTTGCCGTTTAAA
CATGCTCGTGTTTTTAGTTATGTTCAGCAATCGGTAGTTAACTCTCAACGCAACCACATC
ACTGGAACAGCTGCTGCAGCAGAAGCAAGCTCATTAATTTACCAAATCCTAAGCAATGGA
AAGAAAACTCTTGCATTACGCCACTTAAAAGAGAAATTAAATGGCAATGGAATATTGTGG
AATGATCCAAGATTAAAACAGCTTCACCAAAACATTCAAGATTGGCAATCAAATAATCTT
CATCATGAGAATGAGACAATTAACACAAGTATCACTGCTGACACTTTTCTACATTTTCTA
AAAGACGAAGTAACTTTAAAGTTATTCTGCAAAGTGTTTTCAAAAGGTTGTGTTATTCCA
AACTTTAAAAAGTTCACAGAGATAATTGCTGATTGTTTTGAAACAGCTAAAAAAAGTCAA
CATGGAAAGGTGGCCGATTATATTCCTCAACTTGCGAAAGCCGACCCGGAGTCTTGGGGA
TTGTCTATTTGCTCTGTGGATGGACAAAGGTTTTCAATTGGTGATGCAAATGAATCATTT
TGTTTACAATCTTGTGTGAAGCCCTTTGTTTATGCAATCGCAGTCTCTGATTACAGTTCT
GAAATGATTCATCGTTACATGGGGCAGGAACCTAGTGGACTTTATTTTAATGCACTAAAC
TTGAATACTGAAGACAAGCCACATAATCCTTTAATAAATTCTGGAGCTATTGTTGTATGT
TCCCTTATTAAACCAGATCAGCTGCTATCAGAAAGATTTGAATATGTTCAAAAGTATTTA
CGAGATATGTGCGCCGATGAACATGTCTCATTTGACAACACTGTGTTTTTATCTGAGAAG
CAAACTTCATTTCAAAATTTTTCAATTGCCTACTACTTGATGGAGAAAAATTGTTTCCCT
GTGAATACTTCACTTCGTACAACACTTGACTTCTATCTTCAACTTTGTGCTGTAACAACT
ACTTGTCAAAGTGCTGCCGTTGCTGCTTCAACCCTAGCGAATGGAGGTGTTAGTCCTTTG
TTGCAAAACAAAGATCGATTGTTACAACCAGCATCCGTTCGTAACACACTGTCATTAATG
CATTCTTGTGGAATGTACGACTATTCTGGAAAGTTTGCATTTCAGGTTGGCTTACCAGCA
AAATCTGGTGTAGCAGGGGGGTTACTTGTTGTTATTCCAAATGTAATGGGATTTATGTGT
AGAAGCCCGCTACTGGATGATAAAGGAAATTCTGTTCGAGGTATTGAGTTCTGTCGAGAA
CTTGTGAGGACATTCAATTTTCATACGTATGATGATCTTTTACATTCAGTAAAGAAAAAG
GACCCAAGAAAACTAAACAGACTGTTAACAAGTGATGAGATGAGATTAAGTTATCTTTAT
AAGGTAATGTATGAATATGATTCCGAGACAGATGATAGCATTCAGCATGACTGAGCAATC
ACCCAAAACATTCTCTAATGAATACAATCAACAGATCTGTGCTGACCCCAAAACTTTTGA
TTTGTTTTACCTTGCCTTTTGTATCCAGCATCCTTATATACACAAGCCATTTAAACTTAC
CTGTCAAATAATTAGTAATACCACCATGTGTTTTGTAGACAATTTGCACAATTTTTAATA
TCACATGGTCTCATTCGTTTAAAATTATGTTATGTTAAACCATTTTAACAAGTGATTGTA
ATGGGCTATTTATTAAATAATTTAAATTTTTATTAATACAGAAATTATGTATACATGGAG
AGAGCTGCATACAATTATTTTTTATCACATTTATAAAGAAATTACTTTCAGTTTCTTCGT
GCTTAATCAGCAACACCAAGACTGGGGCTTAAAACTAGTCCTATAACAATTTGTTACAGG
TGTAGTGATATTTTTGTTTGTTAGTTTTTAAGTTCGTAAGTAGTGCTTATTCTAGTCAAT
AAATAACATGCTCAATTTAGTTCTGCTAAATTTAAATTGAAAAATAAAGTTTCAAAGTGT
AAA

InterProScan

PANTHER	Glutaminase (IPR015868) - T[19-487] 1.6E-190
SUPERFAMILY	Beta-lactam/transpept-like (IPR012338) - T[162-471] 2.5E-100
Hamap	Glutaminase (IPR015868) - T[165-470] 34.529
TIGRFAM	Glutaminase (IPR015868) - T[175-467] 3.4E-85
Pfam	Glutaminase (IPR015868) - T[182-470] 4.8E-112

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value
GLSK_HUMAN	51.09 %	437	2.66E-147
GLSL_HUMAN	47.002 %	412	2.47E-138