Aniseed - Transcript Card

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C13.195.v1.A.nonSL6-1

Possible name(s)

UCK1; UCK2; UCKL1

Gene model

KH2012:KH.C13.195

Location

KhC13 [1,546,699 / 1,554,161]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 282

>KH.C13.195.v1.A.nonSL6-1
KCAAIMPGSETNRERPFIIGVSGGTSSGKTSVCQKIIELLGESSAVNGARKVAIISQDNF
YKSLNAEEIRLANNCQYNFDHPDAFDTKLMKATILDIANGRTIKIPDYDFKTHTRRKEFC
EELHKCDVVLFEGILVFYHKEIRELFNMKLFVDSDADTRLSRRVLRDITDRGRTLESVLQ
QYTTFVKPAFEEFCLPSKKYADVIIPRGAENLVAINLIVQHIRDILNGGIIKRANGHQAN
GHQANGHQANGHVKNGDHVNGGGDFVPERRLSYQAVEGARPH

Nucleotide sequence

Length: 1,847

>KH2012:KH.C13.195.v1.A.nonSL6-1
AAATGCGCAGCAATTATGCCAGGCTCAGAAACAAACCGAGAAAGGCCCTTTATAATTGGT
GTGTCTGGTGGTACGTCATCAGGGAAGACCTCAGTATGCCAGAAGATCATTGAGCTACTG
GGAGAAAGTTCAGCCGTAAACGGGGCACGAAAGGTGGCAATTATAAGCCAAGACAACTTC
TATAAAAGTTTAAATGCAGAAGAAATAAGACTTGCAAATAATTGTCAGTATAACTTTGAC
CACCCAGATGCCTTCGATACAAAACTCATGAAAGCAACAATCCTAGATATCGCAAATGGA
AGAACGATAAAAATACCTGATTATGATTTTAAAACACATACCAGACGGAAAGAATTCTGT
GAGGAATTGCACAAATGTGACGTTGTGTTGTTCGAAGGCATCCTCGTGTTTTATCATAAA
GAAATACGAGAATTATTTAATATGAAGCTGTTTGTAGATAGTGATGCAGATACTAGGTTA
TCTAGAAGAGTATTAAGAGACATAACAGACCGAGGACGAACGTTAGAATCCGTGTTACAA
CAATACACAACCTTTGTTAAACCTGCATTTGAAGAATTCTGTTTACCATCAAAGAAATAT
GCTGATGTCATCATTCCTAGGGGAGCTGAAAACTTGGTTGCCATCAACTTGATAGTTCAA
CACATTCGAGATATACTGAACGGAGGCATAATAAAACGTGCCAATGGTCACCAGGCCAAT
GGTCACCAGGCCAATGGACATCAGGCCAACGGACATGTCAAAAACGGTGACCATGTAAAT
GGGGGAGGAGACTTCGTGCCGGAACGGCGATTGTCGTACCAGGCTGTTGAGGGTGCTCGC
CCGCACTAGTGTTGCCAAATCAGTGTTTCCAATTGAGAAACTGCTAAAATTAGTGTTTCC
AGTTAAAAACCGCTGAAACTTTTGAAAGTATACTGTGTTAAAAGTTTGTTTGATTTTGGT
GACTTAAGGGCCCTTGCTGTTAGTTTTCAGGAGCGTATTCAGGGGGTGTTAAAGGGGGTC
TAGTCTCCCCTTTTTATGAAAAATAAGACATGAAGTAAACAAGCTTCATTACCTGCACAT
TTGGTTTTTGTTGATGTGTAAAAAATTGTTCCAAAATAGATTTGTACCCCCCCCCCCTTT
GTAAATCCCCTAGTAAGCCCCTGGTTATTATGTATTATTATTGCCTTATACATGTGTCTA
TGTGGGTGAGCTGCTTAATTGGTACAAGTTATGTTGTTACTGAGCTTTAGGTTTATTCTG
CCTTTGCTTTTATTTGGCAATTTACATAATTGACCCAACAAAATTTAATTTACCTATTTC
AACTCATTTGTCTGCTTTTTTAAACACCAGCAAAATTATGTTTTCTACTGCTTGTCTGTG
TAACATAATGCACATGTATGCCCAAAAGTGAACATATATACCCAACTATTACTCTGCCAT
ATACTTTATTGTGTTATTCAAAATTGAAACTGAATTCGCTATATACCTTTGTTATTTCGA
GACTTGTTTAAAAGTGCTTGCCTTAAATGTTAAAACAACTCTATTGCTCTGTAAATCTAT
TTTCCCATAACAAAACACATCGTGAAATCATAATTGCCCTATAGTGACATCAAAAAATGA
TTTTTTAAAGAGCAAGTATAATTCTGTCAAAATTCGAAACTTTTTTTGCAAGCACAGTAA
TTATTGAAATGCACTGCAGTGTAAAAACTATGCTATGTTTGTATCACAATTCCCTGCGTT
TGTACCATGACTGGGTGACATACCTGGATGCTGTGTTAAACTGTACACGTATTCAAGCAA
TGGAGTAATGTACAGTCACACTATATATATGTGTGTTGTTGTTTCAG

InterProScan

PANTHER	UCK-1 (IPR029920) - T[8-245] 8.1E-107
SUPERFAMILY	P-loop_NTPase (IPR027417) - T[12-218] 2.14E-47
TIGRFAM	Uridine_kinase-like (IPR000764) - T[15-226] 3.8E-66
Pfam	PRK/URK (IPR006083) - T[18-213] 1.6E-48
CDD	Uridine_kinase-like (IPR000764) - T[18-225] 9.69747E-106

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value
UCKL1_HUMAN	44.811 %	205	1.91E-62
UCK2_HUMAN	61.803 %	303	4.63E-104
UCK1_HUMAN	61.702 %	301	4.76E-103