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  1. Transcript 'KH2012:KH.C2.216.v1....'
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  5. Transcript 'KH2012:KH.C14.118.v1...'

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C14.118.v1.A.nonSL2-1

Possible name(s)

GPM6A; GPM6B; PLP1

Location

KhC14 [1,333,351 / 1,340,209]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 380

>KH.C14.118.v1.A.nonSL2-1
PATTVATTPKRKKVRYRDAGCCDGCVNCLITIGTMPFATAFAVLLCWLGTAMFIGGGWSA
LDGTMNLWAQFGPMAGNPYNHPPPQYLYTGNALTPQFINLNRDDLGNRVPAVFQAIKYSF
YGLIPFMFVFTIMLACDNRHSSRAMASKKRSCKSSSSGICLTAALIGVTYILILAWVFFL
AFTTLGVYYYRISMLRCSDLQEREFSTGVLKDVCIDLVQLGVMMFKNTQDNGFGKLCGPG
DSMQSYGKLEGYCQNYYVVYQYMLVAFSGCLLNIIAMINFIMILTINYNDLARKRAAPTR
STASAAPSQASTTPIVARSVRSIPNTSVGPPPYVVSNRDYDRERRSSKDIELDYMLDSAS
SYERPREEDSHMGVNYYYRR

Nucleotide sequence

Length: 2,834

>KH2012:KH.C14.118.v1.A.nonSL2-1
ACCCAGCAACTACAGTTGCTACAACCCCGAAAAGGAAAAAAGTTCGATACAGAGATGCAG
GTTGCTGTGATGGATGTGTGAATTGTTTGATCACGATTGGAACAATGCCGTTTGCAACAG
CGTTTGCTGTCTTGCTCTGCTGGCTAGGAACAGCCATGTTTATAGGTGGTGGTTGGTCTG
CTCTGGATGGTACAATGAATTTGTGGGCACAATTTGGGCCAATGGCTGGCAATCCATACA
ATCACCCACCACCACAATACCTATACACTGGTAATGCACTAACACCACAGTTCATCAACT
TAAACAGAGATGATTTAGGAAACAGAGTACCTGCTGTTTTCCAAGCGATCAAGTATTCGT
TTTACGGATTAATTCCATTCATGTTTGTGTTTACGATTATGTTAGCATGTGACAATCGTC
ATTCGTCTCGTGCCATGGCTTCTAAGAAACGAAGTTGTAAATCATCAAGCTCAGGCATCT
GTCTCACCGCTGCGCTCATAGGTGTCACATACATCCTCATACTGGCTTGGGTATTTTTCC
TTGCGTTCACAACGCTTGGTGTCTACTATTATCGGATATCTATGCTTAGATGTTCTGATT
TGCAAGAGCGAGAATTCAGCACTGGTGTTTTAAAAGATGTTTGCATTGACCTTGTACAGT
TAGGCGTCATGATGTTCAAAAACACACAAGACAATGGATTTGGGAAACTATGTGGACCTG
GTGATAGCATGCAGAGTTATGGGAAACTGGAGGGCTACTGTCAGAATTACTACGTGGTGT
ACCAGTACATGCTTGTGGCTTTTAGTGGGTGCTTGCTTAACATTATCGCAATGATCAACT
TTATAATGATTCTTACTATTAACTACAACGATCTTGCCCGCAAACGAGCGGCCCCAACGA
GATCTACGGCCTCTGCTGCTCCAAGCCAAGCCTCGACGACGCCCATAGTAGCACGCTCTG
TACGTAGCATACCCAACACCAGTGTAGGGCCCCCGCCTTACGTGGTAAGCAATCGAGACT
ATGACAGAGAACGGCGCTCGTCTAAAGACATAGAGTTAGATTACATGTTAGATTCTGCAA
GCAGTTATGAAAGGCCTCGTGAAGAAGATAGCCACATGGGTGTAAATTATTACTACAGAC
GCTAAGGTTTGGTTTATAAACTTTATATGTTACATAAACAAAACTCAAGAAGTATATTTG
TAAAAATACTTCGAAAAAGTCGAATTTTTGTGTCTTTATGAAAAAAAACTCTTTTTAATC
TGCTAAAATGAAATGTTTATGGTGTTTTTAACAAAAAAAATACTTTTTTTGTATTTGCTT
ACTTTTTACTGCATATGCTACAAAACGTAAACAAACAACATTTGAAGAATAATAAACCCT
TATCCTCACGACTCCCGTGGAACGTTGTTATTTCTTTAATAAACAATCCGGTTTTTGGAT
ATTATGTGCTAAAGGCGTCCCGTCTTTCCCCACACTAATATATATATATATATTGATATG
TTGTATGTATACACACATGCTAATGAAACATCATGTTTTACTGACCAGTTGGTTATGTTT
TACACAATCAGATATCATACATTGCTCGTTATACTATACAGTTACCATTACATATGTATT
TGCCTGGTCGCAAACGGATAAATAGTTTTTGTCCTTTTTATATAGTAGATGGGGCATGAT
GGGACATGTTTTTACTCATTGTCGTCCCATTTGGTTGTCAACAAGTTATATTTACAGAAT
CATAAAACCGAAGCCTCTTTTTTTAAAAATGCGTTGTTATTTGTTTAAAACACGGTCAGA
AAATATGGGTTTTAGGTGCTAACAGTATCCCATCTTACCCCACAATACTATATGTACAGT
GCTGTTGCGTGAAACTTAGTTTTATTCTAGTAAAATGAGAGCTGTCGTATCGTGTTGTCT
TAACGTATCAAAAATAACCCTGTATGTACTAACAGTGAGAAAAAGCTGAGTTCTTGATAC
GCTAAAAAATCATCTTTCTATAAACGTCCCACTTTTTGCAAATGACTTGTAAATGCTATT
TGACCATATACCAGTTTCTTTTTATGTCACGGTTAAATTGTTCTGTTACAAAAATATACC
TTATATCCATAGATGTTTAACGTAATTTTGACAATTTCGCGTAAAAAAACGTTTTTGAAC
TAATGAAAATCGAACAAAATTTTTAAATAAATTTTTAATTTAGGTCATTTTTGCTTTTTA
AACTGCAAATTTTAACTGCAACTAACATTTAACTTTAAAACATTACCCACTTTTGACTGT
TTCAAAGCCCGTAACTGTCTGTCCATTCACTCCAGTATTACAGCTACATAAACAAATTTC
TTGTTTTCTCGACGGTGCCTTTTTATATTTTGCATATTGTAATGTTTTATTCTTACACAC
ATGTTTGTACAGCATTGTGCTAATGTCATATTGTACCATCTTCCCCCATTCAAGTAGGTT
GGGGTAAGATGGTCCATGTTTTCATTCTGATTTATTGCAATATTTACAGAATTTTATAAC
AAAATTTTCACGACTTTAAAAGAGTCGTTAACCGTTAAAATTACAATATATGTATATGTT
GTGTGGTAATGGTATCCCATCTTACCCCACAGTACTATACCCTTAAAAAATCCAAACAAT
CTACAAGAATTTACTCTTTTTCTGGTAACGTATAATTTTATAATATCTATAAATATATTG
CATACCGTAATTGCATCGTTGTTTTGGTACCAAATGTTTATCCTTGTATTTACCTGCTTT
TTTATTCTAAATATTACAGCGTCTCCCTATGGTAGCTGTAGAATTAGTGACCAATAAAAC
GTGTGAGTTGCAAA

InterProScan

PANTHER
Myelin_PLP (IPR001614) - T[15-295] 7.4E-53
Pfam
Myelin_PLP (IPR001614) - T[21-70] 7.1E-7 - T[111-291] 3.4E-26
PRINTS
Myelin_PLP (IPR001614) - T[27-56] 2.2E-7 - T[165-191] 2.2E-7

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
GPM6B_HUMAN 26.087 % 97.1 3.96E-23